一.反应体系
如下表所示,反应体积为20μL,在384微孔板中进行。
| 名称 | 用量 (μL) |
| 标准品或待测样品 | 5 |
| Biotin-CRBN/DDB1 | 5 |
| Thalidomide-Ac | 5 |
| Streptavidin-Eu | 5 |
| 总体积 | 20 |
二.试剂准备
(1)缓冲液准备
用ddH2O稀释检测缓冲液至1X。
(2)标准品或待测样品配制
使用稀释至1X的检测缓冲液进行待测样品和标准品的配制。若样品的储液为DMSO,建议保持体系中DMSO 含量一致,且最高不超过2%。试剂盒中Thalidomide 标准品为10mM DMSO 母液。请根据实验情况配制标准品总量,以下内容仅供参考。
| Standard | 配置方法 | 配制浓度 | 终浓度(nM) |
| Std10 | 1 μL标准品母液+ 82.3μL检测缓冲液 | 12000.00 | 30000 |
| Std9 | 10 μL std 10 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 40000 | 10000 |
| Std8 | 10 μL std 9 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 13333.3 | 3333.33 |
| Std7 | 10 μL std 8 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 4444.4 | 1111.11 |
| Std6 | 10 μL std 7 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 1481.5 | 370.37 |
| Std5 | 10 μL std 6 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 493.8 | 123.46 |
| Std4 | 10 μL std 5 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 164.6 | 41.15 |
| Std3 | 10 μL std 4 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 54.9 | 13.72 |
| Std2 | 10 μL std 3 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 18.3 | 4.57 |
| Std1 | 10 μL std 2 + 20 μL 检测缓冲液(含1.2% DMSO) | 6.1 | 1.52 |
| Std0 | 20μL 检测缓冲液 | 0 | 0 |
(3)蛋白配制
Biotin-CRBN/DDB1的母液为100X, 使用1X检测缓冲液100倍稀释后,每孔加样5μL, 例如,将2μL Biotin-CRBN/DDB11母液加入到198 μL 1X检测缓冲液中,即为200μL蛋白工作液。
(4)Thalidomide-Ac配置
Thalidomide-Ac母液浓度为100X,使用1X检测缓冲液100倍稀释后,每孔加样5μL, 例如,将2 μL Thalidomide-Ac母液加入到198 μL 1X检测缓冲液中,即为200μL工作液。
(5)检测试剂配制
Streptavidin-Eu母液浓度为50X,使用1X检测缓冲液100倍稀释后,每孔加样5μL, 例如,将2 μL Streptavidin-Eu母液加入到98 μL 1X检测缓冲液中,即为100μL工作液。
三.实验流程
将试剂配制后,轻柔混匀备用,按照下表进行加样。
| | 标准品 | 待测样品 | 阴性对照 |
| Step1 | 5μL稀释后的标准品 | 5μL待测样品(4X) | 5μL检测缓冲液 |
| Step2 | 5 μL Biotin-CRBN/DDB1 | 5 μL检测缓冲液 |
| Step3 | 封板混匀后,室温孵育30min |
| Step4 | 5 μL Thalidomide-Ac |
| Step5 | 5 μL Streptavidin-Eu |
| Step6 | 封板混匀后,室温孵育120min,读板 |
*孵育时用封板膜封板,防止试剂蒸发。
四.数据处理
计算每个孔位的受体和供体的发射信号的比值:
Ratio=(Signal 665nm/Signal 620nm)×104
计算CV(%):CV(%)=Ratio Deviation/Mean Ratio×100%
(1)标准曲线*
由图表可知,由于Thalidomide标准品与Thalidomide-Ac竞争与CRBN/DDB1的结合,使信号值降低。
(2)结合活性和抑制剂验证*
Thalidomide-Ac与CRBN/DDB1结合验证,由结果可知,蛋白浓度不变时,检测信号随着Thalidomide-Ac浓度的升高而增加。Lenalidomide和Pomalidomide以及PROTAC BET Degrader-1可以竞争Thalidomide-Ac与CRBN/DDB1的结合。
*数据仅做示例参考。