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文献和实验文献速递:个性化循环肿瘤 DNA 可成为免疫治疗疗效新型biomarker
(IF=23.5/中科院一区)杂志上发表的题为 Personalized circulating tumor DNA analysis as a predictive biomarker in solid tumor patients treated with pembrolizumab的研究成果发现肿瘤释放到血液中的循环肿瘤DNA(ctDNA)的水平变化能够预测患者的免疫治疗疗效[1]。这项发现无疑为免疫治疗打开了新的突破口。 该研究团队发起了一项包括头颈部鳞状细胞癌 (SCCHN)、三阴
expression , SAGE )、 RT-PCR 等。目前,高通量检测基因组 mRNA 丰度的方法主要是 cDNA 微阵列、寡核苷酸芯片,它们的原理是相同的,即利用 4 种核苷酸之间两两配对互补的特性,使两条在序列上互补的单核苷酸链形成双链,这个过程被称为杂交。基本技术路线是:制备芯片,在一个约 1cm 2 大小的玻璃片上,将称为探针的 cDNA 或寡核苷酸片段固定在上面;从细胞或组织中提取 mRNA ,通过 RT-PCR 合成荧光标记的 cDNA ,与芯片杂交;用激光显微镜或荧光显微镜检测杂交后的芯片
即可包括。 2.提高检测的灵敏度和特异性。如检测系统的优化组合和采用高灵敏度的荧光标志。多重检测以提高特异性,减少假阳性。 3.高自动化、方法趋于标准化、简单化,成本降低。价格高昂是目前推广应用的主要障碍之一,但随着技术的革新,基因芯片的价格将会大大降低。 4.高稳定性。寡核苷酸探针、RNA均不稳定,易受破坏。而肽核酸(PNA)有望取代普通RNA/DNA探针,可以确保探针的高稳定性。 5.研制新的应用芯片,如1999年美国环保局(EPA)组织专家研讨会,讨论了毒理学芯片的发展策略。近来多种
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