
HLA分型项目
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- 基于NGS的HLA分型分析,利用探针杂交的方式捕获目标区域,检测肿瘤、遗传相关的变异信息。TargetSeq®基于多因素算法采用“叠瓦式”的探针设计方案,对目标区域进行多层探针设计。探针使用生物素标记的NTP和核酸类似物作为合成原料,制备出的特异性探针能够与目标基因组文库进行液相杂交,杂交完成后使用链霉亲和素磁珠来结合探针及目标区域文库的杂交产物,将捕获得到的目标区域文库富集后测序。基于分型分析,可应用于移植配型、免疫疾病研究、药物过敏等方向。
- 北京
- 2025年07月15日
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- 详细信息
- 技术资料
- 提供商:
北京金则医学检验实验室
- 服务名称:
HLA分型
北京金则医学检验实验室有限公司(以下简称“金则医学”)成立于2017年,隶属蛋白质药物国家工程研究中心精准医学平台和临床CRO平台,是国家卫健委认证的第三方独立医学检验实验室(实验室级别:生物安全二级BSL-2),实验室占地面积约2000m2,涵盖临床免疫学、临床细胞分子遗传学、微生物、生化等多个专业。 金则医学作为精准医学的践行者,始终秉持着“专业精准,卓越金则”的价值观,旨在为医疗及健康服务机构提供独特、优质的第三方检测及转化医学服务,为大众提供专业精准的医学健康检测服务及系列解决方案。
HLA基因簇位于染色体6p21.3区段,长度约3.4 Mb,包含200多个基因。根据基因产物的结构、功能、以及细胞分布等因素,将HLA基因分成了3大类。
HLA-I类基因:包括HLA-A、HLA-B、HLA-C等经典的抗原基因。其基因产物几乎分布于身体全部细胞表面,呈递内源性抗原; HLA-II类基因:包括 DR, DP, DQ 等基因 ,只有吞噬性的细胞(比如巨噬细胞、B细胞)的表面有第二型人类白细胞抗原,呈递外源性抗原; HLA-III类基因:主要属于补体系统。
本项目技术方案-拟选择的HLA基因分型检测系统核心参数
技术平台介绍:艾吉泰康TargetSeq®杂交捕获测序技术以NGS为主要检测平台,利用探针杂交的方式捕获目标区域,检测肿瘤、遗传相关的变异信息。TargetSeq®基于多因素算法采用“叠瓦式”的探针设计方案,对目标区域进行多层探针设计。探针使用生物素标记的NTP和核酸类似物作为合成原料,制备出的特异性探针能够与目标基因组文库进行液相杂交,杂交完成后使用链霉亲和素磁珠来结合探针及目标区域文库的杂交产物,将捕获得到的目标区域文库富集后测序。基于分型分析,可应用于移植配型、免疫疾病研究、药物过敏等方向。 捕获探针:TargetSeq® Human HLA Panel为针对人类白细胞抗原(HLA)相关6个基因设计的检测产品,包括HLAⅠ类分子A,B,C基因的全长序列和Ⅱ类分子DRB1,DQB1,DPB1基因的全外显子序列。 目标区域:包括完整的人类全外显子区域,编码基因的设计覆盖度达100%。 探针设计:15.6Kb。测序平台:Illumina NovaSeq 6000,PE150。 200X-1000X深度测序量:利用HLA Panel对标准品进行靶向富集后,进行PE150测序,使用HLA-HD分析软件进行分型分析,准确率高达100%,200X平均测序深度下覆盖度>97%,均一性(TC 20%X coverage rate)>90%,捕获效率>77%。 经过与多个省级血液中心的联合研究表明:本检测系统与一代测序结果的符合率达到100%。
HLA基因分型在移植配型,疾病研究,药物过敏,肿瘤免疫 研究均有较好的应用。 有需求的可以联系 庞先生 18519226333
HLA基因簇位于染色体6p21.3区段,长度约3.4 Mb,包含200多个基因。根据基因产物的结构、功能、以及细胞分布等因素,将HLA基因分成了3大类。
HLA-I类基因:包括HLA-A、HLA-B、HLA-C等经典的抗原基因。其基因产物几乎分布于身体全部细胞表面,呈递内源性抗原; HLA-II类基因:包括 DR, DP, DQ 等基因 ,只有吞噬性的细胞(比如巨噬细胞、B细胞)的表面有第二型人类白细胞抗原,呈递外源性抗原; HLA-III类基因:主要属于补体系统。
本项目技术方案-拟选择的HLA基因分型检测系统核心参数
技术平台介绍:艾吉泰康TargetSeq®杂交捕获测序技术以NGS为主要检测平台,利用探针杂交的方式捕获目标区域,检测肿瘤、遗传相关的变异信息。TargetSeq®基于多因素算法采用“叠瓦式”的探针设计方案,对目标区域进行多层探针设计。探针使用生物素标记的NTP和核酸类似物作为合成原料,制备出的特异性探针能够与目标基因组文库进行液相杂交,杂交完成后使用链霉亲和素磁珠来结合探针及目标区域文库的杂交产物,将捕获得到的目标区域文库富集后测序。基于分型分析,可应用于移植配型、免疫疾病研究、药物过敏等方向。 捕获探针:TargetSeq® Human HLA Panel为针对人类白细胞抗原(HLA)相关6个基因设计的检测产品,包括HLAⅠ类分子A,B,C基因的全长序列和Ⅱ类分子DRB1,DQB1,DPB1基因的全外显子序列。 目标区域:包括完整的人类全外显子区域,编码基因的设计覆盖度达100%。 探针设计:15.6Kb。测序平台:Illumina NovaSeq 6000,PE150。 200X-1000X深度测序量:利用HLA Panel对标准品进行靶向富集后,进行PE150测序,使用HLA-HD分析软件进行分型分析,准确率高达100%,200X平均测序深度下覆盖度>97%,均一性(TC 20%X coverage rate)>90%,捕获效率>77%。 经过与多个省级血液中心的联合研究表明:本检测系统与一代测序结果的符合率达到100%。
HLA基因分型在移植配型,疾病研究,药物过敏,肿瘤免疫 研究均有较好的应用。 有需求的可以联系 庞先生 18519226333
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