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文献和实验相关实验
本节课介绍了多种类型修饰组学的联合分析。
涉及炎症的课题,无一例外都要检测细胞因子。然而它们具有多效性、重叠性,它们协同作用又相互拮抗,十分复杂。到底怎么根据自己的课题挑选细胞因子?怎样把细胞因子数据讲出完整的科学故事,这其中大有学问。 一、上百种细胞因子,哪个才适合你的研究? 1.各类常见因子,都是干什么的? (1)白细胞介素(IL):主要负责白细胞间的信号通讯 促炎因子:IL-1、IL-6、IL-12、IL-17 抗炎因子:IL-10、TGF-β (2)干扰素(IFN):主打抗病毒,同时负责免疫调节 IFN-α/β:多由被病毒
魔高一尺,道高一丈!清华大学徐萌团队发现能量代谢与肿瘤免疫逃逸的关系
分选并进行 RNA-seq。转录组分析显示,FTO 敲降导致 CD8+ T 细胞发生显著改变:1420 个基因上调和 1101 个基因下调。其中细胞因子和细胞毒性分子(IL-2, IFN-γ 和 granzyme B)的表达增加。通过对 CD8+ T 细胞效应特征基因进行基因集富集分析发现,Fto-Kd 导致 T 细胞激活并且增加了 T 细胞杀伤效果。 这些结果表明肿瘤固有的 FTO 功能作为抑制因子,限制了 T 细胞的激活和效应状态。 图片来源:Cell MetabolismFTO 缺失抑制
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免疫调节因子外包检测:IL-2/IL-4/IL-10 等细胞因子联合分析
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