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TMT 10-plex、11-plex、18-plex 技术

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      北京百泰派克生物科技有限公司

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      TMT 10-plex、11-plex、18-plex 技术......

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    随着蛋白质组学研究进入高通量和大队列时代,TMT(Tandem Mass Tag)多重标记定量技术因能在一次 LC-MS/MS 分析中同时处理多个样本,显著减少批次偏差和实验时间,被广泛用于疾病标志物筛选、药物靶点验证及多组学整合研究。当前主流的 TMT 产品线包括 10-plex、11-plex 和 18-plex,它们分别满足不同样本规模和研究需求。本文将解析这三类 TMT 技术的原理、区别及典型应用场景,并介绍如何根据项目特点选择合适方案。

     

    一、TMT 多重标记定量的核心原理

    1、TMT 标签的结构

    TMT 标签由三部分构成:

    (1)质量报告基团(Reporter ion):在 MS/MS 碎裂时释放特征离子,用于不同样本的定量;

    (2)质量平衡基团(Balancer):保证不同标签在 MS1 扫描中质量一致;

    (3)反应基团(Reactive group):与肽段的 N 端或赖氨酸残基共价结合,实现标记。

     

    2、定量过程

    (1)将不同样本分别用不同的 TMT 标签标记;

    (2)等量混合样本后进行 LC-MS/MS 分析;

    (3)在 MS/MS 层面通过报告离子强度对各样本进行相对定量。

     

    二、TMT 10-plex、11-plex 与 18-plex 的技术特点

    1、TMT 10-plex

    (1)可同时处理 10 个样本,适合中小规模项目(如常规生物学重复、基础研究);

    (2)报告离子质量分辨率需求较高(适配 Orbitrap 系统);

    (3)成本较低,广泛应用于学术研究。

     

    2、TMT 11-plex

    (1)在 10-plex 基础上新增一个通道,用作参考样本(Bridge Sample),便于跨批次标准化;

    (2)常用于需要多批次拼接的大型队列项目;

    (3)提高了数据一致性和跨批次可比性。

     

    3、TMT 18-plex

    (1)zuìxīn一代 TMT 技术,可在一次实验中处理多达 18 个样本,大幅提升通量;

    (2)对质谱分辨率和 MS/MS 精确度要求更高(适配高端 Orbitrap 或 timsTOF Pro 平台);

    (3)非常适合大规模临床队列、药物筛选和多组学联合研究,可显著降低批次效应与实验成本。

     

    三、三种 TMT 技术的选择策略

    1、样本规模

    (1)≤10 个样本:TMT 10-plex 即可满足;

    (2)10–20 个样本:推荐 TMT 11-plex,并利用参考样本平衡批次;

    (3)≥18 个样本或需要一次覆盖大队列:选择 TMT 18-plex,最大限度减少批次差异。

     

    2、研究类型

    (1)基础研究(信号通路、PTM 研究):10-plex 或 11-plex 足够;

    (2)临床队列或药物研究:18-plex 优势明显,可整合更多患者样本;

    (3)多组学整合:18-plex 更能支持转录组、代谢组联合分析。

     

    3、预算与设备

    (1)10-plex 成本最低,适合资金有限的课题组;

    (2)18-plex 需高端质谱平台(如 Orbitrap Exploris 480),但单样本成本反而更低。

     

    四、TMT 技术的典型应用场景

    1、疾病标志物发现

    对比疾病组与对照组蛋白质谱,筛选候选标志物,加速早期诊断研究。

     

    2、药物靶点验证与作用机制解析

    追踪药物处理前后蛋白质动态变化,构建药物调控网络。

     

    3、多组学联合研究

    与转录组、代谢组结合,建立疾病调控模型,从系统层面理解生物机制。

     

    4、临床转化研究

    18-plex 技术可处理大队列临床样本,显著减少批次差异,适合多中心协作研究。

     

    TMT 10-plex、11-plex 与 18-plex 技术各具优势,适用于不同规模和类型的蛋白质组学研究。选择合适的技术方案,并依托高质量的实验平台和专业的数据分析支持,是确保研究顺利推进的关键。如果您计划开展多通道 TMT 蛋白质组学研究,欢迎联系百泰派克生物科技,获取定制化的技术方案与合作咨询。

     

     

     

    百泰派克生物科技特色项目

     

    一、蛋白测序

    百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。

     

    ※服务优势:

    1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

    2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

    3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

    4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

    5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug,即可完成检测;

    6.测序不受N端封闭,PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

     

     

    二、蛋白质组学

    百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

     

    ※服务优势:

    1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;

    2.体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

    3.质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;

    4.可检测较低丰度蛋白,线性范围广;

    5.专业生物信息学分析,分析更系统准确。

     

     

    三、单细胞质谱流式技术分析

    百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析,采用金属元素标记物(通常是金属元素标记的特异抗体)标记细胞表面和内部的分子,然后用流式细胞原理分离单个细胞,再用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析单个细胞的原子质量谱,最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

     

    ※服务优势:

    1.技术先进,填补技术空白

    采用金属标记抗体技术,避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征,百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

    2.分析数量大,成本较低

    单细胞RNAseq受成本等因素限制,所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右,而流式质谱技术一次(单样本)就可分析至少10^5的细胞,实现了数量级的提高,且成本不高于单细胞RNAseq。

    3.应用前景大

    ①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化,在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景;

    ②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外,质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰;

    ③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

     

     

    四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

    百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析,可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究,旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案,深入挖掘未知的靶标。

     

     

    五、生物药物表征

    百泰派克基于高分辨率质谱技术,MALDI TOF,高效色谱分离技术,提供一系列完善的生物药物分析方案,从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析,到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务,帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

     

     

    百泰派克生物科技七大检测平台

    产品细节图片1

     

     

     

    百泰派克生物科技-生物制品表征,生物质谱多组学优质服务商

    北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则,通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证,建立了完备的质量体系,数据冷热/异地备份,设备定期计量/期间核查,软件审计追踪,为客户提供一体化解决方案和技术服务,支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

    1.公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;

    2.获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;

    3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;

    4.七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;

    5.服务3000+企业,10000+客户的选择;

    6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

     

     

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