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- 文献和实验
- 技术资料
- 英文名：
SARS-CoV-2 Confirm
- 保存条件：
2-8℃避光。 冻干粉复溶后在-18℃以下保存
新冠病毒RT-qPCR引物/探针（套装）
SARS-CoV-2 Confirm
一、产品用途：
RT-PCR引物/探针（英文名：SARS-CoV-2 Confirm），用于定性检测和分析新冠病毒RNA。它仅用于研究，不用于临床诊断。
二、产品描述：
1. 该产品包括三个小管：
①橙盖： 2019-nCoV Mix（冻干粉），1管。
此管为新冠病毒引物/探针，可特异性扩增新冠病毒的RdRp基因（即RNA依赖性RNA聚合酶基因），而其他冠状病毒RNA不会被检测到【1】【2】。（该引物/探针依据WHO诊断参考实验室公布的新冠病毒引物/探针序列而设计【1】。更多详情可访问https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/laboratory-guidance）。
如要检测其他冠状病毒，推荐MB公司提供的其他冠状病毒引物/探针，品名：CoV Screen (without ConviFlex™ RT-Taq Mix)，货号：271-1100。
②绿盖： Positive Control RNA（阳性对照RNA，冻干粉），1管。
此阳性对照RNA为一段合成的RNA序列（序列来自武汉的病毒株）。
③白盖： PCR Grade Water（液体），1管。
2.使用前，①橙盖和②绿盖先用PCR级水（③白盖）复溶，并分装，避免反复冻融。
3.该引物/探针应与MB公司提供的【RNA病毒检测试剂盒】（英文名：ConviFlex™RT-Taq Mix,
货号192-0025/-0100/-0250）一起使用，用于新冠病毒RT-qPCR反应检测。
4．检测样本需为抽提过的RNA样本。
5.新冠病毒的靶基因RdRp是用FAM™通道检测，扩增的人RNA酶P基因（过程对照）用ROX™通道检测，用以评估样本的制备质量。
三、产品特点：
1. 靶点特别。依据WHO国际标准，此引物探针为新冠病毒RdRp基因，而非市面上常见的ORF1ab和N基因或E基因。
2.阳性对照RNA为一段合成的RNA序列（序列来自武汉的病毒株）。
3. 主要组分为冻干粉，4℃保存，储存运输方便，性能稳定。
4. 适用于科研中，各种来源的RNA样本，包括拭子、活检组织、哺乳动物细胞和细菌等。
四、需用户自己准备的试剂耗材和仪器：
1.RNA病毒检测试剂盒（RT-qPCR法）
（英文名：ConviFlex™ RT-Taq Mix，货号192-0025/-0100/-0250）
2.荧光定量PCR仪（qPCR仪）
3.无DNase和RNase的qPCR反应管
4.离心机
5.移液器及带滤芯吸头（不含DNase和RNase）
6.用户自己提取的RNA或现成的RNA样品。（抽提过程建议使用商品化的RNA提取试剂盒完成，如MB厂家的：
【病毒RNA提取试剂盒】（ExtractNow™ Virus RNA Kit，货号611-1010/-1050/-1250）
或【病毒RNA拭子提取试剂盒】（ExtractNow™ Virus RNA Swab Kit，货号611-2250）。
五、操作注意事项：
该引物/探针应仅由经过培训的实验室人员使用。
始终穿上合适的防护服和戴一次性手套。
根据样品类型，应谨慎处理所有样品。请遵循WHO推荐的方法处理样本。
该试剂盒不含有害物质。 残余物可以根据当地法规丢弃。
六、操作步骤：
步骤1. 试剂制备
①橙盖2019-nCoV Mix引物探针冻干粉，最大速离心5秒钟，加入525lPCR级水（白盖），室温静置5分钟后，涡旋并离心5秒钟，分装，待用或-18℃保存。
②绿盖Positive Control RNA阳性对照冻干粉，最大速离心5秒钟，加入105lPCR级水（白盖），室温静置5分钟后，涡旋并离心5秒钟，分装，待用或-18℃保存。
步骤2. RT-qPCR引物/探针mix制备（20μl反应体积）
（1）1个反应需要加入：酶预混液 （自备的红盖预混液）10l ，
橙盖（复溶的2019-nCoV Mix引物/探针）5l
（红盖预混液 来自MB公司的【RNA病毒检测试剂盒】（RT-qPCR法），
英文名：ConviFlexRT-Taq Mix, 货号192-0025/-0100/-0250，需单独购买）
（2）将以上引物/探针mix涡旋混匀，并离心5秒钟。
（3）每个PCR管中加入15μl上述引物/探针mix和5μl样本（抽提后的RNA），
或5μl RNA提取试剂盒中的洗脱缓冲液，作为阴性对照，或5μl PCR级水作为无模板对照，或5μl阳性对照RNA。
（4）紧扣PCR管，然后短暂离心。
（5）将PCR管放置qPCR仪上，紧上顶盖。
步骤3. 设置qPCR程序
1个循环： 55 ℃，10分钟
1个循环： 94 ℃，3 分钟
45个循环：94 ℃，15秒
58℃，30秒
步骤4. 启动程序
步骤5. 数据解读
七、使用注意事项：
1.使用前应认真阅读说明书。
2.来自不同批次的试剂不能混合。
3.试剂盒内的试剂应始终作为一个整体溶解分装。
4.试剂盒应在效期内使用。
5.每次PCR至少应设置一个阳性对照。每次PCR至少应设置一个阴性对照和/或一个无模板对照。如果实验者自己抽提RNA，则可使用洗脱缓冲液作为阴性对照。对照必须与待测样品的处理方式相同。您也可能需要其他实验室提供的对照品，例如含高、中、低不同浓度的RNA样品。使用对照，对于确认结果的可靠性或用于排除故障非常有意义。
6.建议在无RNA和DNA污染的条件下进行RT-PCR，以避免操作过程中DNA或非特异RNA的交叉污染。（MB公司推荐使用PCR污染祛除喷雾，英文名：PCR Clean™，货号15-2025，预先清洁实验环境。）
7.尽量减少RNA样品的冻融次数，同时避免RNA酶污染，以减少RNA降解的风险。（RNA降解会极大地限制了RT-qPCR反应的性能）。请确保高质量的完整RNA用于检测。
8.样本制备过程中，注意避免其他DNA的污染，DNA的干扰也会降低qPCR的准确性。
八、参考文献
1. Corman VM, Bleicker T, Brünink S, Schneider J, Drosten C. Diagnostic detection of 2019-nCoV by real-time RT-PCR. https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2
2. Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu DKW, Bleicker T, Brünink S, Schneider J, Schmidt ML, Mulders DGJC, Haagmans BL, van der Veer B, van den Brink S, Wijsman L, Goderski G, Romette JL, Ellis J, Zambon M, Peiris M, Goossens H, Reusken C, Koopmans MPG, Drosten C. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill. 2020 25(3). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045.
九、新冠病毒精确检测，还会用到：
更多详情可访问，德国MB官网：www.minervabiolabs.com
中国总代理北京缔一生物官网：www.dyshengwu.com
咨询及订购热线： 400-166-8600，13810768975，010-84118494
Q Q： 1580434811，1258888686
邮箱：servicebj@viansaga.com
(缔一生物)
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SARS-CoV-2 Confirm
| 品名 | 货号 | 规格 | 存储 |
| RT-PCR引物/探针 英文名：SARS-CoV-2 Confirm 品牌：德国MB公司（Minerva Biolabs） |
271-2100 | 100次/盒 | 2-8℃避光。 冻干粉复溶后在-18℃以下保存 |
一、产品用途：
RT-PCR引物/探针（英文名：SARS-CoV-2 Confirm），用于定性检测和分析新冠病毒RNA。它仅用于研究，不用于临床诊断。
二、产品描述：
1. 该产品包括三个小管：
①橙盖： 2019-nCoV Mix（冻干粉），1管。
此管为新冠病毒引物/探针，可特异性扩增新冠病毒的RdRp基因（即RNA依赖性RNA聚合酶基因），而其他冠状病毒RNA不会被检测到【1】【2】。（该引物/探针依据WHO诊断参考实验室公布的新冠病毒引物/探针序列而设计【1】。更多详情可访问https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/technical-guidance/laboratory-guidance）。
如要检测其他冠状病毒，推荐MB公司提供的其他冠状病毒引物/探针，品名：CoV Screen (without ConviFlex™ RT-Taq Mix)，货号：271-1100。
②绿盖： Positive Control RNA（阳性对照RNA，冻干粉），1管。
此阳性对照RNA为一段合成的RNA序列（序列来自武汉的病毒株）。
③白盖： PCR Grade Water（液体），1管。
2.使用前，①橙盖和②绿盖先用PCR级水（③白盖）复溶，并分装，避免反复冻融。
3.该引物/探针应与MB公司提供的【RNA病毒检测试剂盒】（英文名：ConviFlex™RT-Taq Mix,
货号192-0025/-0100/-0250）一起使用，用于新冠病毒RT-qPCR反应检测。
4．检测样本需为抽提过的RNA样本。
5.新冠病毒的靶基因RdRp是用FAM™通道检测，扩增的人RNA酶P基因（过程对照）用ROX™通道检测，用以评估样本的制备质量。
三、产品特点：
1. 靶点特别。依据WHO国际标准，此引物探针为新冠病毒RdRp基因，而非市面上常见的ORF1ab和N基因或E基因。
2.阳性对照RNA为一段合成的RNA序列（序列来自武汉的病毒株）。
3. 主要组分为冻干粉，4℃保存，储存运输方便，性能稳定。
4. 适用于科研中，各种来源的RNA样本，包括拭子、活检组织、哺乳动物细胞和细菌等。
四、需用户自己准备的试剂耗材和仪器：
1.RNA病毒检测试剂盒（RT-qPCR法）
（英文名：ConviFlex™ RT-Taq Mix，货号192-0025/-0100/-0250）
2.荧光定量PCR仪（qPCR仪）
3.无DNase和RNase的qPCR反应管
4.离心机
5.移液器及带滤芯吸头（不含DNase和RNase）
6.用户自己提取的RNA或现成的RNA样品。（抽提过程建议使用商品化的RNA提取试剂盒完成，如MB厂家的：
【病毒RNA提取试剂盒】（ExtractNow™ Virus RNA Kit，货号611-1010/-1050/-1250）
或【病毒RNA拭子提取试剂盒】（ExtractNow™ Virus RNA Swab Kit，货号611-2250）。
五、操作注意事项：
该引物/探针应仅由经过培训的实验室人员使用。
始终穿上合适的防护服和戴一次性手套。
根据样品类型，应谨慎处理所有样品。请遵循WHO推荐的方法处理样本。
该试剂盒不含有害物质。 残余物可以根据当地法规丢弃。
六、操作步骤：
步骤1. 试剂制备
①橙盖2019-nCoV Mix引物探针冻干粉，最大速离心5秒钟，加入525lPCR级水（白盖），室温静置5分钟后，涡旋并离心5秒钟，分装，待用或-18℃保存。
②绿盖Positive Control RNA阳性对照冻干粉，最大速离心5秒钟，加入105lPCR级水（白盖），室温静置5分钟后，涡旋并离心5秒钟，分装，待用或-18℃保存。
步骤2. RT-qPCR引物/探针mix制备（20μl反应体积）
（1）1个反应需要加入：酶预混液 （自备的红盖预混液）10l ，
橙盖（复溶的2019-nCoV Mix引物/探针）5l
（红盖预混液 来自MB公司的【RNA病毒检测试剂盒】（RT-qPCR法），
英文名：ConviFlexRT-Taq Mix, 货号192-0025/-0100/-0250，需单独购买）
（2）将以上引物/探针mix涡旋混匀，并离心5秒钟。
（3）每个PCR管中加入15μl上述引物/探针mix和5μl样本（抽提后的RNA），
或5μl RNA提取试剂盒中的洗脱缓冲液，作为阴性对照，或5μl PCR级水作为无模板对照，或5μl阳性对照RNA。
（4）紧扣PCR管，然后短暂离心。
（5）将PCR管放置qPCR仪上，紧上顶盖。
步骤3. 设置qPCR程序
1个循环： 55 ℃，10分钟
1个循环： 94 ℃，3 分钟
45个循环：94 ℃，15秒
58℃，30秒
步骤4. 启动程序
步骤5. 数据解读
| FAM™ 通道 | ROX™ 通道 | 说明 |
| 阳性 | 阳性 | 检测到SARS-CoV-2 RNA |
| 阳性 | 阴性 | 检测到SARS-CoV-2 RNA |
| 阴性 | 阳性 | 未检测到SARS-CoV-2 RNA |
| 阴性 | 阴性 | 样品制备有问题 |
七、使用注意事项：
1.使用前应认真阅读说明书。
2.来自不同批次的试剂不能混合。
3.试剂盒内的试剂应始终作为一个整体溶解分装。
4.试剂盒应在效期内使用。
5.每次PCR至少应设置一个阳性对照。每次PCR至少应设置一个阴性对照和/或一个无模板对照。如果实验者自己抽提RNA，则可使用洗脱缓冲液作为阴性对照。对照必须与待测样品的处理方式相同。您也可能需要其他实验室提供的对照品，例如含高、中、低不同浓度的RNA样品。使用对照，对于确认结果的可靠性或用于排除故障非常有意义。
6.建议在无RNA和DNA污染的条件下进行RT-PCR，以避免操作过程中DNA或非特异RNA的交叉污染。（MB公司推荐使用PCR污染祛除喷雾，英文名：PCR Clean™，货号15-2025，预先清洁实验环境。）
7.尽量减少RNA样品的冻融次数，同时避免RNA酶污染，以减少RNA降解的风险。（RNA降解会极大地限制了RT-qPCR反应的性能）。请确保高质量的完整RNA用于检测。
8.样本制备过程中，注意避免其他DNA的污染，DNA的干扰也会降低qPCR的准确性。
八、参考文献
1. Corman VM, Bleicker T, Brünink S, Schneider J, Drosten C. Diagnostic detection of 2019-nCoV by real-time RT-PCR. https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2
2. Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu DKW, Bleicker T, Brünink S, Schneider J, Schmidt ML, Mulders DGJC, Haagmans BL, van der Veer B, van den Brink S, Wijsman L, Goderski G, Romette JL, Ellis J, Zambon M, Peiris M, Goossens H, Reusken C, Koopmans MPG, Drosten C. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill. 2020 25(3). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045.
九、新冠病毒精确检测，还会用到：
| 品牌 | 品名 | 规格 | 货号 |
| 德国MB | RNA病毒检测试剂盒（RT-qPCR法） 英文名：ConviFlex™ RT-Taq Mix |
25次/盒 | 192-0025 |
| 100次/盒 | 192-0100 | ||
| 250次/盒 | 192-0250 | ||
| 德国MB |
病毒RNA提取试剂盒 英文名：ExtractNow™ Virus RNA Kit |
10次/盒 | 611-1010 |
| 50次/盒 | 611-0050 | ||
| 250次/盒 | 611-1250 | ||
| 德国MB | 拭子病毒提取Kit 英文名：ExtractNow™ Virus RNA Swab Kit |
250次/盒 | 611-2250 |
| 德国MB | 冠状病毒引物/探针 英文名：CoV Screen (without ConviFlex™ RT-Taq Mix) |
100次/盒 | 271-2100 |
| 德国MB |
PCR污染祛除喷雾 英文名：PCR Clean™ |
250ml/瓶(带喷嘴) | 15-2025 |
| 5L/桶（补充装） | 15-2500 | ||
| 德国MB | PCR污染祛除湿巾 (湿巾面积130×190mm) 英文名：PCR-Clean™ wipes |
50抽/筒 | 15-2001 |
| 5×50抽/包（补充装） | 15-2002 |
更多详情可访问，德国MB官网：www.minervabiolabs.com
中国总代理北京缔一生物官网：www.dyshengwu.com
咨询及订购热线： 400-166-8600，13810768975，010-84118494
Q Q： 1580434811，1258888686
邮箱：servicebj@viansaga.com
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文献和实验相关实验
Real-time qPCR 手册——手把手教你从菜鸟到高手
方程： 从线性方程上看，斜率（slope）为 -1/lg(1+E)，所以 E = 10-1/slope-1。如果从标准曲线上得到斜率（-3.3），就可以算出扩增效率（0.99）。一般来讲PCR扩增效率在 90%-110% 都是可以用于数据分析的。效率低于 100%，是由于 PCR 反应中存在抑制因素；而高于 100% 可能一些污染、非特异性扩增或者是引物二聚体造成。 3. Real-time qPCR 的种类 根据 real-time qPCR 的化学发光原理可以分为2大类：一类为探针类，包括
体系的优化 5、反应温度和时间参数:由酶和引物决定 6、其他与常规PCR相同 （二）应用范围 1、起始模板的测定； 2、 基因型的分析； 3、 融解曲线分析：可以优化PCR反应的条件，对常规PCR有指导意义，如对primer的评价；可以区分单一引物、引物二聚体、变异产物、多种产物。 （三）优点及缺点 优点：对DNA模板没有选择性；适用于任何DNA； 使用方便；不必设计复杂探针；非常灵敏； 便宜。 缺点：容易与非特异性双链DNA结合，产生假阳性；但可以通过融解曲线的分析，优化
-110%之间都是可以接受的。3. 如何评估实时定量PCR反应的效果PCR扩增效率：为了正确地评估PCR扩增效率，至少需要做3次平行重复，至少做5个数量级倍数(5logs)连续梯度稀释模板浓度。常见问题1. 无Ct值出现检测荧光信号的步骤有误: 一般SG法采用72℃延伸时采集，Taqman法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。引物或探针降解: 可通过PAGE电泳检测其完整性。模板量不足: 对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起。模板降解: 避免样品制备中杂质的引入及反复冻融的情况。2. Ct
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