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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 英文名:
CRISPRclean Single Cell RNA Boost Kit
- 供应商:
北京赛百盛基因技术有限公司

*来自PBMC的数据,不同细胞类型会有差异

传统上,单细胞数据处理包括细胞聚类和下游解释之前的某些过滤和标准化步骤。CRISPRclean不是在计算机中删除这些读长,而是在测序之前在体外删除这些读长。它将50%的测序簇重新分配到独特的生物相关转录本,使您能够最大限度地提高UMI和基因敏感性。
CRISPRclean利用Cas9去除和专门设计的guide set来删除在二次分析之前过滤的读长。CRISPRclean Single Cell RNA Boost Kit使您能够在对工作流程影响最小的情况下消除噪音,并对单细胞RNA序列结果产生更大的信心。


集成到10x Genomics® Chromium™ Next GEM Single Cell 3’ 工作流程中
简单的三步protocol

使用CRISPRclean Single Cell RNA Boost Kit,转录组的读数增加100%。

去除后检测灵敏度提高1.5倍
与未去除的样品相比,去除的PBMC样品的每个细胞的基因和UMI检测灵敏度提高。

深入了解表达谱
在用CRISPRclean处理的PBMC样品中鉴定出一种额外的细胞类型。
使用PBMC样品对有和没有去除的细胞簇的UMAP图显示,去除不会干扰细胞类型调用。

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文献和实验• 以96孔板方式,从同一个细胞或组织样本中同时纯化基因组 DNA和总RNA • 处理 96 个样本,只需不到60 分钟 • 从同一样本中纯化高品质的基因组DNA和总RNA • 96孔板方式,高效的操作流程 • 高度标准化的操作流程 • 高重复性的DNA和RNA产量 Product description The AllPrep DNA/RNA 96 Kit is well suited for high
Purification Binding, Washing, and Elution of RNA 1) Add one volume 70% ethanol to each volume of cell homogenate. 2) Vortex to mix thoroughly and to disperse any visible precipitate that may form after adding ethanol. 3)
Method for Single-Cell Electroporation
into a single cell. In addition, SCE can be used to transfer macromolecules besides DNA into cells, including RNA, proteins, dyes and drugs. While charged molecules are actively electrophoresed into cells with higher efficiency, noncharged molecules
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