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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称:
lncRNAPCR芯片
- 提供商:
QIAGEN
癌信号通路发现者lncRNA PCR芯片 LAHS-001Z
LncRNA PCR芯片可以用于检测在癌组织与正常组织有差异表达的84个lncRNA表达情况。这些lncRNA选自于文献报到的与各种肿瘤诊断、发生、转移、预后相关的lncRNA。另外还有lncRNA是通过生物学预测可能与肿瘤相关的microRNA有作用的、或者在基因组中与重要的原癌基因、抑癌基因邻近的lncRNA.
Functional Gene Grouping
Oncogenes: ACTA2-AS1, AFAP1-AS1, BANCR, BCAR4, BLACAT1, CBR3-AS1, CCAT1, CCAT2, CRNDE, H19, HAND2-AS1, HEIH, HIF1A-AS2, HNF1A-AS1, HOTAIR, HOTTIP, HOXA-AS2, HULC, JADRR, KCNQ1OT1, LINC00152, LINC00963, LSINCT5, LUCAT1, MALAT1, MIR155HG, MIR17HG, PCA3, PCAT1, PCGEM1, POU5F1P5, PRNCR1, PVT1, SNHG16, SPRY4-IT1, SUMO1P3, TERC, TRERNA1, TUG1, UCA1, XIST.
Tumor Suppressor Genes: ADAMTS9-AS2, CAHM, DLEU2, DLX6-AS1, GACAT1, GAS5, GAS6-AS1, GNAS-AS1, LINC00261, LINC00312, MEG3, MIR31HG, MIR7-3HG, NAMA, NEAT1, PTCSC1, PTCSC3, PTENP1, TERC, TUSC7, WT1-AS, ZFAS1.
Cancers:
Bladder Cancer: BLACAT1, H19, MALAT1, MEG3, SNHG16, TERC, TUG1, UCA1.
Breast Cancer: BCAR4, GAS5, H19, HIF1A-AS2, HOTAIR, JADRR, LSINCT5, MIR31HG, MRPL23-AS1, TRERNA1, UCA1, XIST, ZFAS1.
Cervical Cancer: MEG3.
Colorectal Cancer: CCAT1, CCAT2, CRNDE, H19, HOTAIR, MALAT1, PCAT1, PVT1, SNHG16, TUSC7.
Endometrial Cancer: H19, HOTAIR.
Esophageal Squamous Cell Carcinoma: CBR3-AS1, HOTAIR.
Gallbladder Cancer: MALAT1.
Gastric Cancer: CCAT1, CDKN2B-AS1, GACAT1, H19, HOTAIR, HULC, LINC00152, LINC00261, LINC00312, MEG3, PVT1, SUMO1P3, TERC.
Glioma: H19, HOTAIR, MEG3.
Kidney Cancer: AFAP1-AS1, DGCR5, HIF1A-AS2, WT1-AS.
Laryngeal Squamous Cell Carcinoma: HOTAIR, MALAT1.
Leukemia: DLEU2, GAS5, H19, HOTAIR, HOXA-AS2, MALAT1, MEG3, TERC, TUG1, XIST.
Liver Cancer: H19, HEIH, HOTAIR, HOTTIP, HULC, KCNQ1OT1, MALAT1, MEG3, MIR7-3HG, PANDAR.
Non-Small Cell Lung Cancer: BANCR, CCAT2, GAS6-AS1, HOTAIR, MALAT1, MEG3.
Other Lung Cancers: ACTA2-AS1, LUCAT1.
Melanoma: BANCR, HOTAIR, PTENP1.
Multiple Myeloma: MEG3, PVT1.
Nasopharyngeal Carcinoma: HOTAIR, LINC00312.
Neuroblastoma: HAND2-AS1, SNHG16.
Oesophageal Squamous Cell Carcinoma: LINC01234.
Osteosarcoma: TUG1.
Ovarian Cancer: H19, HOTAIR, LSINCT5, WT1-AS, XIST.
Pancreatic Cancer: GAS5, HOTAIR, PVT1.
Pituitary Cancer: MEG3.
Prostate Cancer: CBR3-AS1, GAS5, HOTAIR, LINC00963, MALAT1, PCA3, PCAT1, PCGEM1, PRNCR1, PVT1, TERC, XIST.
Rhabdomyosarcoma: RMST.
Sporadic Pediatric Adrenocortical Tumors: KCNQ1OT1.
Testicular Cancer: XIST.
Thyroid Cancer: NAMA, PTCSC3.
Other Cancer-Related lncRNAs: AIRN, EMX2OS, FTX, HIF1A-AS1, HOTAIRM1, HOXA11-AS, IPW, KRASP1, LINC00538, LINC00887, LINC01233, NBR2, NRON, RMRP, RPS6KA2-AS1, TSIX.
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文献和实验), 4个mRNA(k-core=11 and degrees≥28),位于中心位置的是lncRNA-LALR1 案例(四)lncRNA 功能研究 研究者对位于HOXA基因簇的5‘端启动子区域的非编码RNA HOTTIP进行了功能研究,研究证明HOTTIP可以增强HOXA的转录;对HOTTIP体内外的干扰研究发现HOTTIP在发育过程中起到重要作用,例如影响鸡远端骨的形成。 1. RT-PCR和FISH结果验证lncRNA HOTTIP的表达具有组织中特异性
于发现与特定生物学过程相关的lncRNA和寻找与疾病相关的lncRNA。 服务项目(列表): ·lncRNA PCR Array Human Cancer 人/肿瘤 ·lncRNA PCR Array Human Cancer Pathway 人/信号通路 ·lncRNA PCR Array Human Cell Development & Differentiation 人/细胞发育和分化 ·lncRNA PCR Array Human Inflammatory Response
,可以检测PCR体系中是否存在DNA污染,或者是否有影响反转录或PCR实验步骤的因素存在。 图一 PCR芯片实验流程 PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片,含有基因特异性引物,可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外,芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的,研究者可以用它来研究自己感兴趣的一组基因,一个生物学通路或者某种疾病状态。PCR芯片所研究










