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北京百泰派克生物科技有限公司
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组蛋白组成
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组蛋白组成的分子特征与生物学意义
组蛋白是真核生物染色质的基本结构蛋白,其组成直接决定了核小体的装配特性和表观遗传调控的分子基础。作为DNA包装的一级组织形式,组蛋白由H2A、H2B、H3、H4四种核心组蛋白和连接组蛋白H1构成,每个核心组蛋白均以二聚体形式存在,共同形成八聚体结构。组蛋白组成的特殊性体现在其高度保守的氨基酸序列中——H3和H4在所有真核生物中保守性超过90%,而H2A和H2B则存在较多变体,这些变体通过替换经典组蛋白参与特定生物学过程的调控。例如,H2A.Z变体与基因转录激活相关,macroH2A则与异染色质沉默有关。组蛋白组成的动态变化还受到翻译后修饰(如甲基化、乙酰化)的精细调控,这些修饰通过改变组蛋白与DNA的亲和力或招募效应蛋白,zuì终影响染色质的gāojí结构和基因表达模式。
从进化角度看,组蛋白组成的保守性反映了其对维持基因组稳定性的核心作用。组蛋白基因通常以多拷贝形式存在于基因组中,人类基因组包含超过70个组蛋白基因,这些基因在细胞周期S期被协同激活以满足DNA复制时核小体组装的需求。值得注意的是,组蛋白组成的异常与多种疾病相关,例如组蛋白H3.3的K27M突变在儿童脑胶质瘤中高频出现,该突变通过显性负效应干扰多梳抑制复合物2(PRC2)的功能,导致全局性H3K27me3修饰水平下降。
组蛋白组成的分析方法
研究组蛋白组成通常需要结合生物化学与分子生物学技术。质谱技术是解析组蛋白组成及其修饰谱的金标准,高分辨率质谱可同时鉴定组蛋白变体类型和修饰位点,具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)则用于在全基因组水平分析特定组蛋白变体或修饰的分布模式,例如H3K27ac的ChIP-seq可揭示活跃增强子的位置。近年来发展的CUT&Tag技术因其高信噪比和低细胞起始量需求,逐渐成为研究组蛋白组成动态的有力工具。
在实验设计层面,组蛋白组成的提取需注意缓冲液的pH和离子强度。传统酸提取法(如0.4N硫酸处理)能有效富集组蛋白,但可能丢失部分修饰信息;而基于去垢剂的温和提取方案更适合保存翻译后修饰状态。对于组蛋白变体的特异性检测,针对变体tèyǒu序列表位的抗体(如H2A.X的C末端抗体)具有关键作用。
组蛋白组成的工程化改造
合成生物学为研究组蛋白组成的功能提供了新思路。通过位点特异性突变技术,可构建携带特定修饰模拟(如H3K9M)或缺失突变(如H4K16A)的组蛋白转基因细胞系。这类模型揭示了组蛋白组成中单个氨基酸残基对染色质功能的决定性影响。例如,H3K36M突变被发现能竞争性抑制组蛋白甲基转移酶SETD2的活性,导致全基因组H3K36me2/me3水平异常。
常见问题:
Q1. 组蛋白变体在DNA损伤修复中的选择性整合机制是什么?
A:H2A.X的C端SQEY基序被ATM/ATR激酶磷酸化后形成γ-H2A.X焦点,通过招募MDC1等支架蛋白启动修复复合物的组装。而H2A.Z变体则通过其酸性补丁结构域促进SWI/SNF染色质重塑复合物的招募,协同促进损伤位点的染色质开放。
Q2. 组蛋白组成在细胞重编程过程中如何被重置?
A:体细胞重编程时,组蛋白变体H3.3通过伴侣蛋白HIRA优先掺入多能性基因位点,置换原有的H3.1/3.2;同时TET酶介导的DNA去甲基化与组蛋白去乙酰化酶抑制剂的协同作用,共同驱动组蛋白组成向多能性状态转变。
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文献和实验表观遗传是指 DNA 序列不发生变化但基因表达却发生了可遗传的改变,即基因型未发生变化而表型却发生了改变。换言之,这是一种 DNA 序列外的遗传方式。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因表达,控制细胞表型,所有这些表观遗传学因素都是维持机体内环境稳定所必需的,有助于正常生理功能的发挥。 组蛋白的翻译后修饰不仅与染色体的重塑和功能紧密相关,而且在决定细胞命运、细胞生长以及致癌作用的过程中发挥着重要的作用,如组蛋白
组蛋白修饰详情 乙酰化 乙酰化是最早发现的影响转录调控的组蛋白修饰之一,因此目前研究的最多。乙酰化使 从核小体伸出 的 N-末端组蛋白尾部的赖氨酸残基带负电荷,这些负电荷会排斥带负电荷的 DNA,导致染色质结构 松弛。开放的染色质构象允许转录因子结合并显著增加基因表达 (Roth et al., 2001)。 组蛋白乙酰化参与细胞周期调控、细胞增殖和凋亡,并在调节细胞分化、DNA 复制和修复、核输入和 神经元抑制等多种细胞过程中发挥重要作用。组蛋白乙酰
组蛋白 histone 与有核细胞核内 DNA结合的碱性蛋白,以与 DNA结合成核酸组蛋白的形态,几乎存在于所有细胞核中。在精子核中,由于生物不同,有时以鱼精蛋白取代组蛋白。从氨基酸组成来看,多数是赖氨酸和精氨酸,芳香族氨基酸和含硫氨基酸较少。缔合作用强。一般认为由以下 5种分子构成(因细胞核的种类不同,有时可更多些): F1 或Ⅰ(高赖氨酸,丙氨酸型), F2b或Ⅱ b2 (高赖氨酸,丝氨酸型), F2a2或Ⅱ b1(高丙氨酸,亮氨酸型,高精氨酸、赖氨酸型), F2a1或Ⅳ
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