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3'UTR克隆/miRNA靶基因预测与检测

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  • 2025年11月21日
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      汉恒生物

    miRNA靶基因预测与检测

    简介

    miRNAs与靶基因的3’UTR结合后,一般功能主要表现为抑制mRNA的翻译,为了检测其效果,我们可以用Western Blot的方法检测靶蛋白的表达水平,也可以用qRT-PCR进行检测靶标基因的表达。但是这两种方式都不能有效地说明是miRNAs直接起作用的结果。因此为了检测miRNA靶标的有效性,构建Sensor reporter并进行活性检测,才是对miRNAs与靶基因3’UTR的关系作出准确判断的方法。

    服务优势

    (1)采用Promega公司特有psiCHECK质粒;

    (2)所采用的Luciferase双荧光报告系统,可以获得宽泛的线性定量范围与极高的灵敏度;

    (3)采用瞬时转染技术,操作简便、快速,周期短,适用于绝大多数细胞类型。

    服务流程

    (1)PCR扩增靶基因的3’UTR,或直接合成结合位点序列;

    (2)将上述确定的靶基因DNA片段克隆至报告基因载体psiCHECK质粒;

    (3)克隆miRNA表达载体;

    (4)将报告载体与miRNA表达载体共转染293T细胞;

    (5)多功能酶标仪检测报告基因的表达水平;

    (6)数据分析,整理提交客户原始数据及项目报告;

    注:为了实验的严谨性,可加入靶标基因3’UTRmicroRNA预测结合区域的突变体作为对照,进一步说明问题。

    附:psiCHECK质粒图谱

    产品细节图片1

    汉恒生物实例:

    汉恒生物通过合成mimics,构建可能靶基因的3’UTR报告基因系统成功验证miRNA与靶基因的关系。

    产品细节图片2

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    相关实验
    • miRNA的靶基因的寻找与鉴定

      信息学的方式进行,主要是根据以下几个方面进行预测:①miRNA基因结合位点的互补性;②miRNA靶位点在不同物种之间的保守性;③miRNA-mRNA结合的热稳定性;④miRNA靶位点处不应有复杂二级结构;⑤miRNA5′端与靶基因的结合能力强于3′端。除以上几个基本原则外,不同的预测方法还会根据各自总结的规律对算法进行不同的限制与优化。目前比较常用的靶基因预测软件有:miRanda、TargetScan、PicTar、miRWalk、miRanda、miRDB等,其中在miRWalk中可以查找到已经

    • 非编码RNA研究及实验

      miRNA靶基因预测miRNA通过碱基互补配对的方式识别靶基因的3’UTR区,并根据互补程度的不同指导沉默复合体降解mRNA或者阻遏mRNA的翻译。因此,可以将目的基因的3’UTR区域构建到含luciferase的报告基因上,通过比较miRNA过表达或inhibitor 与报告基因作用检测荧光值的变化,判断miRNA对靶基因的作用。再通过对3’UTR区进行定点突变的方法进一步确定miRNA与靶基因3’UTR的作用位点。 miRNA常用数据库: · miRbase(http://www

    • microRNA实验方法小结

      与优化。为了得到更为可靠的靶基因预测,通常综合多个预测方法,取其共同预测的基因作为研究重点。目前常用的预测方法主要是以下三种: miRanda. miRanda 是最早的一个利用生物信息学对miRNA靶基因进行预测的软件, 由Enright等人于2003年设计开发. 作为最早的miRNA靶基因预测软件, miRanda对3-UTR的筛选依据主要是从序列匹配、miRNA与mRNA双链的热稳定性以及靶位点的保守性三个方面进行分析。基于以上三个方 面,miRanda选取每条miRNA相对

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