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北京百泰派克生物科技有限公司
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蛋白质修饰包括
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dànbáizhì修饰包括的生物学意义与研究进展
dànbáizhì修饰包括翻译后共价修饰和非共价相互作用调控,是dànbáizhì功能多样化的核心机制之一。这类修饰通过化学基团(如磷酸基、乙酰基、糖链等)的添加或去除,动态改变dànbáizhì的结构、活性、定位及相互作用网络。在真核生物中,超过50%的dànbáizhì会发生至少一种修饰,这些修饰包括磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化等,直接参与细胞信号转导、代谢调控、免疫应答等关键生理过程。例如,组蛋白乙酰化修饰包括对染色质结构的动态调控,直接影响基因表达;而dànbáizhì磷酸化修饰包括激酶与磷酸酶的协同作用,构成了细胞信号传导的核心开关系统。近年来,随着质谱技术的进步,dànbáizhì修饰包括的研究已从单一修饰类型扩展到修饰串扰(crosstalk)分析,例如磷酸化-泛素化协同调控DNA损伤修复的分子机制。
从技术层面看,dànbáizhì修饰包括的检测方法可分为抗体依赖性和质谱依赖性两大类。免疫印迹(Western blot)和免疫沉淀(IP)利用修饰特异性抗体实现靶向检测,但通量较低。高通量质谱技术(如LC-MS/MS)通过分析肽段质量偏移,可系统性鉴定修饰位点,其成本因仪器型号和样品复杂度而异(具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定)。此外,化学探针标记(如shēngwùsù缀合的ATP类似物)结合亲和纯化,能够富集低丰度修饰蛋白。值得注意的是,修饰动态性研究需要时间分辨采样或稳定同位素标记(SILAC),这对实验设计提出了更高要求。
在疾病关联研究中,dànbáizhì修饰包括的异常已被证实与癌症、神经退行性疾病等密切相关。例如,tau蛋白的异常磷酸化修饰包括阿尔茨海默病中神经纤维缠结的形成;而PD-L1的糖基化修饰包括肿瘤免疫逃逸的调控。针对这些修饰酶的抑制剂(如组蛋白去乙酰化酶抑制剂)已成为药物开发的热点领域。未来研究方向将聚焦于修饰动态图谱的构建,以及基于人工智能的修饰位点预测算法优化。
常见问题:
Q1. 如何区分dànbáizhì修饰包括的生理性调控与病理相关异常修饰?
A:生理性修饰通常呈现时空特异性(如细胞周期依赖性磷酸化),且修饰水平受严格调控;病理状态下的修饰异常表现为持续激活(如致癌激酶突变导致组成型磷酸化)或位点偏移(如tau蛋白在非典型位点的过度磷酸化)。可通过比较疾病模型与正常组织的修饰组学数据,结合功能验证实验(如位点突变)进行判别。
Q2. 质谱检测dànbáizhì修饰包括时,如何提高低丰度修饰肽段的覆盖率?
A:可采用分级富集策略:先用TiO2或IMAC富集磷酸化肽段,再通过亲水相互作用色谱(HILIC)分级降低样品复杂度。对于乙酰化修饰,免疫亲和富集后使用高分辨率质谱(如Orbitrap)可提升灵敏度。数据采集时,优先选择PRM(平行反应监测)模式靶向分析已知修饰位点。
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文献和实验蛋白质翻译后修饰 (Protein translational modifications,PTMs) 通过功能基团或蛋白质的共价添加、调节亚基的蛋白水解切割或整个蛋白质的降解来增加蛋白质组的功能多样性。这些修饰包括磷酸化、糖基化、泛素化、亚硝基化、甲基化、乙酰化、脂质化和蛋白水解,几乎影响正常细胞生物学和发病机制的所有方面。因此,识别和理解 PTM 在细胞生物学和疾病治疗和预防的研究中至关重要。 看到一篇 Thermo Fisher的文章,关于翻译后修饰Post
本节课包含修饰位点所在蛋白功能分类分析、差异修饰位点所在蛋白的功能富集分析、差异修饰位点所在蛋白之间的互作网络等知识点。
本节课包含了泛素化与蛋白质表达之间的关联分析、基于蛋白和修饰组学的癌症分子分型分析等知识点。
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