CV21-Zero Background pTOPO-TA/Blunt Cloning Kit ( 零背景pTOPO-TA/Blunt 通用克隆试剂盒)

► 本 TOPO 载体连接体系按照 10 μl 一次计算可以用 20 次,如果按照其它公司产品 5 μl 一次计算,使用次数可以增加一倍,20 次可用 40 次。
▲ -20℃储存,至少 12 个月。冰袋运输,1-2 天置于室外常温不影响质量。
本制品和传统的 T4 连接酶原理不同,它利用了 Topoisomerase 可以在瞬间(几秒钟 - 几分钟)、高效(接近 100%)连接 DNA 片段的原理采用本公司独创的工艺制成。
- 可以在瞬间(几秒钟 - 几分钟)完成任意 PCR 产物(兼容 A 末端 / 平末端)连接。
- 特制的新型载体质粒大小仅仅不到 2kb,充分发挥了 TOPO 载体越小,可容纳片段越大的优势,最大限度提高了大片段连接效率;连接后质粒大小比传统超过 2kb 以上,质粒越小,转化效率越高,极大的提高了各种片段连接后的转化子数量。
- 采用氨苄抗性载体只需 0-10 分钟复苏时间,比卡那抗性载体 1 小时复苏时间缩短 6 倍。
- 最终可以省略 1 小时复苏步骤,热休克冰浴后,不用加 LB 复苏,直接将感受态涂板即可。从连接到涂板全程只需 15 分钟。
- 自杀基因零背景原理,无自连假阳性,无需蓝斑白班筛选和菌落 PCR 筛选。大片段情况下随机挑一个克隆便是有插入的(接近 100%)。
- 连接部分能力远超传统 TA 克隆体系,可连接长达 10 kb 片段(例如连接 5 kb 片段,也可能达到挑 10 个菌落,至少 8 个是有插入的效果),是新一代世界领先的简单、快速、零背景免筛选的 TOPO TA 克隆载体。
测序只能采用 M13F/M13R 通用引物测序(见后面图谱),但是不能采用 M13 (-47)/M13 (-48) 通用引物测序。
PCR 引物使用正常设计的引物即可,不需做任何改变(不能用磷酸化引物)。任意 PCR 产物(兼容 A 末端 / 平末端)均可以直接连接。PCR 产物一般建议做回收纯化(货号:DR01),这样可以避免后续可能的问题。如果 PCR 产物同时有条带、无非特异性条带引物二聚体,也可尝试直接进行连接反应。如果是以质粒为模板的 PCR 产物则最好进行纯化,因为模板质粒也可能长出菌落(但不是想构建的目的载体)。
- 室温设立 10 μl 连接体系(建议用 0.2 ml PCR 管,PCR 仪器控温):
| 试剂 |
用量 |
| 纯化后的 PCR 产物或者 1 μl 1000 bp Control |
0.5-5 μl |
| pTOPO-TA/Blunt Vector |
2 μl |
| 10 × Enhancer |
1 μl |
| 灭菌水 |
X μl |
| 总体积 |
10 μl |
加完试剂后,用移液器轻轻吹打混匀或者轻弹管底混匀,低速瞬时离心收集所有液体在离心管底,注意此步骤不能在冰上进行,只能在室温(25℃-37℃)进行。
▲ 如果使用 5 μl 体系连接,各成分按照比例减半使用,使用次数可以加倍。
不同大小插入片段的推荐用量(注意过量太多了,反而导致转化子减少):
- 37℃连接 5 分钟(建议置 PCR 仪器上控温)。
▲ 本载体推荐室温(25℃-37℃)5 分钟完成连接。长片段或者连接困难片段可以延长连接时间到 10-15 分钟,温度可选 37℃,可显著增加转化子数量。
- 连接产物置于冰上备用。立即接标准的感受态转化步骤或者快速转化步骤。
- 感受态细胞从 - 80℃拿出,迅速插入冰浴中,解冻融化(约 1-3 分钟左右)。
- 立刻加入 5 μl 连接液 (最多可 10 μl 连接液全加入,只要体积不超过感受态细胞体积的 1/10),手指拨打 (Flick) 离心管底轻轻混匀 (避免用枪吸打),冰浴放置 5 分钟。
- 热休克:42℃水浴热休克 60 秒,迅速放回冰浴静置 2-3 分钟,该过程不要摇动离心管。
▲ 本公司技术连接效率比竞争对手高 10-100 倍,所以如果后续发现转化子很多,甚至长满板子,做完热休克步骤后,可以省略步骤 4(复苏),直接将热休克冰浴后的感受态细胞涂板,培养过夜即可。这样从连接到涂板全过程仅需要 15 分钟,超快速流程极大的简化了操作,缩短了时间。
- 复苏(可选步骤):加入 500 μl LB 或者 SOC 培养基 (不含抗生素),37℃200 rpm 振荡培养 10-20 分钟。
▲ 根据我们的经验,一般可以直接将培养基(如从冰箱取出温度低,应事先置 37℃ 水温回温至 22-37℃)加入到感受态细胞的 1.5 ml 离心管,盖上离心管盖,水平固定在振荡培养箱中振荡培养复苏即可,不需要转移到试管培养复苏。
▲ 一般商品化的感受态细胞不超过 2 kb 插入片段情况下,热休克后 10-15 分钟复苏可以得到足够多转化子,如果想使用实验室自制的感受态细胞、或者转化子少、插入片段长的情况下,可以提高复苏时间到 30-60 分钟以得到更多的转化子。
▲ 本公司技术连接效率比竞争对手高 10-100 倍,追求最简单最快速的用户可以尝试省略步骤 4(复苏),直接将热休克冰浴后的感受态细胞涂板,培养过夜即可。熟悉快速化流程后,以后这样从连接到涂板全过程仅需要 15 分钟,超快速流程极大的简化了操作,缩短了时间。
- 取 100-200 μl 菌液涂板 (培养板含氨benzylpenicillin 100 μg/ml),培养过夜。
本制品采用自杀基因零背景原理,无插入自连的细菌会自杀无法生长,因此几乎没有假阳性,一般情况下,可以达到所见即所得,只要是长出来的菌落正常(不是污染的杂菌,转化子数量也不算太少),基本就 100% 包含插入。因此插入片段不超过 2-3kb 的情况下强烈建议不做菌落 PCR 鉴定,直接挑 1-2 个菌去测序。
- 一般本公司 TOPO 载体阳性率非常高,所以菌落生长正常,数量也不是太少的情况下建议直接去测序(强烈建议不做菌落 PCR 筛选)。注意测序引物不能采用 M13 (-47)/M13 (-48) 通用引物测序。
- TOPO 载体的菌落 PCR 结果容易出现假阴性(就是菌 P 失败显示没有插入或者扩增大小不对,实际却是有插入的)。因此在使用菌 P 鉴定的情况下,如果菌 P 结果阴性,一般可以相信此结果。如果结果是阳性,或者显示扩增出大小和预期不符合,一般不可信,要考虑到菌 P 结果假阳性的可能,需要直接去测序鉴定,测序成功的完成实验;测序不成功的可以进一步提取质粒跑电泳看大小,或者酶切鉴定来确认。
- 用上述培养的白色菌落的菌液抽提质粒,插入片段较大的情况下,直接跑电泳看质粒大小就直接能鉴定出有插入的质粒,还可用 EcoR I/Ecor V 单酶切释放插入片段或用其它合适的酶切,琼脂糖凝胶电泳检查片段大小,确定是否含有目的片段。

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