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北京百泰派克生物科技有限公司
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糖基化实验方法
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糖基化实验方法的研究进展与技术要点
dànbáizhì糖基化作为zuì重要的翻译后修饰之一,通过糖链与dànbáizhì的特异性结合参与细胞识别、信号传导和免疫应答等关键生物学过程。糖基化实验方法的核心在于jīngquè解析糖链结构、连接位点及其动态变化,其技术体系涵盖样品制备、糖链释放、标记分离和结构解析四个关键环节。当前主流技术路线以质谱分析为核心,结合凝集素芯片、毛细管电泳和核磁共振等多维技术平台,实现对N-连接糖基化、O-连接糖基化的系统性表征。
在样品前处理阶段,糖蛋白的富集纯化是糖基化实验方法的首要步骤。凝集素亲和层析(如Con A、WGA)可特异性捕获特定糖型,而亲水相互作用色谱(HILIC)则基于糖链的极性特征实现广谱性富集。对于复杂生物样本,采用PNGase F酶切释放N-糖链时需控制pH7.5-8.5的缓冲环境,而O-糖链的化学释放(如β-消除反应)则需在碱性条件下完成。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
糖链衍生化技术显著提升检测灵敏度。2-ānjīběn甲酸(2-AA)或2-氨基吖啶酮(2-AB)等荧光标记试剂可通过还原胺化反应与糖链还原端共价结合,其摩尔标记效率可达90%以上。超高效液相色谱(UPLC)与荧光检测器联用可实现pmol级糖链定量,而MALDI-TOF-MS则提供快速的糖链质量指纹图谱。值得注意的是,糖基化实验方法中同位素标记(如[18O]标记)结合LC-MS/MS可jīngquè定量糖基化位点占有率,其动态范围跨越三个数量级。
结构解析是糖基化实验方法的zhōngjí目标。串联质谱(MS/MS)通过碰撞诱导解离(CID)产生特征性糖苷键断裂,B/Y离子对可确定单糖连接顺序。外切糖苷酶阵列(如α1-2,3,6甘露糖苷酶)的阶梯式酶解可验证分支结构,而离子迁移谱(IMS)则能区分空间异构体。近期发展的电子激活解离(EAD)技术显著提升了复杂糖链的序列覆盖度,其分辨率达到亚单糖单元水平。
常见问题:
Q1. 如何解决糖基化异质性对质谱信号强度的抑制问题?
A:采用分级分离策略,先通过HILIC或PGC柱按极性/疏水性分离糖肽,再结合 stepped-collision energy 的DDA采集模式。对于高甘露糖型,可选用ERLIC色谱降低离子抑制效应。
Q2. 在缺乏标准品的情况下如何验证新型糖链结构?
A:构建三重验证体系:①MS/MS谱图与GlycoWorkbench模拟片段匹配度>80%;②外切糖苷酶处理后的质量偏移符合预期;③通过糖基转移酶重组实验验证生物合成途径的合理性。
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文献和实验「诱饵」蛋白,「诱饵」蛋白的互作蛋白称为「猎物」蛋白。「诱饵」蛋白与「猎物」蛋白结合后,利用靶蛋白—抗体— Protein A/G —磁珠/琼脂糖珠的结合方式获取复合物,再通过 SDS-PAGE、Western blot 或质谱等方法进一步对复合物中的靶蛋白进行分析。 免疫共沉淀方法简单,是识别感兴趣蛋白质的相互作用、深入了解其结构和功能的初步实验方法。但是它也有相应的局限性,比如很难验证两种蛋白质是否直接发生相互作用、不能得到这种相互作用亲和力等定量信息等。因此需要在相互作用分析与筛选后,使用
领域奠基之作:Cell 重磅报道可胞外展示的糖基化修饰 RNA——glycoRNA
多糖可以修饰脂质和蛋白质,调节所有生命领域的分子间和分子内的相互作用。因此,许多基本过程,如胚胎形成,宿主病原体识别和肿瘤免疫相互作用都是依赖于糖基化的。而通常人们认为,RNA 不是糖基化的主要目标。 RNA 作为另一种生物高聚物,是已知生命的中心。虽然 RNA 通常局限于 4 个碱基,但是转录后修饰(post-transcriptional modifications,PTMs)可以显著扩大 RNA 的多样性。目前已鉴定有超过 100 种 PTMs,但是除了少数基于单糖的 tRNA 修饰
三句话读懂一篇 CNS:喝酒为何拉近社交距离;教科书级成果,RNA 糖基化修饰...
6-activated caspase-8。该工作阐释了一条由代谢物 α-KG 诱导肿瘤细胞焦亡的新通路,能够抑制肿瘤生长和转移。 图 2:来源 Cell Research 3. Cell:RNA 能够被糖基化修饰且分布在细胞膜外侧 已知 RNA 存在 170 多种修饰。 2021 年 5 月 17 日,哈佛大学 Carolyn R. Bertozzi 教授团队在 Cell 杂志上发表研究论文 Small RNAs are modified with N-glycans and displayed
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