CUT&RUN-qPCR试剂盒（HD101）

Hyperactive pG-MNase CUT&RUN Assay Kit for PCR/qPCR

快速高效靶向切割目的片段，无需建库即可实现基因定量。

操作体验好：实验流程简单，包含DNA提取模块，告别酚氯仿抽提。

产品性能好：转录因子、辅因子成功率高，产出更稳定，结果更真实。

结果更准确：含有Spike in DNA组分，校正组间差异。

区分下游实验：无需建库，可直接进行qPCR，满足不同实验需求。

Hyperactive pG-MNase CUT&RUN Assay Kit for PCR/qPCR是用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&RUN（Cleavage Under Target and Release Using Nuclease）技术是一种研究蛋白质-DNA相互作用的新方法，使用Protein G融合的MNase核酸酶，在抗体引导下精准靶向目的蛋白，并在目的位点附近进行DNA的片段化切割。本试剂盒优化了实验反应体系和操作流程，与传统的ChIP-qPCR相比，具有检测成功率高、抗体兼容性强、实验周期短、操作简单等优势，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。试剂盒中所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证，较大程度上保证了实验结果的稳定性和重复性。

1. 目的蛋白兼容性

以10,000和100,000个239细胞为样本，在不同靶蛋白体系中，针对不同的目的基因富集片段设计qPCR引物，均可以成功进行qPCR扩增。结果表明HD101可兼容不同类型、不同丰度的靶蛋白，目的基因片段富集效果好。

图1  293细胞中H3K4me3、H3K27me3、CTCF、Ezh2互作DNA的富集程度

 

2. 细胞类型兼容性测试

在293、Hela、K562三种不同细胞类型中，针对组蛋白H3K4me3和转录因子CTCF设计目的基因qPCR引物，可以成功富集目的片段，并进行qPCR扩增，结果表明HD101在不同的细胞类型中发挥稳定。

图2 不同类型细胞中H3K4me3、CTCF互作DNA的富集程度

 

3. 细胞投入量兼容性测试

投入5,000、10,000、100,000、500,000个293细胞，针对组蛋白H3K4me3和转录因子CTCF设计目的基因qPCR引物，可以成功富集目的片段，并进行qPCR扩增，结果表明HD101在不同的细胞投入量下发挥稳定。

图3 不同细胞投入量下H3K4me3、CTCF互作DNA的富集程度

 

4. Spike in DNA校准测试

通过梯度投入Spike in DNA（1 pg / 10,000 cells）对不同细胞投入量测得的CT值进行均一化校正，校正后的CT值差值小于1，目的基因富集程度趋于一致。因此，HD101提供的Spike in DNA可实现样本间的均一化校准。

图4 Spike in DNA校正前后CT值的比较

BOX1：2 ~ 8 ℃保存，根据不同目的地调整运输方式；

BOX2：15 ~ 25 ℃保存，常温运输；

BOX3：-30 ~ -15 ℃保存，≤0℃运输。