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北京百泰派克生物科技有限公司
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膜蛋白分为两大基本类型
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膜蛋白的结构分类与功能特性研究
膜蛋白是生物膜的重要组成部分,根据其与脂质双层的相互作用方式,膜蛋白分为两大基本类型:整合膜蛋白(integral membrane proteins)和外周膜蛋白(peripheral membrane proteins)。整合膜蛋白通过疏水性跨膜结构域嵌入脂质双层中,部分或wánquán贯穿膜结构,其功能多样,包括物质转运、信号传导和能量转换等。例如,G蛋白偶联受体(GPCRs)和离子通道蛋白均属于整合膜蛋白,其结构解析通常依赖去垢剂提取或纳米盘重组技术,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。外周膜蛋白则通过静电作用或氢键与膜表面结合,不直接嵌入脂质双层,如细胞色素c和某些信号蛋白,其分离常采用高盐溶液或pH调整法。
膜蛋白分为两大基本类型的区分不仅体现在结构上,还反映在功能和研究方法上。整合膜蛋白的疏水性区域使其难以在水溶液中保持天然构象,因此常需要两亲性分子(如去垢剂)维持其稳定性。冷冻电镜(cryo-EM)和X射线晶体学是解析其三维结构的主流技术,但样品制备成本较高。外周膜蛋白则因结合方式较弱,可通过改变离子强度或添加螯合剂(如EDTA)从膜上解离,后续纯化多采用亲和层析或超速离心。近年来,人工智能预测工具(如AlphaFold)为膜蛋白分为两大基本类型的结构预测提供了新思路,但其对整合膜蛋白的准确性仍需实验验证。
在功能研究中,膜蛋白分为两大基本类型的差异更为显著。整合膜蛋白常作为药物靶点,如GPCRs占现有药物靶标的30%以上,其构象动态分析对药物设计至关重要。外周膜蛋白则更多参与细胞膜相关的瞬时相互作用,如níngxuèyīnzi与血小板膜的结合。此外,膜蛋白分为两大基本类型的翻译后修饰(如糖基化或脂锚定)也影响其定位与功能。例如,整合膜蛋白的N-糖基化修饰有助于其正确折叠,而外周膜蛋白的脂修饰(如棕榈酰化)可增强其膜亲和力。
常见问题:
Q1. 如何判断一个未知膜蛋白属于整合膜蛋白还是外周膜蛋白?
A:可通过序列分析预测跨膜结构域(如TMHMM工具),若存在明显的疏水性α螺旋(通常≥20个残基),则倾向为整合膜蛋白。实验上,用高盐(如1M NaCl)或碱性溶液(pH 11)处理膜组分,解离的蛋白多为外周膜蛋白,而整合膜蛋白需去垢剂提取。
Q2. 为什么整合膜蛋白的结构解析比外周膜蛋白更困难?
A:整合膜蛋白的疏水性跨膜区在水溶液中易聚集失活,需复杂的两亲性环境维持其稳定性。此外,其构象异质性高(如GPCRs的多态性),而外周膜蛋白通常为可溶性结构域,更易形成晶体或适用于冷冻电镜分析。
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文献和实验。 2 膜蛋白 虽动物细胞主要有9种膜脂,而膜蛋白的种类繁多,多数膜蛋白分子数目较少,但却赋予细胞膜非常重要的生物学功能。 根据膜蛋白分离的难易及其与脂分子的结合方式,膜蛋白可分为两大类型:外在膜蛋白、内在膜蛋白。 (1) 外在膜蛋白为水溶性蛋白,靠离子键或其它较弱的键与膜表面的蛋白质分子或脂分子结合,因此只要改变溶液的离子强度甚至提高温度就可以从膜上分离下来,膜结构并不被破坏。 (2) 内在膜蛋白与膜结合非常紧密,一般讲只有用去垢剂(detergent)使膜解后才可分离出来。 获得大量有生
电镜技术的发展,会有更多的膜蛋白结构得到解析,助力后续的功能研究和药物发现。 有了冷冻电镜这把利器之后,真正制约膜蛋白研究的其实是样品的制备。 常规的膜蛋白制备流程如下: 图 1. 常规的膜蛋白制备流程图 特点是: 蛋白含量低 收率低 活性易降低 纯化过程需要优化 去垢剂 天然表达的膜蛋白含量极低,很难纯化。就算是重组表达体系,生产出的膜蛋白通常具有细胞毒性,因此表达量也远低于常规重组蛋白。在整个纯化过程中都需要选择合适的去垢剂才能使膜蛋白本身保持空间构象和活性。 去垢剂可分为三种: 表
填料 离子交换层析填料主要有基架和配基两部分组成,其中基架的类型和粒径大小决定了填料的耐压、流速、分辨率等,粒径越小,填料的分辨率越高,而同等高度的层析柱带来的反压也相对较大,而配基是实际和样品中生物分子结合的基团。 离子交换填料的配基根据离子交换层析类型的不同分为阴离子交换配基及阳离子交换配基,常见的离子交换填料配基类型 (如表6),在离子交换填料选择时,优先考虑强离子交换配基,如阴离子配基Q、阳离子配基S等,如果强离子交换配基无法得到满意的结果,也可以考虑使用弱离子交换配基为层析带来不同的选择
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