建立FOLFOX诱导的SOS小鼠模型并评估SAMe的保护作用
验证SAMe是否能预防FOLFOX诱导的肝损伤和SOS
对C57BL/6雄性小鼠进行FOLFOX联合SAMe或不联合SAMe处理,检测体重、肝重、肝/体重比、肝组织学、巨噬细胞积累、凋亡、CD31染色、肝损伤生化指标和SOS基因标志物表达。
S-Adenosylmethionine Inhibits Plasminogen-Activating Inhibitor-1 and Protects Male Mice From FOLFOX-Induced Liver Injury
包含小鼠FOLFOX-SOS模型、PAI-1基因敲除小鼠体内验证,以及原代肝细胞、库普弗细胞、肝星状细胞和肝窦内皮细胞的体外功能与机制实验,并进行了分子机制验证。
C57BL/6雄性小鼠FOLFOX诱导的SOS模型 PAI-1基因敲除雄性小鼠 原代小鼠和人肝细胞 原代小鼠库普弗细胞、肝星状细胞和肝窦内皮细胞
FOLFOX处理方案:奥沙利铂6 mg/kg体重腹腔注射,2小时后注射5-FU 50 mg/kg体重和亚叶酸90 mg/kg体重,每周一次,共5周 SAMe给药:100 mg/kg体重,口服灌胃,每日一次,从第一次FOLFOX处理前3天开始,持续42天 PAI-1基因敲除小鼠:C57BL/6/SJL背景 体内实验样本量:每组5-10只小鼠 体外实验处理:IL-1β和TNF-α浓度为10 ng/mL,SAMe浓度为2 mM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SAMe是否能预防FOLFOX诱导的肝损伤和SOS
对C57BL/6雄性小鼠进行FOLFOX联合SAMe或不联合SAMe处理,检测体重、肝重、肝/体重比、肝组织学、巨噬细胞积累、凋亡、CD31染色、肝损伤生化指标和SOS基因标志物表达。
探究SAMe如何抑制FOLFOX诱导的PAI-1表达
检测FOLFOX处理后肝脏PAI-1蛋白和mRNA水平、血浆PAI-1水平;在原代小鼠和人肝细胞中检测IL-1β和TNF-α对PAI-1表达的影响及SAMe的抑制作用;利用启动子报告基因检测NF-κB对PAI-1启动子的激活及SAMe的抑制;通过染色质免疫沉淀检测p65与Serpine1启动子的结合。
明确PAI-1是否在FOLFOX诱导的肝损伤中发挥必需作用
对PAI-1基因敲除小鼠进行FOLFOX处理,检测肝组织学、肝损伤生化指标、SOS基因标志物表达、NF-κB激活状态以及体重和肝重变化。
研究PAI-1对肝细胞NF-κB的激活以及对库普弗细胞和肝窦内皮细胞的旁分泌效应
用重组PAI-1处理原代小鼠肝细胞,检测NF-κB激活及其下游基因表达;用处理后的条件培养基或外泌体处理库普弗细胞、肝窦内皮细胞和肝星状细胞,检测促炎细胞因子和CD31等标志物表达。
确定PAI-1激活NF-κB所需的分子相互作用
通过免疫共沉淀检测FOLFOX或IL-1β处理后PAI-1与uPAR、vitronectin和LRP-1的相互作用;使用PAI-1突变体(无法结合uPA、LRP-1或vitronectin)处理肝细胞,检测NF-κB激活情况。
验证SAMe是否能抑制肝细胞PAI-1的分泌,并阻断其对库普弗细胞和肝窦内皮细胞的激活作用
检测SAMe对肝细胞分泌的游离PAI-1和外泌体PAI-1的影响;用IL-1β和SAMe处理肝细胞,收集条件培养基和外泌体,处理库普弗细胞和肝窦内皮细胞,检测炎症因子和CD31表达;使用中和抗体验证游离PAI-1的自身泌作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | S-腺苷甲硫氨酸(SAMe)硫酸二对甲苯磺酸盐干粉 | Gnosis SRL | -- |
| FOLFOX | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Thermo Fisher | -- |
| 胎牛血清 | Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素/链霉素溶液 | ScienCells | -- | |
| Percoll溶液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胶原酶 | Sigma | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | -- | |
| Hanks缓冲液 | Thermo Fisher | -- | |
| Percoll PLUS/Percoll | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| CD14+磁珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| LS磁激活细胞分选柱 | Miltenyi Biotec | -- | |
| MACS缓冲液 | Miltenyi Biotec | -- | |
| CD146+磁珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 内皮生长培养基 | PromoCell | -- | |
| 动物实验 | 合成辐照标准饲料 | Research Diets, Inc | D01060501i |
| 实时荧光定量PCR | M-MLV逆转录酶 | Invitrogen | -- |
| Serpine1、Mmp9、Cxc1、Vwf、Tnf-α、IL-1β、Rela、Col-1、Acta2、SERPINE的TaqMan探针和引物 | ABI | -- | |
| 通用聚合酶链反应预混液 | ABI | -- | |
| Western blot | PAI-1抗体 | Abcam | ab182973 |
| p65抗体 | Abcam | ab16502 | |
| IκBα抗体 | Abcam | ab32518 | |
| p-p65 (S536)抗体 | Cell Signaling | 3033S | |
| uPAR抗体 | Proteintech | 10286 | |
| 玻连蛋白抗体 | Proteintech | 15833 | |
| LRP-1抗体 | Novusbio | NBP2-62753 | |
| CD9抗体 | Cell Signaling | 13174T | |
| 热休克蛋白70抗体 | Cell Signaling | 4872T | |
| CD31抗体 | Abcam | ab9498 | |
| 核质分离 | NE-PER核质蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78833 |
| 组织学与免疫组化 | EXPOSE小鼠和兔特异性HRP/DAB检测免疫组化试剂盒 | Abcam | ab80436 |
| 兔抗小鼠PAI-1抗体 | Abcam | ab182973 | |
| TUNEL凋亡检测 | 原位凋亡检测试剂盒 | Abcam | ab206386 |
| ELISA | PAI-1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab108891 |
| 生化检测 | ALT和AST检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| Caspase-3活性检测 | Caspase-3比色法检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | A1086 |
| FLUOstar Omega酶标仪 | BMG Labtech | -- | |
| 启动子报告基因实验 | 人SERPINE1启动子-luciferase报告基因 | SwitchGear Genomics | -- |
| 鼠Serpine1启动子-luciferase报告基因 | SwitchGear Genomics | -- | |
| p65质粒 | Genecopoeia | -- | |
| JetPRIME转染试剂 | JetPRIME | -- | |
| LightSwitch双荧光素酶检测系统 | SwitchGear Genomics | -- | |
| GloMax 20/20发光检测仪 | Promega | -- | |
| 染色质免疫沉淀 | EZ-ChIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 荧光显微镜 | PureCol I型胶原 | Advanced BioMatrix | -- |
| 抗p65抗体 | Abcam | 16502 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗兔二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-11012 | |
| 组织学与免疫组化 | 抗原修复液 | Abcam | ab208572 |
| 马血清 | Thermo Fisher Scientific | 16050130 | |
| F4/80抗体 | Invitrogen | MF48000 | |
| CD31抗体 | Novus | NBP2-33154 | |
| Alexa Fluor 488驴抗兔二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-21206 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗小鼠二抗 | Thermo Fisher Scientific | A-11032 | |
| 含DAPI的Vectashield封片剂 | Vector Laboratories, Inc | H-1300-10 | |
| 荧光显微镜 | Keyence BZX-700荧光显微镜 | Keyence | -- |
| 外泌体分离 | ExoQuick-TC外泌体提取试剂盒 | System Biosciences | EXOTC50A-1 |
| Slide-A-Lyzer透析卡 | Thermo Fisher | -- | |
| PAI-1中和实验 | PAI-1中和抗体 | Genetex | gtx89568 |
| 溶酶体活性检测 | Lyso-Tracker红色荧光染料 | Thermo Fisher | L7528 |
| 糖酵解检测 | 糖酵解检测试剂盒 | Millipore Sigma | MAK439 |
| 重组蛋白处理 | 重组人PAI-1野生型 | Innovative Research | IHUPAI1RSM |
| 重组人PAI-1突变体(R76E/I91L) | Innovative Research | IHUPAI1RLRP | |
| 重组人PAI-1突变体(T333R/A335R) | Innovative Research | IHUPAI1RP12P14SB | |
| 重组人PAI-1突变体(K154T/Q319L/M354I/N150H) | Innovative Research | IHUPAI1RSMVN | |
| 细胞因子处理 | 肿瘤坏死因子-α | Invitrogen | RTNFAI |
| 白细胞介素-1β | Invitrogen | a42509 | |
| 细胞培养 | 冻存人肝细胞 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与给药 | 小鼠品系、性别、月龄;FOLFOX各组分剂量和给药方式、频率、持续时间;SAMe剂量、给药途径、频率、开始时间 阅读提示:Methods: Animal Study |
| 原代细胞分离与培养 | 肝细胞、KCs、HSCs、LSECs的分离方法、纯度、培养条件 阅读提示:Methods: Cell Culture and Treatments |
| 细胞处理 | SAMe、IL-1β、TNF-α、重组PAI-1及其突变体的浓度和处理时间 阅读提示:Methods: Cell Culture and Treatments; Figure 3, 6, 7, 8 legends |
| 分子生物学检测 | RT-qPCR的基因和引物;Western blot的一抗和稀释比例;免疫共沉淀的抗体和条件;启动子报告基因的质粒和检测系统;染色质免疫沉淀的抗体量和PCR条件 阅读提示:Methods: RNA Extraction and Real-Time PCR, Western Blots and Coimmunoprecipitation, PAI-1 Promoter Reporter Assay, Chromatin Immunoprecipitation Assay |
| 组织学与免疫组化 | 组织固定、包埋、切片厚度;H&E、Sirius red、IHC、TUNEL、免疫荧光的抗体和条件 阅读提示:Methods: Hematoxylin-Eosin Staining and Immunohistochemistry, TUNEL Assay, Fluorescence Microscopy |
| 生化检测 | 血浆PAI-1、ALT、AST、caspase-3活性、乳酸、溶酶体活性的检测方法 阅读提示:Methods: Plasma PAI-1 and Aminotransferase Levels, In Vivo Caspase-3 Activity Assay, Detection of Lysosomal Activity and Glycolysis |
| 外泌体分离与处理 | 外泌体分离方法、用量、处理细胞类型和时间 阅读提示:Methods: Exosome Isolation and Incubation with KCs and LSECs |
| 统计分析 | 统计方法、重复数、显著性水平 阅读提示:Methods: Statistical Analysis |