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上海经科化学科技有限公司
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5µg
pLenti-IN-PP5K-sgRNA (IN-PP5K基因敲除质粒)是一种在动物细胞中可以同时表达Cas9、目的基因的sgRNA和puromycin抗性基因的质粒。用于在动物细胞中直接基于CRISPR/Cas9技术敲除目的基因,或者通过包装慢病毒后基于CRISPR/Cas9技术敲除目的基因。本质粒中sgRNA的有效性已经通过T7EI法的验证。
本质粒在细菌中为Amp抗性,全长约13,000bp。本质粒的关键图谱信息请参考图1。本质粒可直接转染细胞用于目的基因的CRISPR/Cas9敲除,以及通过puromycin筛选稳定细胞株;也可以与pMDLg、Rev及VSV-g共转HEK293T细胞进行重组慢病毒(lentivirus)的包装,然后再用于感染细胞或组织并进行目的基因的CRISPR/Cas9敲除。

图1. 表达sgRNA、Cas9和puromycin抗性的pLenti-sgRNA质粒关键图谱信息。
本质粒中的sgRNA基于碧云天研发的CRISPR/Cas9 sgRNA快速筛选和验证体系获得,sgRNA的有效性已经通过T7EI法验证。
本质粒用于实验时,建议同时选购无任何靶向的对照质粒pLenti-Control-sgRNA (L00011)或靶向GFP的对照质粒pLenti-GFP-sgRNA (L00013)。
碧云天同时提供基于CRISPR/Cas9技术的IN-PP5K基因敲除的质粒(L27965 pLenti-IN-PP5K-sgRNA)、慢病毒(L27966 IN-PP5K Knockout Lentivirus)、HEK293T细胞(L27967 IN-PP5K Knockout HEK293T Cells)、HEK293T敲除细胞的RIPA裂解液(L27968 IN-PP5K Knockout HEK293T RIPA Lysate)、HEK293T敲除细胞的Trizol裂解液(L27969 IN-PP5K Knockout HEK293T Trizol Lysate)等产品,具体请在碧云天网站查询或在本产品网页点击相应产品。
IN-PP5K基因的基本信息如下:
| Species | Gene Symbol | Gene ID | GenBank Accession | Transcript |
| Human | IN-PP5K | 51763 | BC004362 | NM_016532 |
| About the gene | |
| Official Symbol | IN-PP5K |
| Previous Symbol | - |
| Official Full Name | inositol polyphosphate-5-phosphatase K |
| Synonyms | SKIP |
| Location | 17p13.3 |
| Gene Type | protein-coding gene |
| Uniprot ID | Q9BT40 |
| Pathway/Library | others |
| Gene Summary | This gene encodes a protein with 5-phosphatase activity toward polyphosphate inositol. The protein localizes to the cytosol in regions lacking actin stress fibers. It is thought that this protein may negatively regulate the actin cytoskeleton. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. |
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文献和实验8、 MACC1,MYO6,NOB1,PP4R1,PP5,PPM1D,RPS15A,TCTN1,TPD52L2,USP39 和 ZFX)进行了研究。图片来源:BioRxiv研究人员在先前的研究中就发现了一些频繁出错的核苷酸序列,这些存在错误序列的论文大都研究了在癌细胞中敲除单个人类基因对于癌细胞系的影响,故而他们将这些论文命名为单基因敲除论文(SKG)。图片来源:BioRxiv有趣的是,在单基因敲除论文这个大类中,存在许多的重复性序列错误,而大多数(159 / 174, 91%)SGK 论文由中国大陆作者发表
CRISPR/Cas9 基因敲除实验-- sgRNA 及引物设计
前期记录先确定目标基因CRISPR/Cas9 基因敲除实验 -- 确定目标基因然后对目的基因进行背景调查CRISPR/Cas9 基因敲除实验-- 目标基因背景调查设计 sgRNA 及引物CRISPR-Cas9 基因敲除 sgRNA 设计CRISPR-Cas9 基因敲除 sgRNA 设计好之后对前期文章的补充:设计 sgRNA 之后,需要对结果进行判断:但为什么 0.7044 分数的哪一个没有选,我也不知道为什么,总感觉他们的顺序不是随意的排的。或许有人能解答一下为什么。顺手把设计工具的解说放上
最近 CRISPR/Cas9 基因敲除技术可谓风靡全世界的实验室,CRISPR 被称为规律成簇间隔短回文重复,其实际上就是一种基因编辑器,是细菌用以保护自身对抗病毒的一个系统。后来,研究人员发现,它似乎是一种精确的万能基因武器,可以用来删除、添加、激活或抑制其他生物体的目标基因。由于其相对于前几代基因敲除技术而言更为简便高效。所以一经问世便受到科研界的热捧。利用 Cas9 质粒建立 knock-out 细胞系实验过程主要有以下几步:1. 确定待敲除基因的靶位点;2. 设计识别靶位点识别的一对
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