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北京百泰派克生物科技有限公司
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Edman降解的设计方法
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Edman降解(Edman degradation)是鉴定蛋白质一级结构的化学方法,是测定蛋白质、多肽或者氨基酸残基序列的一种技术。
通过预先完善Edman降解的设计方法可在一定程度上提升蛋白测序试验的成功率,是蛋白质测序过程中一个非常重要的步骤。Edman降解的具体设计方法主要分为以下几个部分。
蛋白质裂解过程:由于Edman降解法不能对超过60个氨基酸的肽段进行测序分析,因此,对于长肽段的测序,需要将长肽段裂解为氨基酸个数在Edman降解的测序范围内的短肽段。裂解过程可使用内肽酶(如胰蛋白酶或胃蛋白酶)或者化学试剂(如xiùhuàqíng)进行。之后依次对短肽段进行测序,通过片段间的重叠拼接整体蛋白质的序列信息。
Edman反应过程:可将待测序的蛋白质吸附到固体表面上,常见的一种固体基材是涂有聚丁二烯(一种阳离子聚合物)的玻璃纤维。将Edman试剂苯基异硫氰酸酯(PITC)与弱碱性缓冲溶液(pH=8.0-9.0,如12%三jiǎàn)一起添加到吸附的蛋白质中,与氨基酸N端的α游离氨基进行反应,形成末端残基的苯硫代氨基甲酰基(PTC)衍生物,即PTC-肽。
加酸裂解:即添加无水酸(如三fúyǐsuān)来选择性的分离N末端氨基酸,此时PTC衍生物发生异构化生成替代物苯基硫代乙内酰脲,通过洗脱替代物并进行色谱鉴定即可对得到的氨基酸残基进行检测。
蛋白质鉴定:重复以上化学反应循环,将每个循环中从蛋白质或肽段N末端释放出的氨基酸经过层析或高效液相色谱法(HPLC)检测,即可识别并鉴定所得氨基酸。
百泰派克生物科技采用岛津公司Edman测序系统,为广大科研工作者和科研客户提供基于Edman降解的蛋白质N端测序服务。采用我们的测序系统,可以测定N端30个氨基酸的序列信息。采用特定的蛋白上样系统,可以测定N端的60-70个氨基酸。百泰派克生物科技也建立了以先进的LC-MS/MS技术进行N-端测序的平台,可以测出封闭和修饰的蛋白质末端,与基于Edman降解的蛋白质N端测序形成互补,保证N端测序服务的顺利进行。
其他服务项目

优质检测平台
(1)基于生物化学、分子生物学、色谱的检测分析平台
该平台配备了Agilent 2100 生物分析仪、ProteinSimple凝胶成像系统、高效液相色谱系统,为蛋白质组学、代谢组学分析保驾护航,包括样品制备、分离纯化分子量测量、杂质表征表达研究等:
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文献和实验Edman降解是蛋白质测序中一个非常重要的反应步骤,因为通过该反应可以对蛋白质有序的氨基酸组成进行分析。自动化Edman测序仪现在已得到广泛使用,他们能够对长约50个氨基酸的肽进行测序。以下概括了使用Edman降解进行蛋白质测序的步骤,随后还将对其中一些重要步骤做详细说明。1. 用2-巯基乙醇等还原剂破坏蛋白质中的任意二硫键,过程中可能需要一个保护基团(例如碘乙酸)以防止化学键重新形成;2. 果蛋白质不止一个,则需要分离并纯化蛋白质混合物中的各条肽链;3. 确定每条链中的氨基酸组成;4. 确定
埃德曼降解法Edman degradation method
蛋白质或肽的氨基末端分析法之一。由埃德曼( P. Edman)所创立。即在弱碱性条件下使之与异硫氰酸苯酯反应,然后用酸处理,从多肽链上仅使氨基末端残基以氨基酸的苯基乙内酰硫脲衍生物的形态游离出来,然后进行分析。根据反应试剂或衍生物的缩写,本法亦称 PTC法或 PTH法。在第一个氨基末端残基游离后,对剩余的多肽链如适用于同一反应,则可游离出下一位置的残基。如此反复操作,有可能从末端决定氨基酸排列顺序,据此原理设计出来的氨基酸自动序列仪( amino acid
的方法是对B细胞的转录子或遗传物质进行测序。该方法适用于杂交瘤,噬菌体展示,酵母菌展示或单细胞筛选,是抗体测序法中最具成本效益和最可靠的方法。但是,源细胞并不一定总是可用的。如果杂交瘤丢失,就可能无法获得遗传物质。在这种情况下,可以使用抗体测序来复原抗体序列,例如使用Edman降解或质谱分析技术。 基于Edman降解法的测序 Edman降解法,也称为埃德曼测序法,是一种成熟的蛋白质序列测定技术,该技术从N端开始,一次读取一个氨基酸。Edman降解法测序的主要优势是样品量要求低(通常需要少于
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