
Illumina光纤微珠牛全基因组SNP分型芯片
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- illumina SNP 全基因组
- 上海
- 2025年07月08日
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Illumina光纤微珠牛全基因组SNP分型芯片
- 提供商:
上海博星
- 规格:
P4903-1G
牛全基因组分型芯片(BovineHD Genotyping BeadChip)
该芯片是覆盖最广泛的全基因组分型芯片,能够分析不同牛以及奶牛的遗传变异,该芯片是illumina公司与世界顶尖的研究牛的来自于,美国农业部农业研究局(USDA-ARS),辉瑞制药动物遗传中心(Pfizer Animal Genetics)以及密苏里大学(University of Missouri)等在内的科学家合作开发出来的。该芯片包含了覆盖牛全基因组的770000个SNP位点。能够广泛地运用于牛的全基因组筛选,数量遗传性状的鉴别,评判遗传优势和牛的生物多样性。这个8-样本的芯片,运用Infinium HD Assay,将为牛的全基因组研究提供强有力的解决方案。
SNP位点数 777962
每张芯片检测样本数 8
DNA用量 200ng
分型方法 Infinium HD Assay
扫描仪 iScan, HiScanSQ
判读率 >99%
重复性 >99.9%
孟德尔遗传不一致性 <0.1%
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文献和实验探针外,还有90多万个用于拷贝数变化(CNV)检测的探针,可使全基因组平均分辨率达3 kb,既可用于全基因组SNP分析,又可用于CNV分析,真正实现了一种芯片两种用途,方便研究者挖掘基因组序列变异信息。通过基因分型信息还可以鉴别中性拷贝数的杂合性缺失(copy neutral LOH)、单亲二体病(UPD)及嵌合现象(可以精确检测到20% 嵌合体)。近来Affymetrix 公司又陆续发布了多款针对东亚、中国、欧洲、非洲等不同人群的SNP基因分型芯片,采用GeneTitan平台进行高通量检测,极大
随着SNP芯片的进一步完善和成本的降低,将是未来疾病相关基因研究的主流技术。 全基因组扫描用的成套微卫星引物,可多达上千个。引物的5’末端标记在激光激发下可发出不同颜色光的荧光素标记,如此可进行多重PCR,加速实验的进程。每一样本的PCR产物长度大小可以通过ABI或MegaBACE等测序仪进行检测。通过收集每一个个体的相关信息,经软件分析后即可得到结果。而采用Affymetrix公司的全基因组高密度的SNP芯片,操作更为简单。每个个体的DNA经酶切、PCR扩增、荧光标记、杂交扫描后即可得到每个
DNA Analyzer)的Applied BioSystem(ABI)这家一直占据着测序市场最大份额的公司的领先地位就开始动摇了,因为他们的拳头产品毛细管阵列电泳测序仪系列(series capillary array electrophoresis sequencing machines)遇到了两个强有力的竞争对手,一个就是罗氏公司(Roche)的454 测序仪(Roche GS FLX sequencer),另一个就是2006年美国Illumina公司推出的Solexa基因组分析平台
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