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30 rxns
产品货号:F7511S
储存条件:-20℃
同裂酶:ZraI(注:同裂酶对于不同的甲基化修饰可能具有不同敏感性。)
产品组成
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组分 |
规格 |
|
LabFDTM AatII |
30 ul |
|
10×LabFDTM Buffer |
1 ml |
|
10×LabFDTM Color Buffer |
1 ml |
产品简介
LabFD快速内切酶是一系列经过基因工程重组的快速限制性内切酶,适用于质粒DNA、PCR产物或基因组DNA等的快速酶切。所有LabFD快速内切酶在通用的LabFD或 LabFD Color Buffer 中都具有优良的活性,能够在5~15分钟内完成酶切。此外,LABLEAD去磷酸化、连接试剂在LabFD Buffer中均具有100%活性,支持一管化反应,提升“酶切-修饰-连接”的体验。LabFD Color Buffer 包括红色和黄色示踪染料,可将产物直接用于凝胶电泳。LabFD Color Buffer的红色染料与2500 bp双链DNA片段在1%琼脂糖凝胶中迁移速率接近;黄色染料与10 bp双链DNA片段在1%琼脂糖凝胶中迁移速率接近。
建议反应条件:1×LabFD buffer;37℃温育;参照“DNA 快速酶切流程”配制反应体系。
失活条件:80℃温育 20 min。
质量控制
功能活性检测
37℃下,在 20ul 反应体系中,1ul LabFDTM AatII能够在 15min 内完全消化1ug λDNA。
超长时间温育检测
37℃下,在 20ul 反应体系中,将1ul LabFDTM AatII与1ug λDNA共同温育 3h,未检测到其他核酸酶污染或星号活性引起的底物非特异性降解,更长时间酶切可能出现星号活性。
酶切-连接-再酶切检测
37℃下,使用 10倍酶量的 LabFDTM AatII消化 DNA 底物,回收酶切产物,在 22℃下使用 T4 DNA Ligase (Fast) 可以将超过95%的酶切产物重新连接。将连接产物再次回收后,使用相同的内切酶可以重新切开月95%以上的连接产物。
注:AatII 在低离子强度下活性会受到抑制。如果反应缓冲液pH在25℃下未介于7.5和8.0之间,则酶活性会降低。
使用方法
1.DNA 快速酶切流程
(1)在冰上按如下建议的加样顺序配制反应体系:
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质粒DNA |
PCR产物 |
基因组DNA |
|
|
ddH2O |
15 ul |
16 ul |
30 ul |
|
10×LabFD Buffer或10×LabFD Color Buffer |
2 ul |
3 ul |
5 ul |
|
底物 DNA |
2ul(up to 1 ug) |
10 ul (~0.2 ug) |
10 ul (5 ug) |
|
LabFDTM AatII |
1 ul |
1 ul |
5 ul |
|
Total |
20 ul |
30 ul |
50 ul |
注:本体系适用于经过纯化的PCR产物酶切。未纯化的PCR产物具备一定的离子强度,10×LabFD Buffer 加入量可适当减少至2 μl。但由于DNA聚合酶同时具有外切酶活性,会影响酶切产物,因此如下一步需进行克隆等操作,建议酶切前对PCR产物进行纯化。
(2)轻柔吸打或轻弹管壁以混匀(切勿涡旋),然后瞬时离心以收集挂壁液滴;
(3)37℃温育15 min(质粒),或15~30 min(PCR产物),或30~60 min(基因组DNA);
(4)80℃温育 20 min 即可使酶失活,终止反应(可选);
(5) 如果使用LabFDTM Color Buffer进行酶切反应,得到的产物可以直接进行上样电泳。
2. 双酶切或多酶切
(1)每种快速内切酶的用量为1 μl,并根据需要适当扩大反应体系;
(2)所有快速内切酶的体积总和不得超过总反应体系的1/10;
(3)如果所用的几种快速内切酶的最适反应温度不同,应先以最适温度低的酶开始酶切,再添加最适温度较高的酶,在其最适反应温度下进行酶切反应。
3. 适用于质粒的扩大反应体系
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DNA |
1 ug |
2 ug |
3 ug |
4 ug |
5 ug |
|
LabFDTM AatII |
1 ul |
2 ul |
3 ul |
4 ul |
5 ul |
|
10×LabFD Buffer或10×LabFD Color Buffer |
1 ul |
2 ul |
3 ul |
4 ul |
5 ul |
|
Total |
20 ul |
20 ul |
30 ul |
40 ul |
50 ul |
注:如果总反应体系大于20 μl,应适当增加温育时间,尽量使用水浴、金属浴或沙浴。
不同 DNA 中的酶切位点数量
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λDNA |
ΦX174 |
pBR322 |
pUC57 |
pUC18/19 |
SV40 |
M13mp18/19 |
Adeno2 |
|
10 |
1 |
1 |
1 |
1 |
0 |
0 |
3 |
甲基化修饰影响
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Dam |
Dcm |
CpG |
EcoKI |
EcoBI |
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无影响 |
无影响 |
剪切受阻 |
无影响 |
无影响 |
在不同反应缓冲液中的活性
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LabFD™ Buffer |
Thermo Scientific FastDigest Buffer |
NEB CutSmart®Buffer |
Takara QuickCut™Buffer |
|
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活性 |
100% |
<25% |
100% |
<25% |
注:活性数据来自 LABLEAD 限制酶标准反应体系下的检测。
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