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北京百泰派克生物科技有限公司
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蛋白磷酸化的位点
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蛋白磷酸化的位点研究进展
蛋白磷酸化的位点是dànbáizhì翻译后修饰中zuì关键的调控机制之一,通过激酶催化的磷酸基团共价连接,可逆地改变dànbáizhì的构象、活性、亚细胞定位及相互作用网络。真核生物中约30%的dànbáizhì存在磷酸化修饰,其中sīānsuān(Ser)、sūānsuān(Thr)和làoānsuān(Tyr)是zuì常见的磷酸化位点。这些位点的动态修饰在细胞信号转导、代谢调控、细胞周期及疾病发生(如癌症、神经退行性疾病)中发挥核心作用。例如,MAPK通路中ERK1/2的Thr202/Tyr204双位点磷酸化是细胞增殖信号传递的关键开关,而p53蛋白的Ser15磷酸化则直接参与DNA损伤应答。
鉴定蛋白磷酸化的位点需结合生物化学、质谱技术与生物信息学方法。传统放射性同位素标记法因安全性问题逐渐被非标记技术取代,而高分辨率质谱(如LC-MS/MS)已成为位点鉴定的金标准,其灵敏度可达飞摩尔级别。此外,磷酸化特异性抗体(如抗-pSer/Thr/Tyr抗体)通过免疫印迹或免疫沉淀实现靶向检测,但抗体制备费用需根据实验需求和样品情况来确定。近年来,磷酸化蛋白zhìzǔxué通过富集策略(TiO2或IMAC)结合深度覆盖分析,实现了大规模位点筛查,例如人类磷酸化dànbáizhì组已注释超过10万个位点。
蛋白磷酸化的位点功能解析需依赖突变体构建与功能验证。将目标位点突变为非磷酸化类似物(如Ser→Ala)或模拟持续磷酸化状态(如Ser→Asp/Glu),可明确其生物学意义。此外,磷酸酶抑制剂(如冈田酸)或激酶抑制剂(如星形孢菌素)的应用,可动态调控位点修饰水平。值得注意的是,同一蛋白不同磷酸化的位点可能呈现协同或拮抗效应,如CDK1的Thr14/Tyr15磷酸化抑制其活性,而Thr161磷酸化则激活激酶功能。
常见问题:
Q1. 如何区分蛋白磷酸化的位点是功能性修饰还是随机噪声?
A:功能性位点通常具有进化保守性,可通过多物种序列比对验证;其次,其修饰水平在特定刺激下显著变化,且突变后导致表型缺陷。此外,磷酸化酶-激酶调控网络的上下游分析可提供功能关联证据。
Q2. 质谱鉴定蛋白磷酸化的位点时,如何提高低丰度位点的检出率?
A:需优化磷酸肽富集策略,例如结合TiO2和IMAC两种方法降低漏检率;采用高精度Orbitrap或TimS-TOF质谱仪提升分辨率;使用同位素标记(如TMT/iTRAQ)增加定量准确性。此外,酶切时选用Lys-C/Trypsin组合可改善磷酸肽的离子化效率。
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文献和实验生命活动与蛋白质的动态变化密切相关, 很多情况下某些蛋白质是通过各种翻译后修饰来完成或改变其功能。在数量众多的蛋白质翻译后修饰中,蛋白质磷酸化修饰无疑是最重要的一类,它是指通过蛋白激酶(Protein kinase,PK)介导的酶促反应把磷酸基团从一个化合物转移到另一个化合物上的过程[1](Figure 1所示),是生物体内存在的一种普遍的调节方式。现今发现的所有人类蛋白质中超过30%可被磷酸化修饰,这一修饰在细胞信号的传递过程中占有极其重要的地位,与生命活动的许多过程都密切相关,对此
xiujing_001 各位高手:我正在做信号通路,请问如何知道一个蛋白的磷酸化位点,比如PERK(protein kinase R-like endoplasmic reticulum kinase)?多谢了! biolinkphilic 一般蛋白的磷酸化位点就是位于苏氨酸、丝氨酸和酪氨酸上 xiujing_001 有查找磷酸化位点的工具吗?比如软件之类的 本文
prince1101 非磷酸化抗体是识别总得蛋白的,比如AKT。 P-AKT和AKT其实只差一些磷酸基,分子量稍大点,以前听别人讲P-AKT和AKT之间有shift,有时候WB是可以做出来的。 用的是梯度胶?分子量在68KD左右。应该怎么样来配胶呢?梯度胶的浓度? 谢谢! prince1101 希望高手能赐教! ourlab 某些 AKT抗体,如cell
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