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磷酸化 DIA 定量蛋白质组学检测
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文献和实验备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
,而已发表的文献中这两类样本都有使用。具体选什么,可以根据客户实际情况,或者参考这个疾病研究领域更多人选择哪个类型的样本进行选择。需要提醒的是,客户的一个研究,从蛋白组学检测到验证,尽量保持样本类型的一致性。 6、外泌体可以做蛋白质组学的哪些项目? 外泌体样本可以做 4D label free、DIA(DIA 2.0 和大样本 4D-DIA)和 4D 磷酸化蛋白质组学。由于外泌体抽提得到的蛋白量相对较少,除非客户特别要求且蛋白量充足,否则小样本量的时候,都建议优先推荐 4D label free
超微量外泌体蛋白质组突破用量极限和检测上限-低至200μL血浆!高达4000+ EV蛋白!
的多肽。通过该方法将外泌体裂解蛋白起始量降低至5μg,质谱前处理后采用布鲁克timsTOF平台进行direct-DIA,可稳定检出2500-3500+血浆EV蛋白!!! 微量蛋白质谱前处理样本制备方案 03 提升蛋白检出及可重复性的DIA质谱检测方案 DDA模式的lable-free定量蛋白质组学(LFQ)数据集将包含很多缺失值,影响较低丰度的蛋白质的检出。因此近年来DIA技术飞速发展与应用,其鉴定的蛋白总数多于LFQ,能鉴定到更多的低丰度蛋白,重复
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