美国 Agena MassARRAY CPM96 核酸质谱分

美国 Agena MassARRAY CPM96 核酸质谱分析系统

 

SNP分型和DNA甲基化金标准

MassARRAY是基于飞行时间质谱仪器进行的基因检测系统平台，是基因检测领域中采用分子量进行基因检测的技术，具有高准确性的显著特点。

在科研领域中，其SNP分型和DNA甲基化均为公认的金标准技术，成为GWAS和EWAS的黄金搭档。

在临床及大健康基因检测领域中，耳聋基因检测、HPV基因检测、个体化用药基因检测、疾病易感基因检测、肿瘤液体活检等均有广泛的应用，成为精准医学重要的技术平台之一。

 

药物基因组学：相关、靶向药物基因组学分析，不会产生意外成本或浪费

无论您是刚刚起步，还是已经拥有了成熟的项目，Agena的药物基因组学解决方案都能在保证准确性的同时很大程度地降低成本。基因分型和拷贝数检测的同时进行使实验室能够实施单一、全面的药物基因组学工作流程。

 

很大程度地提高效率并削减成本

避免可能导致药物基因组学测试成本提高并使实验室效率降低的常见缺陷。Agena提供的药物基因组学检测费用低廉，额外花费极少。无重复样本。无试剂浪费。单次测定拷贝数检测可与基因分型同时进行。

 

灵活的试剂盒内容

开始定制检测一点都不困难。使用您所需的内容快速定制检测并开始使用。我们以按需订购的方式提供预先设计的基因分型和拷贝数试剂盒。如需定制试剂盒，您可以轻松创建自己的检测或与我们的定制设计团队合作。

 

突变分析：用于对体细胞变异进行快速而低成本的靶向检测

精准肿瘤学研究需要快速且低成本的体细胞变异检测。由于样品数量有限且质量差，对低丰度体细胞突变进行可靠检测可能存在一定的挑战。某些技术需要肿瘤含量较高的样本，并且通常会由于低肿瘤比例和DNA产量而拒绝多达20%的样本。

使用MassARRAY®系统的单日工作流程和多元化学方法，您可以低成本快速获得变异信息。iPLEX® HS化学试剂可从低样品输入中检测出相关变异。

 

灵活的试剂盒内容

踏上研究之旅并推进发现并不困难。使用我们预先设计的研究试剂盒，检测包括SNP、插入、缺失、易位和甲基化分析在内的各种生物标志物。或者，与我们经验丰富的Assays by Agena团队合作，设计您自己的独特试剂盒。

 

液体活检：cfDNA样本的灵敏度和覆盖范围

液体活检研究对灵敏度有着高要求。MassARRAY®系统能够以较低的成本检测等位基因频率低至0.1%的变异，非常适合用于检测低丰度突变。

尽管液体活检提供了便利的对肿瘤细胞和DNA的检测方式，然而它并不总能满足全部要求。由于每毫升血浆中仅有少量的循环肿瘤DNA（ctDNA）拷贝，无法提供足够样本进行多项测试以检测所有新兴的耐药性标记。UltraSEEK®化学试剂的多重反应能力使其能够使用来自单次抽血的cfDNA轻松检测超过100种变异，包括插入和缺失。

 

技术原理

SNP分型原理：系统主要是利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 进行分析，即PCR扩增产物或者预处理样本在延伸单碱基后，将制备的样品分析物与芯片基质共结晶，将该晶体放入质谱仪的真空管，而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发，由于基质分子经辐射所吸收的能量，导致能量蓄积并迅速产热，从而使基质晶体升华，核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子，产生的离子多为单电荷离子，这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能，进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率得以分离，在空小管中飞行到达检测器。

候选DNA甲基化位点CpG site定量:

使用MassARRAY系统快速分析10至100个研究样本的甲基化状态。

 

MassCLEAVE化学方法可通过在亚硫酸氢盐转化的DNA上进行碱基特异性裂解，实现高分辨率的定量甲基化分析。高灵敏度的MassARRAY系统可检测甲基化和非甲基化DNA之间低至5%的差异。

 

可以使用Agena的EpiDesigner软件设计用于分析CpG甲基化的用户定制试剂盒。包括亚硫酸氢盐转化试剂盒在内的常规试剂可用于处理样本，以便在MassARRAY系统上进行分析。

 

将待测DNA经过亚硫酸盐处理，DNA中未甲基化胞嘧啶(C)转变为尿嘧啶(U)，而甲基化修饰的胞嘧啶不变；通过PCR扩增过程引入T7-启动子序列，经T7 DNA聚合酶的体外转录过程得到各样本RNA产物；经过碱基特异性酶切处理，得到RNA小片段，并用飞行质谱检测每个片段的分子量，最后 EpiTYPER程序完成数据的自动化处理并报告每个检测片段的甲基化程度。

 

高灵敏度：可发现低至5%甲基化修饰，样本起始量低至10 ng。

重复性好：CV≤5%。

高性价比：用384孔板进行 PCR 反应，一个扩增产物可以进行多重 CpG位点分析，数据无需后续验证，可直接发表结果。单片段最长可检测500bp。

 

技术优势

SNP分型优势：

1. 高通量：一张芯片可对384个样本进行多重检测，每个体系理论可最高实现60重反应，通量可根据客户要求进行个性化调整

2. 高性价比：无需荧光标记，仅需合成普通引物，大大降低成本；单个样本分析成本低

3. 适用范围广：几十到成千上万个样本，同时检测几十到成百上千个位点

4. 高灵敏度：分析所需样本量少（10ng）

高灵活度：一张芯片上样本数量和位置可随意选择；一张芯片上样本和位点检测匹配可随意选择