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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称:
单细胞WTA测序
- 提供商:
LabEx
- 规格:
96孔板
📋产品基本信息
- 服务货号:LXBWTA01-1
- 技术核心:单细胞全转录组扩增(WTA)+ 高通量测序
- 服务内容:单细胞 WTA 测序实验 + 生信分析 + 结果解读
- 适用场景:基础科研、临床研究、药物研发等领域的单细胞分子机制研究
🧪技术优势
- 捕获效率高:采用磁珠 + 寡核苷酸的偶联结构,mRNA 捕获效率≥90%,无明显偏好性
- 数据质量高:测序 Q30≥85%,基因检测灵敏度高,可检测到低丰度表达基因
- 实验效率高:全自动实验流程,一次可完成多个样本的测序,大幅缩短实验周期
- 分析能力强:配套专业的生信分析团队和先进的分析软件,可实现深度数据挖掘
📦交付内容明细
- 原始数据文件:fastq 格式测序原始数据,提供数据下载链接和硬盘备份
- 质控报告:样本质控报告、测序质控报告、数据过滤质控报告
- 分析结果文件:Excel 格式差异基因列表、图片格式可视化图谱、PDF 格式分析报告
- 辅助文件:实验流程 SOP、数据分析代码、单细胞分析软件操作指南
🌱应用前景
- 基础科研:助力绘制人类器官单细胞图谱,解析生命发育、细胞分化的分子机制
- 临床诊断:发现疾病特异性分子标志物,为疾病的早期诊断和分型提供新方法
- 个性化治疗:分析患者肿瘤细胞的分子特征,为靶向治疗、免疫治疗提供精准靶点
- 药物研发:筛选药物作用的分子靶点,评估药物的有效性和安全性,加速药物研发进程
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文献和实验单细胞测序技术(scRNA-Seq)之 NCB 高分文章解析前列腺癌相关研究
腺癌淋巴结转移样本(batch2)进行单细胞测序,同样地发现所有肿瘤样本的 T 细胞普遍高表达 KLK3。有趣的是,其中一例前列腺癌患者的 MRI 影像及术后病理均提示左右两侧髂外淋巴结为阴性,而 scRNA-Seq 细胞亚群统计显示右侧淋巴结组织中存在高表达 KLK3 的 T 细胞,提示这可能已经形成了“转移前癌巢”结构;而左侧淋巴结组织中不仅存在高表达 KLK3 的 T 细胞,还存在恶性上皮细胞,即左侧淋巴结已发生了临床无法识别的微转移灶。 除了这一发现,我们还注意到 batch2 样本采用 BD
成 cDNA 后,我们对获得的 cDNA 序列进行扩增,对转录组文库构建方式同单细胞测序实验,免疫组富集文库则需额外设计 2 次引物 binding 到 C 区,对 TCR/BCR 序列进行富集,后期对富集 cDNA 随机打断,获得不同长度的打断产物,再经 PCR 扩增后,形成免疫组文库用于上机测序。 ps:由于引物设计问题,免疫组库测序现只适用于人鼠模型的研究哦~
1+barcode+UMI+TSO的标签组成,用于单细胞的捕获识别和后续5'端RNA的抓取捕获。 如图, 凝胶珠上的序列中,barcode序列用于标记细胞,UMI序列用于标记转录本,而TSO (template switch oligo)用于5’端捕获。 当磁珠与细胞结合并在油包水环境中反转成cDNA后,我们对获得的cDNA序列进行扩增,对转录组文库构建方式同单细胞测序实验,免疫组富集文库则需额外设计2次引物binding到C区,对TCR/BCR序列进行富集,后期对富集cDNA随机打断,获得不同
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