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- 详细信息
- 技术资料
- 提供商:
北京诺禾致源科技股份有限公司
- 服务名称:
二代建库测序/纯测序
短周期、高质量
建库测序产品是以自动化建库平台、自动化质控流程和高性能的计算平台为技术依托,对合作伙伴提供的合格样品进行建库并运用二代测序平台测序,或者对合作伙伴提供的合格文库直接进行测序,产出高质量的测序数据提供给客户进行生物信息学分析。诺禾优势
1. 多元化精准的产品类型
| DNA文库 | RNA文库 | PCR-free文库 | 自建库 |
|---|---|---|---|
| 非常规小片段文库 宏基因组文库 人外显子文库 人重测序文库 全基因组DNA甲基化文库 ChIP-seq文库 RAD文库 | 普通转录组文库 链特异性转录组文库 原核链特异性文库 宏转录组文库 lncRNA文库 sRNA文库 circRNA | 扩增子文库 PCR产物文库 基因组PCR-free文库 | 自建库散样 自建库包lane 自建库包flow cell |
2.全方位详尽的测序策略
| 测序平台 | 测序策略及形式 | 数据产出 |
|---|---|---|
| Novaseq 6000 | PE150纯测序散样/包lane/包FC | 800G/lane 3.2T/flowcell |
| PE250纯测序散样/包lane/包FC | 400M/lane 800M/flowcell | |
| SE50纯测序散样/包lane/包FC | 400M/lane 800M/flowcell | |
| PE50纯测序包FC | 800M/flowcell | |
| Novaseq X Plus | PE150纯测序散样/包lane/包FC | 1000G/lane 3.2T/flowcell |
| DNBSEQ-T7 | PE150纯测序散样/包lane/包FC | 1.5T/lane 800M/flowcell |
3.高质量的数据产出
诺禾致源建库测序平台获得 illumina 颁发的 CSPro 资质证书,并成为 illumina 在中国大陆的 IGN 人重测序服务商。我们承诺的测序数据指标均高于 illumina 官方标准,可在测序服务合同中体现。
| 测序策略 | 数据量交付标准 | 数据质量交付标准 |
|---|---|---|
| SE50 | ≥平均测序数据量的98% | 平均Q20≥90%,平均Q30≥85% |
| PE150 | ≥平均测序数据量的98% | 平均Q20≥90%,平均Q30≥85% |
| PE250 | ≥平均测序数据量的98% | 平均Q20≥90%,平均Q30≥85% |
4.极速的项目周期
诺禾致源依托柔性智能交付平台 Falcon ,满足四大产品类型(WGS、WES、RNAseq、建库测序产品)共线并行的交付,极大的提高了产品交付周期和数据质量。
常见问题
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1. 二代测序错误率为什么开始和末期会升高?
- (1)测序错误率用E表示,碱基质量值用Q表示,Qphred=-10log10(e)Q30/Q20对应碱基正确率99.9%和99%。
(2)一般测序片段前段几个bp以及片段末端的错误率会偏高;测序错误率会随片段长度增加而升高,这是由于化学试剂消耗造成的,是Illumina平台的共有特征。(非常规片段文库测序质量Q20、Q30会降低一些)。
- (1)测序错误率用E表示,碱基质量值用Q表示,Qphred=-10log10(e)Q30/Q20对应碱基正确率99.9%和99%。
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2. 文库产出均一性指什么
- 测序时,同一条lane中的文库,产出数据量与文库加入量保持均一。例如混5个库,共得到50G数据,不会出现某一文库数据量30G而另一文库数据量只有5G的现象,要均等的每个库为10G。
-
3. 基因组污染对RNA测序的影响?
- 基因组污染会影响RNA的准确定量,会对后期建库及库容的计算造成影响;其次如果磁珠富集过后的RNA还存在基因组污染,会在后续的RNA建库过程中引入基因组的数据,对后续的分析产生影响。 可通过DNA酶消化去除,或PCR后切胶。
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4. 文库库检出现接头污染/含小片段如何处理?
- 对于接头污染或引物二聚体污染可用磁珠纯化加以处理,而小片段文库只能切胶纯化,纯化效率一般在30%左右,风险比较高。
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