体内感染模型验证
验证生酮饮食和βOHB对P. berghei感染的保护作用
对C57BL/6和BALB/c小鼠喂食不同浓度KD(0.5%-90%)或植入βOHB渗透泵,感染P. berghei ANKA,监测寄生虫血症和存活率。
β-hydroxybutyrate inhibits Plasmodium falciparum development and confers protection against malaria in mice
包含体内动物模型(KD喂养和βOHB渗透泵)、体外恶性疟原虫培养、代谢组学、转录组学(RNA-seq和scRNA-seq)、功能验证(NAD回补)和机制研究(蛋白表达验证)等多层级证据。
P. berghei ANKA感染小鼠模型(C57BL/6和BALB/c) P. falciparum 3D7体外培养 MYC-tagged MTIP和TY1-tagged ApiAP2转基因P. falciparum 3D7株
生酮饮食浓度(0.5%-90%) βOHB给药浓度和持续时间(渗透泵7天 vs 饮食) 体外βOHB IC50(7.3 mM) NAD+回补实验浓度(0-5 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证生酮饮食和βOHB对P. berghei感染的保护作用
对C57BL/6和BALB/c小鼠喂食不同浓度KD(0.5%-90%)或植入βOHB渗透泵,感染P. berghei ANKA,监测寄生虫血症和存活率。
评估βOHB和乙酰乙酸对P. falciparum增殖的直接作用
在体外培养的P. falciparum 3D7中加入不同浓度βOHB或乙酰乙酸,培养96小时,测定寄生虫血症并计算IC50。
比较KD饲喂或βOHB处理后寄生虫代谢物变化,寻找关键代谢物
使用LC-MS/MS对P. berghei感染小鼠的iRBC和βOHB处理的P. falciparum iRBC进行靶向代谢组学分析,鉴定差异代谢物。
揭示KD或βOHB处理对寄生虫基因表达的影响
对KD饲喂小鼠的P. berghei iRBC进行bulk RNA-seq,对βOHB处理的P. falciparum进行scRNA-seq,分析差异表达基因及富集通路。
验证NAD水平降低介导βOHB对寄生虫的抑制及关键蛋白表达变化
在βOHB处理的P. falciparum中添加NAD+进行回补实验,通过Western blot和免疫荧光检测MTIP、MSP1、ApiAP2等蛋白表达,并评估ApiAP2敲低株对βOHB的敏感性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验/饮食干预 | XTKD01生酮饮食 | Xietong Pharmaceutical Bioengineering | -- |
| 药物处理 | β-羟基丁酸 | MedChemExpress | HY-113378 |
| 乙酰乙酸钠 | MedChemExpress | HY-112540B | |
| 细胞培养 | AlbuMAX II | Gibco, Invitrogen | -- |
| 生化检测 | ALT检测试剂盒 | Rayto | S03030 |
| AST检测试剂盒 | Rayto | S03040 | |
| γ-GT检测试剂盒 | Rayto | S03031 | |
| 尿素检测试剂盒 | Rayto | S03036 | |
| 肌酐检测试剂盒 | Rayto | S03076 | |
| 代谢物检测 | βOHB检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K785-M |
| 乙酰乙酸含量检测试剂盒 | Shanghai Acmec Biochemical | AC10787-100T/48S | |
| 渗透泵植入 | 渗透泵 | RWD | 2001W |
| 流式细胞术 | Vybrant DyeCycle Green | Invitrogen | V35004 |
| BD FACSAria III流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 活体成像 | D-荧光素 | Biyuntian | ST198 |
| AniView600多模式活体动物成像系统 | Guangzhou Biolight Biotechnology | -- | |
| 细胞分选 | MitoTracker Green | Invitrogen | M-7512 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| 蛋白质检测 | BCA蛋白定量试剂盒 | Sangon Biotech | C503021 |
| qPCR | ChamQ通用SYBR qPCR预混液试剂盒 | Vazyme | -- |
| Applied Biosystems 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium单细胞3'试剂盒(V3化学) | 10x Genomics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 生酮饮食喂食 | KD浓度、小鼠品系、喂食时间、感染剂量 阅读提示:Methods: KD feeding; Fig. 1a-d |
| βOHB渗透泵给药 | βOHB浓度、泵型号、输注速率、持续时间 阅读提示:Methods: βOHB osmotic pump implantation; Fig. 1l-n |
| 体外βOHB处理 | βOHB浓度范围、培养时间、起始寄生虫血症 阅读提示:Methods: In vitro treatment; Fig. 1o-p |
| 代谢组学 | 样本类型(iRBC纯度)、细胞数量、LC-MS条件 阅读提示:Methods: Targeted metabolic analysis; Fig. 2 |
| 转录组分析 | RNA提取方法、测序平台、差异基因筛选标准 阅读提示:Methods: Transcriptomic analysis; scRNA-seq; Fig. 3 and 4 |