
10xCytAssist空间转录组
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- 10xCytAssist空间转录组
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- 2025年09月25日
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例
10xVisium CytAssist 是一款精巧的台式仪器,专为空间转录组分析打造。它能将转录组探针从标准显微镜载玻片自动转移至 Visium 玻片,支持新鲜冰冻(FF)、甲醛固定(FxF)、石蜡包埋(FFPE)等多种样本类型的空间组学研究。该仪器与HE染色、免疫荧光(IF)染色相兼容,让预先保存的 FFPE 组织切片可便捷融入 Visium 工作流程,无需在 Visium 玻片上直接贴片。 CytAssist 实现了空间转录组实验的自动化、标准化与高效化,克服了手动操作不稳定、样本因保存久致质量下滑等难题。凭借创新设计,病理科存档的 FFPE 样本也能开展空间转录组分析,为科研人员提供更灵活的样本选择,助力深度挖掘多样样本的空间组学奥秘。
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文献和实验案例分析:多组学方法揭示TGF-β信号驱动的牙周组织干细胞衰老
文章标题:Multi-omics approach reveals TGF-β signaling-driven senescence in periodontium stem cells
发表杂志:J Adv Res
影响因子:IF=11.4
发表时间:2024年12月
应用技术:10x Visium CytAssist V2空间转录组测序(n=1)+其他验证实验(BS-seq(DNA甲基化测序)、药物干预实验等)
研究背景:牙周韧带(PDL)是一种将牙齿固定在牙槽骨上的动态结缔组织,可实现牙齿保持并促进连续更新。牙周组织的完整性由牙周韧带干细胞(PDLSCs)维持,其功能障碍和衰老会随着年龄的增长而破坏组织稳态,阻碍损伤修复,并导致牙齿脱落,最终影响整体健康。生长因子-β1(TGF-β1)以其再生特性和干细胞治疗中的功能性旁分泌因子而闻名,但其在调节PDLSC活性中的确切作用仍然存在争议且知之甚少。 实验设计:首先利用10×Visium CytAssist平台的空间转录组学定位4周龄小鼠下颌骨中 TGF-β1 在牙周组织的时空表达特征,随后分离培养人牙周膜干细胞(PDLSCs)进行一些列实验(流式细胞术、q-PCR、BS-seq等)验证 TGF-β1 对 PDLSCs 的功能影响及其分子机制。
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