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DIA磷酸化蛋白质组
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北京易默基因科技有限公司
实验原理
磷酸化是一种普遍的存在的调节蛋白质功能的翻译后修饰(PTM),占所有蛋白修饰的三分之一左右,影响细胞内信号转导、细胞增殖、凋亡、转录、代谢过程等等。在真核细胞中,磷酸化修饰只发生在丝氨酸(S)、苏氨酸(T)和酪氨酸(Y)这三种氨基酸的侧链上,细胞内pS:pT:pY的相对丰度比为1800:200:1。这些氨基酸有一个亲核(OH)基团,在激酶的催化作用下,将ATP的磷酸根基团,
转移到蛋白的氨基酸侧链上,ATP随之变为ADP。蛋白质磷酸化是一种可逆的PTM,由激酶和磷酸酶介导,分别使底物磷酸化和去磷酸化。具有磷酸化修饰的多肽相较于无磷酸化修饰的多肽多出79.9663Da的分子量,利用质谱技术测定是否发生79.9663Da的质量偏移,推测序列级磷酸化修饰位点。。
实验流程
首先,确定检测方案并收集样本;样本收集完成后进行前期处理,包括样本提取及蛋白质检;将蛋白质进行酶切后,富集磷酸化修饰肽段;液质联用质谱仪进行DIA质谱检测;利用软件进行蛋白组的定性、定量分析。
应用方向
大样本量磷酸化修饰检测
临床诊断、疾病机理机制研究、个性化治疗研究
生物/非生物胁迫,生长发育等
致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等
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