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上海经科化学科技有限公司
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5µg
pLenti-XBP1-sgRNA (XBP1基因敲除质粒)是一种在动物细胞中可以同时表达Cas9、目的基因的sgRNA和puromycin抗性基因的质粒。用于在动物细胞中直接基于CRISPR/Cas9技术敲除目的基因,或者通过包装慢病毒后基于CRISPR/Cas9技术敲除目的基因。本质粒中sgRNA的有效性已经通过T7EI法的验证。
本质粒在细菌中为Amp抗性,全长约13,000bp。本质粒的关键图谱信息请参考图1。本质粒可直接转染细胞用于目的基因的CRISPR/Cas9敲除,以及通过puromycin筛选稳定细胞株;也可以与pMDLg、Rev及VSV-g共转HEK293T细胞进行重组慢病毒(lentivirus)的包装,然后再用于感染细胞或组织并进行目的基因的CRISPR/Cas9敲除。

图1. 表达sgRNA、Cas9和puromycin抗性的pLenti-sgRNA质粒关键图谱信息。
本质粒中的sgRNA基于碧云天研发的CRISPR/Cas9 sgRNA快速筛选和验证体系获得,sgRNA的有效性已经通过T7EI法验证。
本质粒用于实验时,建议同时选购无任何靶向的对照质粒pLenti-Control-sgRNA (L00011)或靶向GFP的对照质粒pLenti-GFP-sgRNA (L00013)。
碧云天同时提供基于CRISPR/Cas9技术的XBP1基因敲除的质粒(L32280 pLenti-XBP1-sgRNA)、慢病毒(L32281 XBP1 Knockout Lentivirus)、HEK293T细胞(L32282 XBP1 Knockout HEK293T Cells)、HEK293T敲除细胞的RIPA裂解液(L32283 XBP1 Knockout HEK293T RIPA Lysate)、HEK293T敲除细胞的Trizol裂解液(L32284 XBP1 Knockout HEK293T Trizol Lysate)等产品,具体请在碧云天网站查询或在本产品网页点击相应产品。
XBP1基因的基本信息如下:
| Species | Gene Symbol | Gene ID | GenBank Accession | Transcript |
| Human | XBP1 | 7494 | BC000938 | NM_005080 |
| About the gene | |
| Official Symbol | XBP1 |
| Previous Symbol | XBP2 |
| Official Full Name | X-box binding protein 1 |
| Synonyms | - |
| Location | 22q12.1 |
| Gene Type | protein-coding gene |
| Uniprot ID | P17861 |
| Pathway/Library | others |
| Gene Summary | This gene encodes a transcription factor that regulates MHC class II genes by binding to a promoter element referred to as an X box. This gene product is a bZIP protein, which was also identified as a cellular transcription factor that binds to an enhancer in the promoter of the T cell leukemia virus type 1 promoter. It may increase expression of viral proteins by acting as the DNA binding partner of a viral transactivator. It has been found that upon accumulation of unfolded proteins in the endoplasmic reticulum (ER), the mRNA of this gene is processed to an active form by an unconventional splicing mechanism that is mediated by the endonuclease inositol-requiring enzyme 1 (IRE1). The resulting loss of 26 nt from the spliced mRNA causes a frame-shift and an isoform XBP1(S), which is the functionally active transcription factor. The isoform encoded by the unspliced mRNA, XBP1(U), is constitutively expressed, and thought to function as a negative feedback regulator of XBP1(S), which shuts off transcription of target genes during the recovery phase of ER stress. A pseudogene of XBP1 has been identified and localized to chromosome 5. |
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文献和实验CRISPR/Cas9 基因敲除实验-- sgRNA 及引物设计
前期记录先确定目标基因CRISPR/Cas9 基因敲除实验 -- 确定目标基因然后对目的基因进行背景调查CRISPR/Cas9 基因敲除实验-- 目标基因背景调查设计 sgRNA 及引物CRISPR-Cas9 基因敲除 sgRNA 设计CRISPR-Cas9 基因敲除 sgRNA 设计好之后对前期文章的补充:设计 sgRNA 之后,需要对结果进行判断:但为什么 0.7044 分数的哪一个没有选,我也不知道为什么,总感觉他们的顺序不是随意的排的。或许有人能解答一下为什么。顺手把设计工具的解说放上
最近 CRISPR/Cas9 基因敲除技术可谓风靡全世界的实验室,CRISPR 被称为规律成簇间隔短回文重复,其实际上就是一种基因编辑器,是细菌用以保护自身对抗病毒的一个系统。后来,研究人员发现,它似乎是一种精确的万能基因武器,可以用来删除、添加、激活或抑制其他生物体的目标基因。由于其相对于前几代基因敲除技术而言更为简便高效。所以一经问世便受到科研界的热捧。利用 Cas9 质粒建立 knock-out 细胞系实验过程主要有以下几步:1. 确定待敲除基因的靶位点;2. 设计识别靶位点识别的一对
和RecBCD蛋白组成,在基因敲除时必须以环状质粒存在)、结合转化敲除系统及温度敏感型质粒敲除系统等可供选择。 2 FLP-FRT系统和Cre-loxP系统 这两个系统都是位点特异性重组酶系统,其中FLP-FRT源于酿酒酵母,Cre-loxP源于F1噬菌体。两个系统的基本原理类似。以Cre-loxP系统为例,该系统含有两种成分:第一个部分是一段长34 bp的重组酶识别的DNA序列(loxP),其中含有两个13 bp的反向重复序列和一个8 bp的核心序列;第二个是Cre
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