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VAST BioImager™ Platform
斑马鱼幼体高通量图像采集自动操作系统
专为模式生物研究而设计
VAST BioImager系统是专门为需要采集大量2-7天斑马鱼幼体图像的研究者设计的。
该系统是在美国麻省理工学院Yanik实验室开发的技术的基础上发展而来。
VAST bioImager在采集图像之前自动完成斑马鱼幼体装载、定位、旋转等操作,避免了在进行高通量图像采集时对每条斑马鱼幼体人工操作的时间损耗和冗长的步骤。
同时它也是一个组装式和可拓展的平台,能安装在多种直立复式显微镜或者立体显微镜上进行高分辨率细胞水平上的图像采集。
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基础型,斑马鱼全身器官水平成像 ·斑马鱼研究的有力工具 ·自动处理图像采集前斑马鱼幼体的各种操作 ·避免人工操作的时间损耗和冗长的步骤 ·在软件上点击“Load one Fish”,VAST就会 装载好一个斑马鱼幼体 ·系统可将斑马鱼幼体进行360°旋转进行定 位操作者可根据自己的意愿选择方向,侧 面、背面或者其他方向进行图像采集 |
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进阶型,高分辨率细胞水平成像 ·适用于高通量&高内涵筛选 ·可安装在多种直立复式显微镜或者立体显微镜上 ·可安装在荧光显微镜上进行荧光图像采集 ·可选配的LP采样器,直接从多孔板中传送斑马鱼幼体到VAST进行图像采集 |
| 发表文章 | |
· High-throughput hyperdimensional vertebrate phenotyping. Carlos Pardo-Martin, et.al., Nature Communications, Volume:4, Article number:1467, DOI:doi:10.1038/ncomms2475 · Presenting VAST BioImager™: A new modular,expandable platform to automate the orientation of 2-7 day old zebrafish larvae for imaging. Union Biometrica, Geel, Belgium, Union Biometrica, Holliston, MA, USA Yanik lab, MIT, Boston, MA, USA · Fully automated cellular-resolution vertebrate screening platform with parallel animal processing. Chang TY, Pardo-Martin C, Allalou A, Wählby C, Yanik MF.,Lab Chip. 2012 Feb 21;12(4):711-6. doi: 10.1039/c1lc20849g. · High-throughput in vivo vertebrate screening. Pardo-Martin C, Chang TY, Koo BK, Gilleland CL, Wasserman SC, Yanik MF.,Nat Methods. 2010 Aug;7(8):634-6. doi: 10.1038/nmeth.1481. |
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文献和实验所无法比拟的。 即使对于那些目前还不能进行自动化分析的项目,例如在体内或体外试验中分析大量细胞中的基因表达水平,如果能够进行自动化分析,也将大大提高检测的效率和定量分析的准确度。 自动图像采集技术需要一系列相关技术协同作用才能成功。例如,需要使用合适的算法、需要选择合适的结果分析方式等等。虽然这些技术正在逐渐被大家所了解和使用,但目前还只是刚刚开始,还不成熟,还需要进一步的改进,才能满足更多科研人员的实际需要。对于自动图像采集技术的新老用户来说,在使用的时候都要小心仔细地进行操作和分析,不过相比
。NCode™ Multi-Species miRNA芯片 V2则靶定了9.0版miRBase数据库中人、小鼠、大鼠、果蝇、线虫和斑马鱼的所有成熟miRNA。NCode芯片早在2005年推出,当时可谓是引领潮流,不过现在看来有些落后了,至少从内容上看是如此,有待更新哈。 不过,Life Technologies还有另一套秘密武器:TaqMan miRNA assay和TaqMan miRNA array,后者也适合高通量分析。对于小规模的图谱分析,研究人员十有八九是采用TaqMan miRNA
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