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- 宏基因组(Metagenomics)，也称元基因组，利用新一代高通量测序技术(Next Generation Sequencingtechnology, NGS )以特定环境下微生物群体基因组为研究对象，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。
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- 2026年01月04日
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上海百趣医学生物科技有限公司
- 服务名称：
宏基因组检测服务
宏基因组(Metagenomics)，也称元基因组，利用新一代高通量测序技术(Next Generation Sequencingtechnology, NGS )以特定环境下微生物群体基因组为研究对象，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。与传统微生物研究方法相比，宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点，因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。
技术优势
通量高，拥有标准化实验室和高通量测序平台，数据库可靠
可检测不可培养物种，可检测痕量微生物
专业的生物信息团队，可以满足个性化的生物信息分析要求
技术路线
技术参数
▶ 样本要求
土壤：10 g/sample
粪便：3-5 g/sample
血液：10 mL/sample
污泥/沉积物：5-10 g/sample
DNA：总量≥1 μg，浓度≥100 ng/μL
▶ 检测平台
测序平台：Nova Seq 6000，Illumina
测序方法：PE150
测序深度：6G/10G/12G
▶ 常规项目周期
实验检测：35个自然日
数据分析：7个自然日
应用方向
- 医学领域：代谢病研究、肿瘤癌症研究等
- 畜牧领域：肠道、瘤胃(如产甲烷菌类群)与动物健康/营养消化研究等
- 农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落研究等
- 环境领域：雾霾处理、污水治理、石油降解、酸性矿水处理及海洋环境研究等
- 生物能源：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发研究
- 特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究
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文献和实验文献速递：患者福音？宏基因组下一代测序用于尿路感染诊断提高诊断精度
内容及结果 2023年3月3日，天津医科大学第二医院的研究团队在Frontiers in Cellular and Infection Microbilogy(IF=4.6/中科院二区)杂志上发表题为 Enhancing urinary tract infection diagnosis for negative culture patients with metagenomic next-generation sequencing (mNGS)的研究成果[1]。 宏基因组下一代测序（mNGS）是一种新兴的病原
，并参加了比赛。宏基因组测序我们诊断传染病的方法叫做宏基因组测序。总的思路是，我们对临床样本中的所有核酸(DNA和RNA)进行排序，并使用计算软件分析数据，以找到众所周知的“大海捞针”。我们寻找的一般是去年，我们描述了使用宏基因组测序成功诊断一种罕见但可治疗的细菌感染(神经钩端螺旋体病)，该感染发生在一名14岁的危重男孩身上，他已经病了4个多月而未被诊断。对于具有广泛鉴别诊断(疟疾、伤寒、登革热、埃博拉等)的急性热带病等疾病，无偏元基因组测序是一种非常有吸引力的诊断检测方法。我们在《基因组医学》杂志
宏基因组学Metagenomics Methods and Protocols 基因X （美）（英文版） Metagenomics has proven to be a powerful tool for exploring the ecology, metabolic profiling, and comparison of complex microbial communities as well as its important applications
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