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北京百泰派克生物科技有限公司
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蛋白磷酸化的位点
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蛋白磷酸化的位点研究进展
蛋白磷酸化的位点是dànbáizhì翻译后修饰中zuì关键的调控机制之一,通过激酶催化的磷酸基团共价连接,可逆地改变dànbáizhì的构象、活性、亚细胞定位及相互作用网络。真核生物中约30%的dànbáizhì存在磷酸化修饰,其中sīānsuān(Ser)、sūānsuān(Thr)和làoānsuān(Tyr)是zuì常见的磷酸化位点。这些位点的动态修饰在细胞信号转导、代谢调控、细胞周期及疾病发生(如癌症、神经退行性疾病)中发挥核心作用。例如,MAPK通路中ERK1/2的Thr202/Tyr204双位点磷酸化是细胞增殖信号传递的关键开关,而p53蛋白的Ser15磷酸化则直接参与DNA损伤应答。
鉴定蛋白磷酸化的位点需结合生物化学、质谱技术与生物信息学方法。传统放射性同位素标记法因安全性问题逐渐被非标记技术取代,而高分辨率质谱(如LC-MS/MS)已成为位点鉴定的金标准,其灵敏度可达飞摩尔级别。此外,磷酸化特异性抗体(如抗-pSer/Thr/Tyr抗体)通过免疫印迹或免疫沉淀实现靶向检测,但抗体制备费用需根据实验需求和样品情况来确定。近年来,磷酸化蛋白zhìzǔxué通过富集策略(TiO2或IMAC)结合深度覆盖分析,实现了大规模位点筛查,例如人类磷酸化dànbáizhì组已注释超过10万个位点。
蛋白磷酸化的位点功能解析需依赖突变体构建与功能验证。将目标位点突变为非磷酸化类似物(如Ser→Ala)或模拟持续磷酸化状态(如Ser→Asp/Glu),可明确其生物学意义。此外,磷酸酶抑制剂(如冈田酸)或激酶抑制剂(如星形孢菌素)的应用,可动态调控位点修饰水平。值得注意的是,同一蛋白不同磷酸化的位点可能呈现协同或拮抗效应,如CDK1的Thr14/Tyr15磷酸化抑制其活性,而Thr161磷酸化则激活激酶功能。
常见问题:
Q1. 如何区分蛋白磷酸化的位点是功能性修饰还是随机噪声?
A:功能性位点通常具有进化保守性,可通过多物种序列比对验证;其次,其修饰水平在特定刺激下显著变化,且突变后导致表型缺陷。此外,磷酸化酶-激酶调控网络的上下游分析可提供功能关联证据。
Q2. 质谱鉴定蛋白磷酸化的位点时,如何提高低丰度位点的检出率?
A:需优化磷酸肽富集策略,例如结合TiO2和IMAC两种方法降低漏检率;采用高精度Orbitrap或TimS-TOF质谱仪提升分辨率;使用同位素标记(如TMT/iTRAQ)增加定量准确性。此外,酶切时选用Lys-C/Trypsin组合可改善磷酸肽的离子化效率。
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