球形赖氨酸芽孢杆菌

二氨基庚二酸 diaminopimelic acid

1949年沃克（E.Work）从白喉菌（白喉棒杆菌）的水解物中发现的一种氨基酸。根据调查，除革兰氏阳性球菌及某种链霉菌外，广泛存在于几乎所有的细菌。其含量相当于全细胞干重的0.02—0.2％，在细胞内，存在于可溶性组分及细胞壁组分等处。此外，在结核菌的可溶性蛋白质部分、抗原性脂多糖以及从枯草芽孢杆菌的芽孢提取的细胞外肽中也有所发现。其天然物无光学活性。据证明，它的生物学机能除形成稳定的细胞壁组成成分之外，在某些细菌来说（大肠杆菌、产气杆菌），通过二氨基二庚酸脱羧酶的作用，脱羧后生成赖氨酸

标准菌株验证鉴定步骤

菌种活化：干粉标准菌株 标准贮备菌株 工作菌株；   1.1    金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌、铜绿假单胞菌、枯草芽孢杆菌标准菌株： 挑取部分干粉溶解于0.9% 无菌氯化钠溶液中，划线接种于营养琼脂平板上，36℃±1℃ 培养18-24 小时。并观察菌落形态。 a. 金黄色葡萄球菌：菌落凸起，圆形，不透明； b. 大肠埃希氏菌：菌落稍凸，圆形，湿润，乳白色； c. 铜绿假单胞菌：菌落扁平，圆形，边缘不整齐，光滑湿润，可产生蓝绿或黄绿色素； d. 枯草芽孢杆菌: 表面粗糙不透明

酶活性位点催化残基特征分析

反应的中间态。天冬氨酸和谷氨酸残基在催化残基中分别占比 15% 和 11%。他们自然丰度都差不多，分别是 5.7% 和 5.9%。可能是因为与谷氨酸相比，天冬氨酸有比较短的侧链（少一个甲基），使得天冬氨酸的侧链柔性相对弱一点，位置相对固定，从而有助于催化。精氨酸和赖氨酸在催化残基中分别占比 11% 和 9%。精氨酸和赖氨酸的自然丰度分别是 4.9% 和 9%。这种偏好性可能是因为精氨酸侧链有三个氮基团，而赖氨酸侧链只有一个氮基团。另外，因为精氨酸的侧链可能形成更多的静电相互作用，所以它可以定位更加