- 询价
- 2026年04月29日
企业认证
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 询价记录
- 文献和实验
- 技术资料
真菌核糖体基因转录间隔区（Internal Transcribed Spacer,ITS），位于真菌核糖体 DNA（rDNA）上 18S 和 28S 基因之间的区域片段，主要包括 ITS1，5.8S rDNA，ITS2，其两侧分别是 18S RNA 基因和 28S RNA 基因。ITS 序列由于选择压力小，在自然中变异快，在绝大多数真菌中表现出序列多态性，表现为种内相对一致，种间差异比较明显。ITS 测序即是对 ITS1 或者 ITS2 进行测序，非常适合真菌鉴定以及系统发育分析。
1.基于权威数据库，鉴定真菌到“种”；
2.优化的扩增引物和反应条件，使菌种鉴定更丰富更准确；
3.真菌群落多样性分析内容丰富，菌落鉴定、丰度与结构分析，系统进化分析等。
二、测序策略 ：MiSeq，PE300。
三、技术路线：基因组 DNA→ITS 区PCR 扩增→扩增产物回收纯化→上机测序→数据分析。
四、分析内容：1.原始数据的产出统计与预处理；
2.数据拼接及质量评估和长度分布统计；
3.两组或多组比较 Venn 图，物种累积曲线（species accumulation curves）；
4.Alpha 多样性分析（稀疏曲线，Shannon 指数，Simpson 指数，Chao1 指数）；
5.Beta 多样性分析（PCoA 分析，UPGMA 分析，PCA 分析，NMDS 分析，Anosim 分析）；
6.比对到 RDP 和 unite，进行物种分类；
7.单样本群体结构分析(“鉴定到种”)；
8.聚类分析(Heatmap 图分析)和柱状图分析；
9.组间差异分析；
10.系统发育进化树（Phylogenetic trees）构建。
五、样本类型：1.菌体，环境样品，总 DNA 等；
2.建议总 DNA 起始量：>20ng(较纯 DNA，无宿主及其他杂质污染)。
风险提示：丁香通仅作为第三方平台，为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全，合理判断，谨慎选购商品，商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品，请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
- 作者
- 内容
- 询问日期
文献和实验454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展，科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破：首先是解决了高通量测序问题；其次它简 化了样品准备步骤，将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了；最后， 它缩小了测序反应体积，节省了 试剂 。这样，454测序仪做到了以极其低廉的价格进行大规模平行测序反应。 它的测序规模之大、测序费用之低
NGS已成为生命科学领域中基因组学和转录组学研究的金标准。虽然它与桑格测序等方法有某些核心相似之处，但NGS所能实现的绝对的高通量水平使它与其他方法截然不同，并彻底改变了科学家的工作方式。 RNA测序(RNA-seq)尤其处于NGS功能应用的前言沿。RNA-seq最简单的形式允许我们在取样时确定样本中的RNAs的丰度。转录组是一个高度动态的细胞特征，并打开了一个巨大发掘潜力的世界。对药物、各种疾病状态、转录后修饰和选择性剪接转录本的反应变化只是 RNA-Seq 使其能够发现的一些例子
HeliScope测序仪是由Quake团队设计开发的，它实际上也是一种循环芯片测序设备。不过，HeliScope 测序仪最大的特点是无需对测序模板进行扩增，它使用了一种高灵敏度的荧光探测仪直接对单链DNA模板进 行合成法测序。首先，将基因组DNA切割成随机的小片段DNA分子，并且在每个片段末端加上poly-A尾。然 后通过poly-A尾和固定在芯片上的poly-T杂交，将待测模板固定到芯片上，制成测序芯片。最后借助聚合酶 将荧光标记的单核苷酸掺入到引物
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
