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Genespring软件相关分
Genespring软件相关分析
上海博星
P4957-50ML
统计分析
l 方差分析(ANOVA)
l 多重检验校正
l FDR预测
l Tukey和S-N-K多重检验
基因表达模式分析
l 聚类分析(Hierarchical, k-means, SOM,PCS-based)
l 基因共表达分析(QT clustering)
l 主成份分析 (PCA)
生物学功能分析
l GO分析
l Pathway分析
l 基因集合富集度分析(GSA, GSEA)
l Ingenuity通路分析(IPA)
疾病临床结果预测
l Naive-Bayesian分类法
l 最邻近分类法(k-nearest neighbors)
l 支持向量机(Support Vector Machines)
l 神经网络分类
l 决策树分析
其结果可以多种格式提供:
二维、三维散点图、维恩图、火山图(volcano plots)、箱型图(box plots)、2D 树像图 (2D dendrograms)、染色体位置图、基因代谢调控图等。
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