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碧云天的化学发光法RNA EMSA试剂盒(Chemiluminescent RNA EMSA Kit),简称化学发光法REMSA试剂盒或Chemiluminescent REMSA Kit,是一种高效、灵敏的通过化学发光法检测生物素(Biotin)标记的RNA EMSA探针及其与蛋白质相互作用的试剂盒。
RNA结合蛋白(RNA binding proteins, RBPs)调控RNA的加工、成熟、运输、稳定性、翻译和降解,以促进细胞的生存和生长[1,2]。研究RNA和蛋白的相互作用对正常的细胞功能和调节至关重要,而这种相互作用的检测通常需要使用放射性标记的RNA探针进行放射性EMSA (Electrophoretic mobility shift assay)或2D蛋白质凝胶电泳(2D protein gel electrophoresis)。EMSA是一种灵敏的技术,是基于DNA/RNA-蛋白复合物在聚丙·烯酰胺凝胶电泳中有不同迁移率的原理,可用于鉴定蛋白质与核酸的相互作用。该技术提供了研究DNA或RNA结合蛋白和鉴定核酸底物的有效方法[3]。在RNA EMSA实验中,末端标记的RNA探针与特定蛋白结合,形成RNA-蛋白复合物。经聚丙·烯酰胺凝胶电泳,RNA-蛋白复合物的迁移速度比游离的RNA探针慢,可以观察明显的位移条带,即可判断RNA和蛋白的相互作用。传统的放射性EMSA技术程序繁琐,耗时较长,需要2-3天才能获得结果。本试剂盒为基于生物素标记探针的非放射性EMSA试剂盒(Biotin-EMSA),采用了高灵敏度的化学发光技术,利用高质量的Streptavidin-HRP Conjugate和BeyoECL Moon (一种极超敏的以luminol为基础的ECL类化学发光试剂)对生物素标记的RNA探针进行检测,轻松实现了RNA EMSA,实验时间大大缩短,约7-8个小时即可完成。
为验证整个化学发光法RNA EMSA实验条件和体系,本试剂盒提供了阳性对照系统,包含阳性蛋白、生物素标记RNA阳性探针、未标记RNA阳性探针。本试剂盒中的阳性探针与阳性蛋白能很好的结合,产生明显的位移带(Shift band)。使用本试剂盒对于阳性蛋白、HeLa细胞的细胞核蛋白和细胞浆蛋白的RNA EMSA效果参考图1。

图1.碧云天化学发光法RNA EMSA试剂盒(GS606)对阳性蛋白、HeLa细胞的细胞核蛋白和细胞浆蛋白的检测效果图。对于阳性蛋白及HeLa细胞的细胞核蛋白和细胞浆蛋白,包含阴性对照反应(样品1、4、8)、蛋白样本-RNA探针的结合反应(样品2、5、9)和未标记探针冷竞争反应(样品3、6、10);对于HeLa细胞的细胞核蛋白和细胞浆蛋白,由于含有内源性Biotin标记的蛋白,同时设置了蛋白本身的对照(样品7、11)。对于含有内源性Biotin标记蛋白引起的条带(Endo biotin-protein band),可以使用碧云天的生物素检测封闭试剂盒(P0101)降低内源性背景,但可能不会完全消除,若实验中目的蛋白较纯或者样品量较大,可缩短曝光时间以降低背景杂带。实际结果会因蛋白种类、纯度、电泳条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
本试剂盒采用了非特异性结合比Avidin更低的Streptavidin,使检测结果背景更低灵敏度更高。
本试剂盒可以用于100个蛋白和探针的结合反应和完整的10次阳性对照结合反应,并足够检测至少10块有生物素标记RNA EMSA探针的膜。
包装清单:
| 产品编号 | 产品名称 | 包装 |
| GS606-1 | REMSA Binding Buffer (10X) | 120μl |
| GS606-2 | REMSA/Gel-Shift上样缓冲液(无色,10X) | 200μl |
| GS606-3 | REMSA/Gel-Shift上样缓冲液(蓝色,10X) | 200μl |
| GS606-4 | BeyoECL Moon A液 | 55ml |
| GS606-5 | BeyoECL Moon B液 | 55ml |
| GS606-6 | Streptavidin-HRP Conjugate | 100μl |
| GS606-7 | 封闭液 | 380ml |
| GS606-8 | 洗涤液(5X) | 250ml |
| GS606-9 | 检测平衡液 | 250ml |
| GS606-10 | 生物素标记RNA阳性探针 | 30μl |
| GS606-11 | 未标记RNA阳性探针 | 10μl |
| GS606-12 | 阳性蛋白 | 20μl |
| — | 说明书 | 1份 |
保存条件:
-20℃保存,至少一年有效。BeyoECL Moon A液、BeyoECL Moon B液、封闭液、洗涤液(5X)和检测平衡液可以4℃保存,至少一年有效。生物素标记RNA阳性探针和未标记RNA阳性探针最好能在-80℃保存。
注意事项:
操作过程要严格保证无RNase污染。请戴上口罩和手套操作,尽量防止人体表面的RNase污染样品。操作时应避免对着样品或所使用的试剂盒或耗材呼气或说话,以防RNase污染。对于操作环境中RNase的去除,推荐使用碧云天生产的RNase and DNase Away (R0123)以去除实验桌、仪器设备表面或其它接触面上的RNase。
所用试剂和耗材都要求是RNase-free,操作时应小心,避免被污染。如果耗材可能有RNase污染,可考虑用0.01%的DEPC水溶液浸泡过夜,然后高温高压灭菌并烘干。
蛋白样品制备过程中样品的稀释等都需使用BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)或DEPC水(DNase、RNase free) (R0022)。
初次实验时可使用试剂盒提供的阳性蛋白、生物素标记RNA阳性探针及未标记RNA阳性探针进行系统测试,确保实验体系正常。
需自备带正电荷尼龙膜,以及凝胶电泳时所需的相关试剂。带正电荷尼龙膜(FFN10/FFN11/FFN13/FFN15)可以向碧云天订购。
如果需要使用更多的封闭液或洗涤液,可另外单独订购封闭液(GS009B)或洗涤液(5X) (GS009W)。
BeyoECL Moon A液和B液在吸取过程中必须要更换枪头,A液和B液相互污染后会导致A液或B液逐渐失效,影响后续的使 用效果。
各溶液使用后,请盖紧瓶盖,以防失效。特别是BeyoECL Moon B液,含有氧化剂,比较容易被还原而失效。
BeyoECL Moon A液和B液均对人体有害,操作时请小心,并注意有效防护以避免直接接触人体或吸入体内。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
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文献和实验1. Ke Li, Jiawei Guo, Yue Ming, Shuang Chen, Tingting Zhang, Hulin Ma, Xin Fu, Jin Wang, Wenrong Liu, Yong Peng . A circular RNA activated by TGFβ promotes tumor metastasis through enhancing IGF2BP3-mediated PDPN mRNA stability Nat Commun. 2023 Oct 28;14(1):6876.doi: 10.1038/s41467-023-42571-1.
2. Zili Song, Shuang Zhou, Hongjiao Zhang, Nancy P Keller, Berl R Oakley, Xiao Liu, Wen-Bing Yin . Fungal secondary metabolism is governed by an RNA-binding protein CsdA/RsdA complex Nat Commun. 2023 Nov 14;14(1):7351.doi: 10.1038/s41467-023-43205-2.
3. Yiyi Ji, Weiwei Zhang, Kai Shen, Ruopeng Su, Xinyu Liu, Zehua Ma, Bo Liu, Cong Hu, Yizheng Xue, Zhixiang Xin, Yi Yang, Ang Li, Zhou Jiang, Na Jing, Helen He Zhu, Liang Dong, Yinjie Zhu, Baijun Dong, Jiahua Pan, Qi Wang, Wei Xue . The ELAVL3/MYCN positive feedback loop provides a therapeutic target for neuroendocrine prostate cancer Nat Commun. 2023 Nov 28;14(1):7794.doi: 10.1038/s41467-023-43676-3.
Ecl 显色原理:鲁米诺在免疫测定中既可用作标记物,也可用作过氧化物酶的底物。在Ecl底物中,含有H2O2和鲁米诺,在HRP(辣根过氧化物酶)的作用下,发出荧光来。 试验步骤: 1)将两种显色底物1:1等体积混合(一般各1ml/membrane)。 2)将混合物覆盖在膜表面,1-2分钟,摇晃使均匀。 3)用保鲜膜把膜包起来,放入夹板中。 4)在暗室中将X光片,覆盖在膜的上面,夹好夹子,曝光1min。 5)显影、定影。 6)根据结果调整曝光时间和曝光区域,得到
EMSA是一个比较复杂的试验技术,由于工作原因接触这个试验技术到现在也有三年多的时间了,做了大概也有几百次吧, 那倒理想的试验结果的同时也碰到了很多莫名的问题和结果,到现在为止还有没有解决的,找不到原因的一个问题,呵呵! 现和smalldonkey商量一下将我对这个实验技术的总结和一个心得写出来给大家分享,批评指正。EMSA实验技术作为一个经典的DNA/protein,RNA/protein的检测技术,不是很多简单的实验技术可以替代的! 比如曾经在我们这个论坛中有站友提到
luozhifeng339 请教各位达达,我准备做EMSA,如果做SUPER-SHIFT的话,该选择原装抗体还是分装的抗体呢,盼不吝赐教! wanglinling 看到一篇EMSA的文章,不知道里面有没有回答你的问题哈,不过英文的值得阅读哈。 GEL SUPER-SHIFT ASSAY/ EMSA Materials/Reagents: See Gel-shift assay Procedure
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