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文献和实验HNADOCK - 一个研究 RNA 与 DNA/RNA 互作的平台
核酸(RNA/DNA)之间的相互作用在许多基本的细胞活动中起着重要作用,例如转录调控,RNA 加工和蛋白质合成。因此,确定 RNA/DNA 之间的复杂结构对于理解相关核酸相互作用的分子机制至关重要。因为结构往往决定了分子的功能,这种核酸-核酸相互作用的结构建模和预测对于理解原子级相关生物过程的分子机制,进而开发针对相互作用的干预性治疗药物或措施也是至关重要的。因为采用实验技术来探究 RNA/DNA 之间相互作用通常是复杂困难且高成本的,因此从核酸序列计算并预测核酸复合体结构并进行分子模拟对接
了A, G, C, T, U 5种碱基混合物,各斑点很明晰,效果稳定,重现性很好,既可用于DNA及RNA碱基分离,又可用于此两种核酸混合物的各碱基测定。在薄层板的两端可各作一次分析,省时省原料。 (二)定量分析 1.标准曲线如图2示。回归方程的‘检验:查t表,df=n-2=3, t 0.01=5.841,而现在A的t=33.43, G为17.96, C为17.39,T为9.26,均>10.01,故P 2.分析结果如表2示。由表2数据可看出,(G+C)克分子外最大标准
产物的 DNA:RNA 杂交链变性后利用大肠杆菌 DNA 聚合酶Ⅰ Klenow 片段或反转录酶合成 cDNA 第二链,最后用对单链特异性的 S1 核酸酶消化该环,即可进一步克隆。但自身引导合成法较难控制反应,而且用 S1 核酸酶切割发夹结构时无一例外地将导致对应于 mRNA 5' 端序列出现缺失和重排,因而该方法目前很少使用。 2、置换合成法: 该方法利用第一链在反转录酶作用下产生的 cDNA:mRNA 杂交链不用碱变性,而是在 dNTP 存在下,利用 RNA 酶H在杂交链的 mRNA 链上造成切口
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