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- 2026年01月01日
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- 详细信息
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- 提供商：
上海旭燃生物科技有限公司
- 服务名称：
mRNA转录组测序及数据分析
服务优势
产品描述
mRNA是在蛋白质合成时充当模板的RNA。mRNA-seq是为检测mRNA表达发展出来的高通量测序技术。其技术原理，是对RNA中含有polyA尾的mRNA用oligo dT进行富集。进而对富集下来的mRNA进行片测序。进而对测序结果进行生物信息学分析，从而获得RNA中的基因表达、可变剪接、RNA编辑等信息。
产品优势
1、通量高、敏感性高的技术,对于多基因分析及低频突变检测具有独特的优势
2、全基因组分析，无需预先设计特异性探针能够检测未知基因
3、低成本，高准确性，大幅降低了测序时间
4、数字化信号，直接测定每个转录本片段序列,单核苷酸分辨率的精确度
5、利用高深度的测序数据组装构建转录本序列,识别可变剪接模式
实验流程
数据分析
研究方向/思路
送样要求
| 样本类型 | 建议送样量 | 存储介质 | 保存、运输条件 |
| 组织 | ＞50mg | 1.RNA later； 2.存入冻存管; 3.大块组织样本不建议放入trizol保存； 4.1.5ml无菌离心管 |
-80℃保存，干冰运输 |
| 细胞 | ＞2 x 10^6 | 1.收集的细胞沉淀，加入1ml trizol震荡混匀-80度保存； 2.收集的细胞沉淀，液氮速冻5-10min，-80℃冰箱保存； |
-80℃保存，干冰运输 |
| 全血 | ＞1ml | A.采用EDTA抗凝管采血，禁用肝素抗凝管，新鲜血液效果更佳。 B.或者分离出PBMC加 trizol 混匀。 C.或者全血离心去掉血浆加 trizol 混匀。 D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube静脉真空采血管（全血RNA管） PS：请尽量不使用RNA later保存全血。 |
-80℃保存，干冰/4度（新鲜）运输 |
| FFPE | A.切片组织面积大于1cm2，切片表面无划痕，无干裂，均匀贴片的石蜡切片； B.切片组织细胞>30000个；有核细胞比例>80%；肿瘤细胞比例>20%，白片厚度5~ 10um，需3-5片，组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上，需提供5-12片； C.石蜡块：厚度4mm以上，组织约绿豆大小以上； D.蜡卷：厚度25um左右，2-5卷 |
/ | 4℃或常温保存和运输 |
| RNA | ＞1ug | DEPC水；Water Nuclease-Free | -80℃保存，干冰运输 |
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文献和实验该产品被引用文献
RNA-seq：从技术到生物学
NGS技术不仅被用来分析静态基因组，还被用来分析动态转录组。这些强大且快速发展的技术为我们理解基因表达和调控做出了巨大贡献。基因的表达调控是将基因型与表型联系起来的基础。RNA 的合成和成熟过程受到严格控制，它们形成了复杂的基因表达网络，最终驱动生物的各类进程。深入了解控制这些复杂基因表达的机制，对于更好地了解癌症等复杂疾病也非常重要。
参考文献：Marguerat S, Bähler J. RNA-seq: from technology to biology[J]. Cellular and molecular life sciences, 2010, 67: 569-579.
相关实验
结合细胞在组织中分布的位置信息和转录组基因表达信息，了解细胞在空间背景下的异质性。
研究意义；而同样情况下RASGRP1的检测数据可能不能说明问题。 由此可知，设计的实验如果没有生物学重复，或者生物学重复的数量不够，就不能得到有统计意义的实验结果；获得的差异表达的基因很可能仅仅是少数个体差异的表现，并不能反映疾病或者某种特定生理状态的群体本质特征。 3.生物学重复设置几个合适？ 您是不是有同样的问题：转录组测序是否必须进行生物学重复啊，是否要3个重复，是否可以用3个样品的RNA等量混合代替生物学重复，如果不重复能否发文章…..？一方面是有限的经费，一方面是编辑的质疑；实在很难
案例：应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症（CVIDs）的基因图谱 背景：常见的变异型免疫缺陷综合症（CVIDs）是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高，大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的：利用 Illumina HiSeq2500 和 HTSeq 测序平台对 CVIDs 进行全基因组及转录水平的研究，揭示并绘制 CVIDs 的信号调控图谱。 结果：通过对 CVIDs 基因组和转录组进行测序和综合
技术资料文献支持
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