个性化癌症免疫疗法中的HLA肽组分析策略

随着免疫治疗在癌症治疗中的广泛应用，个性化肿瘤疫苗、TCR-T和CAR-T等策略成为研究热点。然而，疗效的差异性和个体化应答的复杂性也逐渐暴露出精准免疫策略的短板。在此背景下，HLA肽组（Immunopeptidome）分析应运而生，它作为链接抗原加工与T细胞识别的关键一环，正在成为肿瘤免疫治疗中不可或缺的精准靶点发现工具。

 

一、HLA肽组：肿瘤免疫监视的“信息快递员”

1、什么是HLA肽组？

HLA肽组，亦称免疫肽组，是指通过MHC I类或II类分子呈递在细胞表面的短肽集合。这些肽段源自细胞内的蛋白降解产物，涵盖了包括癌基因突变产物（neoantigens）在内的多种抗原。通过HLA肽组的分析，我们可以真实捕捉肿瘤细胞向免疫系统传递的抗原信号。

 

2、与转录组和蛋白组数据的区别

虽然转录组和蛋白组数据可揭示潜在抗原的表达情况，但并不能预测其是否被加工并呈递。相比之下，HLA肽组分析直接识别已被MHC加载、具有实际免疫原性潜力的肽段，是真正连接抗原源与T细胞识别之间的桥梁。

 

二、HLA肽组分析的核心技术路径

1、免疫沉淀富集MHC复合物

该步骤通过特异性抗体（如W6/32）富集细胞表面的MHC分子。样本类型可涵盖细胞系、组织切片、甚至临床肿瘤组织。此步骤对实验条件要求极高，需确保MHC复合物结构稳定，避免肽段脱落。

 

2、酸洗洗脱肽段并纯化

从MHC分子中洗脱出的短肽（通常为8–12 mer）需通过固相萃取等手段进行纯化，以去除杂质和干扰物质。这一步是获得高质量质谱数据的关键前处理环节。

 

3、LC-MS/MS高分辨质谱分析

采用如Orbitrap Exploris、Q Exactive等高分辨率质谱平台，配合数据依赖采集（DDA）或数据独立采集（DIA）策略，获取HLA肽谱信息。HLA肽段的非酶切特性和低丰度特点对仪器灵敏度和分辨率提出挑战。

 

4、专属数据库搜索与肽段鉴定

常规蛋白数据库搜索策略（如SEQUEST、Mascot）难以胜任HLA肽段鉴定任务，需借助特异性算法如NetMHCpan、MS-GF+、PEAKS DB + de novo等进行识别与结合亲和力预测。

 

三、个性化癌症免疫治疗中的应用场景

1、新抗原筛选与个体化疫苗开发

HLA肽组分析可验证突变位点是否真正呈递于MHC表面，从而筛选出免疫原性强、表达可靠的新抗原。这为个体化肿瘤疫苗设计提供实证支持，提升治疗靶点的精准度。

 

2、肿瘤免疫逃逸机制解析

部分肿瘤通过MHC表达下调或抗原加工通路改变来逃避免疫监视。HLA肽组分析可揭示其表位缺失机制，助力免疫耐受/逃逸研究。

 

3、助力TCR-T/TIL疗法靶点验证

在TCR-T或TIL治疗开发过程中，HLA肽组数据可辅助确认目标肽段是否实际呈递，减少脱靶风险，提升TCR亲和力选择的合理性。

 

四、百泰派克生物科技的HLA肽组分析解决方案

在百泰派克生物科技，我们融合高灵敏质谱平台 + 专业级样本富集流程 + 定制化生信算法管线，构建了一体化的HLA肽组分析服务体系，覆盖从样本准备到肽段筛选、免疫原性预测、靶点验证等多个关键环节。

技术亮点包括：

 

• 支持临床低量样本（>10^7细胞），适用于肿瘤活检组织、FFPE样本等
• 支持HLA I/II类呈递肽段双通路分析
• 结合NetMHCpan与de novo算法，提升新抗原识别率
• 搭载高分辨Orbitrap平台，保证数据质量与覆盖度
• 可结合蛋白组/转录组数据进行多组学联合解读

 

我们致力于为科研用户与生物医药企业提供真正可转化、可验证、可追踪的免疫靶点发现解决方案。

 

HLA肽组分析作为连接癌细胞抗原展示与T细胞识别的关键桥梁，正逐步成为个性化癌症免疫疗法的重要基石。随着质谱技术与算法手段的不断进化，其在精准靶点发现、免疫监测与耐药机制研究中的应用潜力将持续扩大。百泰派克生物科技，深耕蛋白质组与免疫组学前沿，助力科研创新与转化落地。如您正在开发肿瘤疫苗或免疫细胞治疗产品，欢迎联系我们，获取专业的一对一HLA肽组分析建议与服务。

 

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百泰派克生物科技特色项目

 

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

 

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

 

 

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

 

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

 

 

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

 

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

 

 

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

 

 

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

 

 

百泰派克生物科技七大检测平台

 

 

 

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!