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上海维亦特生物
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文献和实验佚名 色氨酸是构成蛋白质的组分,一般的环境难以给细菌提供足够的色氨酸,细菌要生存繁殖通常需要自己经过许多步骤合成色氨酸,但是一旦环境能够提供色氨酸时,细菌就会充分利用外界的色氨酸、减少或停止合成色氨酸,以减轻自己的负担。细菌所以能做到这点是因为有色氨酸操纵元(trp operon)的调控。 (一)色氨酸操纵元的结构与阻遏蛋白的负性调控 如图19
益生菌竟然有害健康?破坏免疫抑制,刺激肿瘤生长,化身「癌症帮凶」
-associated macrophages to suppress anti-tumor immunity 的研究论文,揭示了乳酸菌通过代谢食物中的色氨酸激活肿瘤相关巨噬细胞(Tumor-associated macrophage,TAM)发挥促进胰腺导管癌生长的机制。 色氨酸(Trp)是人体必需氨基酸之一,其代谢产物具有免疫、代谢、神经调节等功能, Nature reviews 杂志在 2019 年发表的一篇综述文章中就详细描述了色氨酸代谢产物在中枢神经疾病,感染性疾病,自身免疫疾病,肿瘤等疾病中发挥的作用
手把手教你用 Pymol, Chimera 预测点突变蛋白结构!
NO-MUTATION, 选择色氨酸 Trp W;Pick-#73 Glu, Color->yellow, 可以看到黄色是点突变以后 Trp, 红色是原来的 Glu. 点击 Apply 保存就只剩下黄色的 Trp 了。可以看到,做完点突变后,周围残基并没有发生构象上的变化,意味着 pymol 不会自动做能量最小化处理。二、 用 Chimera 做结构点突变Chimera 相比 pymol 功能更强大,做点突变可以根据氨基酸不同方向的概率(实验数据)来选择不同的点突变氨基酸结构状态。并且后期通过动力学模拟,来调整
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