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百蓁生物
多肽 (10-50AA)、重组蛋白、纳米抗体 (15kDa)、单克隆抗体 (150kDa)、多克隆抗体等蛋白分子的一级结构是发挥其生物学功能的核心,因此,对蛋白质完整序列准确快速的分析有助于未知蛋白质的功能研究。相比传统的数据库搜索法和 Edman 降解,基于质谱的从头测序可以不借助任何蛋白质或者 DNA 数据库信息,直接对蛋白质的序列进行分析。
百蓁生物拥有BSI 授权的质谱抗体测序技术、自主知识产权的 PEAKS 系列分析软件和经验丰富的专业技术服务团队。目前,我们的标准程序结合了自上而下和自下而上的质谱技术,确保了每一个氨基酸的正确性和全抗体的序列精度,包括 N 末端及 C 末端的修饰和 N- 连接的聚糖,可弥补传统蛋白质鉴定方法在未知蛋白质序列和突变分析上的不足。
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服务类型 |
服务内容 |
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经典测序 |
最快 2 个工作日内可交付抗体全长氨基酸序列,正式报告包含报告实验过程、蛋白序列、二级图谱支撑、I/L 区分列表等信息。 |
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活性保证测序 |
依据测序获得的抗体序列,进行构建表达纯化,交付 3 mg 重组抗体;客户验证抗体活性成功后,交付抗体全长测序报告;项目周期 6 周。 |

1.高可信度图谱支撑:每个位点的氨基酸有超过十种不同的肽段支持,每个氨基酸在质谱里有强的离子片段峰证据。

2.完整抗体质量核对:进行重链和轻链的完整质量测定,以确认组装的抗体序列,包括N末端焦谷氨酸环化修饰,重链C末端赖氨酸丢失和N-连接的寡糖。
3.亮氨酸(L)和异亮氨酸(I)区分:1)EThcD中的w-ion检测、2)酶裂解选择性、3)同源性统计数据,以明确区分Leu / Ile残基。

图 | 利用 EThcD 谱中的诊断离子区别亮氨酸(L)和异亮氨酸(I)

图 | 利用胰凝乳蛋白酶或胃蛋白酶对亮氨酸(L)的优选选择性

图 | I/L 区分的三重验证
4.无需理论参比序列,并且可以直接对含有2个主要成分的多克隆抗体进行直接的从头测序分析。
1.多肽药物、重组蛋白、单抗、双抗、多抗(n=2)、纳米抗体、Fab/Fc、交联抗体等未知蛋白的从头测序;
2.抗体药物研发以及生产过程的质控。
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送样要求 |
蛋白样品≥100 ug;纯度≥90%。 |
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项目周期 |
最快2个工作日 |
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交付标准 |
出具正式报告,报告实验过程、蛋白序列、二级图谱支撑、I/L区分列表。 |
案例分析:左图是抗体样品从头测序实例,在没有参考序列情况下,经过 PEAKS AB 软件,使用 de novo 算法自动化组装后的序列,每一个氨基酸都有很多 de novo 肽段支持(红色部分),右侧是样品参考序列。可以发现左边组装序列重链 68-70 位氨基酸分别是TLS,而参考序列此处的氨基酸是 SIT,TLS 与 SIT 的分子量相同,但是 SIT 氨基酸是没有 de novo 肽段支持的。由此可见 de novo 算法是不仅仅区分分子量的,还可以根据多肽二级质谱图的碎片信息精确区分到每一个氨基酸。

抗体标准品重链序列
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文献和实验的方法是对B细胞的转录子或遗传物质进行测序。该方法适用于杂交瘤,噬菌体展示,酵母菌展示或单细胞筛选,是抗体测序法中最具成本效益和最可靠的方法。但是,源细胞并不一定总是可用的。如果杂交瘤丢失,就可能无法获得遗传物质。在这种情况下,可以使用抗体测序来复原抗体序列,例如使用Edman降解或质谱分析技术。 基于Edman降解法的测序 Edman降解法,也称为埃德曼测序法,是一种成熟的蛋白质序列测定技术,该技术从N端开始,一次读取一个氨基酸。Edman降解法测序的主要优势是样品量要求低(通常需要少于
, 018等)和非标记两种定量法。 其中SPIDER是PEAKS中基于序列标签的搜索工具,可处理从头测序误差和同源突变之间可能出现的重叠部分。它可通过自动且有效地结合从头序列标签和同源物,重建正确的肽序列。 SPIDER 重建正确的肽序列过程(来源:百泰派克) PEAKS软件中使用的一系列算法已经过修改配置到PEAKS AB软件中,成为用于自动单克隆抗体测序公认的首选方法。
、共价药物靶向半胱氨酸位点分析、靶蛋白相对/绝对定量、生物标志物鉴定、蛋白质组/翻译后修饰组学分析和抗体测序及表达等。截至目前,已与国内外多个大型药企合作,科研项目成果接连见刊于Cell、Nature、Cancer Cell、Cell Research等国际知名杂志,涵盖医学、动植物学等各领域。欢迎各位老师前来咨询!
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