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- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20℃,常温
- 保质期:
5831个月
- 英文名:
MiaoLingBio
- 库存:
1000
- 供应商:
淼灵生物
- 规格:
1μg
pCR4-TOPO-GATD1-3(2 同义突变 1 点突变)(human)载体/pCR4-TOPO-GATD1-3(2 同义突变 1 点突变)(human)质粒图谱/pCR4-TOPO-GATD1-3(2 同义突变 1 点突变)(human)质粒序列
【产品简介】
产品货号:P22689
质粒名称:pCR4-TOPO-GATD1-3(2 同义突变 1 点突变)(human)
质粒别称:NM_001318818.2(2 同义突变 1 点突变); "PDDC1"
拷贝数:高
质粒长:1134bp
质粒宿主大肠杆菌
质粒用途:基因模板
片段类型:cDNA
片段种属:人
原核抗性:Amp
筛选标记:
荧光蛋白:
蛋白标签:
启动子:
复制子:pUC
感受态:DH5a
培养温度:37 度
正向引物:M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT
反向引物:M13R:CAGGAAACAGCTATGACC
诱导方式:
空载名称:
【干粉质粒操作说明】
一、操作方法
1、收到干粉质粒后请先 5000rpm 离心 1min,再加入 20ul 无菌水溶解质粒;
2、将相应的感受态于冰盒上解冻,取 5ul 质粒加至 100ul 感受态中,冰浴 30min;
3、42 度热激 60s,冰浴 2min,加入 900ul 无抗 LB 培养基,180rpm 震荡培养 45min;
4、6000rpm 离心 3min,留 100ul 上清重悬,再涂至对应抗性的 LB 平板上;
5、倒置培养过夜后,如菌落过多则稀释质粒转化,如没有菌落则取 10uI 质粒转化
6、挑单菌落至对应抗性的 LB 液体培养基中过夜震荡培养,根据需要提取质粒。
7、保存条件:-20℃ 保质期:90 天
二、注意事项
1、种子质粒:本产品为种子质粒,直接转染效率极低,必须转化扩增后使用。
2、菌落数量控制:平板菌落数以 10~300 个为佳,过多或过少均可能影响后续单克隆筛选。
3、测序验证:提取质粒后,建议进行测序验证(至少一个反应),确保序列正确。
4、转化条件:转化前请核对质粒的抗性和感受态类型,严格按照感受态说明书操作。
5、剩余质粒:溶解后的干粉质粒需-20℃保存,但反复冻融会降低转化效率,建议分装后冻存。
【质粒 DNA 转化】
一、操作步骤:
1. 从-80℃冰箱中取出对应的感受态细胞,室温下置于冰盒上解冻,标记;
2. 向感受态细胞中加入 2µl 的质粒,置于 4℃冰箱中,冰浴 30min;
3. 在 42℃水浴锅中热激 1min,然后立即在冰盒上放置 2min;
4. 每管加 900µl LB 培养基,37℃摇床震荡,150rpm×45min;
5. 取 100µl 转化液加入对应抗性的平板中,倒入适量玻璃珠,涂匀液体;
6. 将平板倒置于 37℃恒温培养箱中培养过夜。
二、注意事项:
1. 感受态可用灭菌的离心管分装使用。
2. 根据需要在第 5 步骤时将转化液 6000rpm 离心 3min,然后只留下 100µl 左右的上清液,混匀沉淀,全部加入相对应的平板中。
3. 转化过程在超净工作台中进行。
4.质控标准:不要长太小 太密或培养时间过长,菌体大小适中 对着光看饱满透亮,平板不要长太多卫星菌落。
【质粒 DNA 提取】
一、实验原理:
碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒 DNA 与线性染色体 DNA 在拓扑学上的差异来分离它们。在 pH 值介于 12.0 ~12.5 这个狭窄的范围内,线性的 DNA 双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒 DNA 的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。当加入 pH 4.8 的乙酸钾高盐缓冲液恢复 pH 至中性时,共价闭合环状的质粒 DNA 的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体 DNA 的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体 DNA 与不稳定的大分子 RNA ,蛋白质-SDS 复合物等一起沉淀下来而被除去。
二、操作步骤:
1. 准备 20ml 灭菌过的培养管,编号,分别加入 8ml LB 培养基,再加入 8µl 相应抗生素,可适量多加;
2. 用 10µl 白色枪头挑取挑取单个菌落至培养管中,37℃震荡过夜(274rpm);
3. 取 2ml 过夜培养的菌液加入离心管中,室温 10000rpm 离心 2min,去上清;(可重复步骤 2,直至菌液离心完)(去上清时用纸吸一下)
4. 向留有菌体沉淀的离心管中加入 250µl Buffer P1(含 RNase A),使用移液枪充分混匀,悬浮菌体菌体;
5. 向离心管中加入 250µl Buffer P2,温和地上下颠倒混匀 4~6 次,获得澄清的裂解液;(剧烈混合会使剪切染色体 DNA,降低质粒纯度)
6. 向离心管中加入 350µl Buffer N3, 立即温和地上下颠倒混匀 4~6 次,此时出现白色絮状沉淀。室温 10000rpm 离心 15min;
7. 小心将步骤 6 中所得的上清液转移至洁净的吸收柱中。要保证没有吸入沉淀和细胞碎片。室温 10000rpm 离心 1min,至裂解物完全通过吸收柱,倒掉收集管中的废液;
8. 向吸附柱中加 150µl Buffer PB,10000rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液;
9. 向吸附柱中加 400µl Buffer PW(检查是否加入无水乙醇),10000rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液。再空离一次,2min(此时可以加热 Buffer EB,65~70℃);
10. 将吸附柱置于一个新的离心管中,打开盖子,吹风 4min 左右(确保乙醇被去除,乙醇会影响下面的步骤);
11. 向吸附柱的吸附膜中间部位加 90µl Buffer EB(pET 系列拷贝数低,加 EB 70μl 即可),室温静置 2min。10000rpm 离心 1min;
12. 把液体倒回吸附柱,在 10000rpm 离心 1min;
13. 混合质粒至一个离心管中,做好标记,开盖室温放置两小时左右。-40℃保存质粒。
三、注意事项:
1.使用之前,把试剂盒中的一小管 RNA 酶加入 Buffer P1, 4℃保存。
2.Buffer EB 在 65~70℃水浴预热,可以增加提取效率。
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文献和实验:我们首先要分析出现碱基不匹配的位置是不是重要的位置,如果不是很重要,大可不必管它,比如说是三联密码子的最后一位,碱基的改变并没有引起相应氨基酸的改变,那么一般情况下也可以不去理它。另外,在NCBI上人类的基因的版本一直在变化,也就是说同一个基因有不同的版本,或者称不同的亚型,其碱基序列有些许的差异,只要自己克隆出来的碱基序列与其中一个相匹配,一般也就可以不做定点突变了。如果有时间没钱,那干脆重新PCR然后再克隆进自己的载体了,不过最好换个保真性好一点的酶如PFU,或者PCR循环数低一点,不过这些东西
,相信这也是那些研究基因的人经常的一种思路吧。 对于第一种情况:我们首先要分析出现碱基不匹配的位置是不是重要的位置,如果不是很重要,大可不必管它,比如说是三联密码子的最后一位,碱基的改变并没有引起相应氨基酸的改变,那么一般情况下也可以不去理它。另外,在NCBI上人类的基因的版本一直在变化,也就是说同一个基因有不同的版本,或者称不同的亚型,其碱基序列有些许的差异,只要自己克隆出来的碱基序列与其中一个相匹配,一般也就可以不做定点突变了。如果有时间没钱,那干脆重新PCR然后再克隆进自己的载体
【求助】怎样在蓝藻(蓝细菌)中做定点突变(Site-Directed Mutagenesis
是大家经常会遇到的问题。基因好不容易吊出来,并装进了自己的载体,却发现有一两个碱基跟自己的预期序列或所有的公共数据库不匹配,然后暴昏。 大家实验室里面还是用Taq酶为主吧,Pfu这样的高保真酶大家应该用得不多吧,Taq酶的优点和缺点都很明显:优点就是扩增效能强,缺点就是保真性差,其错配机率是比较高的,相关数字忘了,大家可以去网上查那个数字,不过感觉如果是2000bp的基因,如果扩四五十个循环的话,很大机率会出现点突变,当然这也跟具体PCR体系里的Buffer有很大关系,详细情况这里就不讨论
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