基于SILAC的质谱分析

基于SILAC的质谱分析是一种用于定量蛋白质组学的强大技术。SILAC，全称为Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture，是一种通过在细胞培养过程中引入稳定同位素标记氨基酸的方法，使得蛋白质内源性标记的技术。这种方法的核心在于通过摄入标记氨基酸（如^13C或^15N标记的赖氨酸和精氨酸），使得合成的蛋白质带有特定的同位素标记，从而在质谱分析中呈现出可区分的质量差异。基于SILAC的质谱分析的主要应用在于蛋白质的相对定量分析，这在研究细胞的代谢变化、信号传导途径、疾病发生机制以及药物作用等方面具有意义。在现代生物医学研究中，理解蛋白质的动态变化有助于揭示生物学过程的本质。基于SILAC的质谱分析通过其高精度和高灵敏度，能够识别和定量分析大量复杂样本中的蛋白质，使其成为研究细胞内蛋白质变化的理想选择。在癌症研究中，SILAC可以帮助科学家们分析肿瘤细胞在不同治疗条件下的蛋白质表达谱变化，进而找出潜在的治疗靶点。在神经科学中，利用SILAC可以研究神经元在不同发育阶段或应激条件下的蛋白质变化，揭示神经系统功能的调控机制。此外，基于SILAC的质谱分析还在药物开发研究中被广泛应用，通过分析药物处理前后细胞的蛋白质组变化，帮助识别药物的作用机制和毒性效应。

 

一、基于SILAC的质谱分析的流程

基于SILAC的质谱分析的流程通常包括以下几个步骤。首先是细胞培养阶段，将细胞分为两组或多组，其中一组用普通氨基酸培养，另一组用同位素标记的氨基酸培养。经过多代培养后，所有目标蛋白质均被标记。随后，收集细胞并进行裂解以提取蛋白质。接下来，通过蛋白质酶切、分离和质谱分析，研究人员可以识别和定量分析蛋白质。质谱数据处理是关键步骤之一，通过比对标记和非标记肽段的质谱峰，计算蛋白质的相对丰度。

 

二、基于SILAC的质谱分析的技术优势

基于SILAC的质谱分析相比于其他定量蛋白质组学技术具有显著优势。其一，SILAC方法在细胞内实现标签的内源性结合，大大减少了样品处理过程中的误差，提高了定量的准确性和可靠性。其二，SILAC实验可以在不破坏细胞生理状态的情况下进行，从而更真实地反映细胞内的蛋白质变化。此外，SILAC方法不需要额外的化学标记，避免了样品损失和复杂的化学反应，简化了实验流程。

 

三、基于SILAC的质谱分析的实验注意事项

在进行基于SILAC的质谱分析时，需要注意细胞的标记效率和培养条件，以确保完全和均匀的同位素标记。此外，蛋白质提取和酶切步骤需特别小心，以避免样品损失和降解。

 

百泰派克生物科技致力于为客户提供高质量的蛋白质组学解决方案。我们的专家团队能够根据您的研究需求，设计最适合的SILAC实验方案，并提供详细的定量分析报告。通过与我们的合作，您将获得准确、可靠的数据支持，以推动您的科研项目达到新的高度。无论是在基础研究还是应用开发中，百泰派克生物科技都是您值得信赖的合作伙伴。

 

百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商

 

相关服务：

基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

 

 

百泰派克生物科技特色项目

 

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

 

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

 

 

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

 

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

 

 

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

 

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

 

 

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

 

 

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

 

 

百泰派克生物科技七大检测平台

 

 

 

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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