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RNA-seq, 20M reads, 分析

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  • 2025年07月08日
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    表达谱测序,RNA-seq
    在样本质检合格后60天内交数据。

    20M reads质量保证:
    1. Output of each sample >= 20M PF reads
    2. %Q30 of control lane >= 80%
    10M reads质量保证:
    1. Output of each sample >= 10M PF reads
    2. %Q30 of control lane >= 80%

    生物信息学分析:

    1.生物信息分析的概要。SUMMARY OF BIOINFORMATICS ANALYSIS

    2.转录本汇总和丰度估算。TRANSCRIPT ASSEMBLY AND ABUNDANCE ESTIMATION

    3.检测基因表达的差异度。DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES (DEGS) DETECTION

    4.差异表达基因的功能和通路富集分析。GENE ONTOLOGY AND PATHWAY ENRICHMENT ANALYSIS OF DEGS

    测序完成后30天交分析报告。

    如果有特殊需要(需另外收费),还可以分析:

    5.对融合转录本的检测。FUSION TRANSCRIPT DETECTION

    6.体细胞突变的估计。FREQUENCY OF SOMATIC MUTATIONS

    7.非同意体细胞突变。NON-SYNONYMOUS SOMATIC MUTATIONS

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