- ￥12800
- 诺唯赞（Vazyme）
- HD102
- 南京
- 2026年04月26日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存：
充足
- 英文名：
Hyperactive pG-MNase CUT&RUN Assay Kit for Illumina
- 保质期：
详询
- 供应商：
诺唯赞
- 保存条件：
BOX1：2 ~ 8 ℃保存，根据不同目的地调整运输方式； BOX2：15 ~ 25 ℃保存，常温运输； BOX3：-30 ~ -15 ℃保存，≤0℃运输。
- 规格：
24 rxns
Hyperactive pG-MNase CUT&RUN Assay Kit for Illumina
快速高效靶向切割目的片段，文库构建优质且真实。
蛋白质-DNA互作
· 操作体验好：实验流程简单，包含DNA提取模块，告别酚氯仿抽提。
· 产品性能好：转录因子、辅因子成功率高，产出更稳定，结果更真实。
· 结果更准确：含有Spike in DNA组分，校正组间差异。
Hyperactive pG-MNase CUT&RUN Assay Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&RUN(Cleavage Under Target and Release Using Nuclease)技术是一种研究蛋白质-DNA相互作用的新方法，使用Protein G融合的MNase核酸酶，在抗体引导下精准靶向目的蛋白，并在目的位点附近进行DNA的片段化切割。本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程，与传统的ChIP-Seq相比，具有实验成功率高、抗体兼容性强、实验周期短、操作简单等优势，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。试剂盒中所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证，较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
1. 优质的文库产出
以100,000个K562细胞为样本，参照HD102实验流程对不同丰度靶蛋白进行CUT&RUN实验和文库构建。在不同组蛋白和转录因子体系中，HD102文库产出稳定，文库峰型呈现典型的Ladder状分布，HD102高效靶向切割的特性保证了优质的文库产出。
图1 HD102文库产出
|
H3K4me3  |
H3K27me3  |
|
CTCF  |
SUZ12  |
图2 HD102文库峰型
2. 高质量的下机数据
以100,000个K562细胞为样本，参照HD102实验流程对不同丰度靶蛋白进行CUT&RUN实验和文库构建。通过HD102获得的下机数据TSS富集以及IGV视图信噪比高，对目的基因位点有明显富集。
图3 HD102 TSS富集图
图4 HD102 Chr1 IGV全局视图
3. Spike in DNA校正组间差异
以5,000、10,000、100,000个293细胞为样本，参照HD102实验流程对组蛋白H3K4me3进行CUT&RUN实验和文库构建，并按照说明书推荐的Spike in DNA投入量进行校正。使用HD102建库获得的热图和Plotfile在校准前由于高低细胞投入量获得的数据量的差异，导致富集效果存在显著差异，通过Spike in DNA进行均一化校准之后，可以真实反应不同细胞投入量下的富集效果。
图5 HD102 Spike in DNA校正前后TSS富集比较
4. 多组学比较
以100,000个293细胞为样本进行CUT&RUN、CUT&Tag、ATAC和mRNA-seq多组学比较分析。IGV视图显示HD102在关键位点上的富集情况与ATAC和CUT&Tag技术一致，且在mRNA-seq中可以找到相应基因位点，实验结果真实可靠。
图6 多组学比较
BOX1：2 ~ 8 ℃保存，根据不同目的地调整运输方式；
BOX2：15 ~ 25 ℃保存，常温运输；
BOX3：-30 ~ -15 ℃保存，≤0℃运输。
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文献和实验ELECTROPHORESIS OF DNA IN POLYACRYLAMIDE GELS
Pre-run gels for 30 minutes at 80V. Rinse the wells with running buffer. Load and electrophorese samples at 80V until dyes separate, then boost to up to 150 V. Medium sized polyacrylamide gels can be run overnight at 55-60 V to see all phi-X/Hae III
Genomic (Plant) DNA: Restriction Digestion for Sou
(measured at the origin) and 10cm wide, measure out a piece 14.25 X 10.25 cm, or so. Using the clean ruler as a straight edge and the new razor blade, cut out only that portion of membrane you need; i.e., try to minimize unnecessarily cutting into unused
digested plasmid (cut 5 µg of plasmid in volume of 20 µl) 51 µl labeled oligo 10 µl 10X Taq Buffer 6 µl 25 mM MgCl2 10 µl DMSO 2 µl 10 mM dNTP's 1 µl Taq polymerase 14 cycles of PCR Run on 6-8% polyacrylamide/urea gel Cut out probe and elute S1
