Fgf21表达分析
分析Fgf21在胸腺基质细胞亚群中的表达模式及年龄相关变化。
利用已发表的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,分析不同TEC亚群中Fgf21的表达水平。
Paracrine FGF21 dynamically modulates mTOR signaling to regulate thymus function across the lifespan
包含基因敲入小鼠模型、流式细胞术、免疫荧光、病毒感染模型、T细胞功能与耐受性分析等多层级验证,并包含功能获得与药理学抑制实验。
LPOFGF21敲入小鼠(mTEC中过表达FGF21) C57BL/6小鼠 FoxN1Cre R26Confetti报告小鼠(用于cTEC形态分析) 流感病毒感染小鼠模型
LPOFGF21 KI小鼠中mTEC特异性过表达FGF21,mCherry作为报告基因。 mTOR信号通路动态变化:2.5周龄时mTORC1活性增加,3月龄和12月龄时mTORC2活性增加。 雷帕霉素处理(4 mg/kg,腹腔注射,隔日一次,持续2周)可消除FGF21过表达对胸腺大小和mTOR信号的影响。 流感病毒感染实验:12月龄或18月龄小鼠,鼻内感染1000 p.f.u.流感病毒(X31或PR8),监测体重变化和病毒清除。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析Fgf21在胸腺基质细胞亚群中的表达模式及年龄相关变化。
利用已发表的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,分析不同TEC亚群中Fgf21的表达水平。
在mTEC中实现FGF21的广泛、特异性过表达。
设计靶向Lpo基因的敲入载体,将Fgf21和mCherry cDNA插入Lpo基因外显子13末端,通过CRISPR-Cas9技术生成LPOFGF21 KI小鼠。
确认FGF21和mCherry在mTEC中的特异性表达,并排除外周循环FGF21的影响。
通过流式细胞术和免疫荧光检测mCherry在胸腺基质细胞亚群中的表达;通过qRT-PCR检测Lpo、Fgf21和mCherry mRNA水平;通过ELISA检测血清和胸腺组织中的FGF21水平。
确定FGF21过表达对胸腺大小、细胞总数和各亚群数量的影响。
比较不同年龄LPOWT和LPOFGF21小鼠的胸腺体指数(胸腺重量/体重)、总胸腺细胞数和TEC及胸腺细胞亚群的数量。
探索FGF21过表达对cTEC中mTORC1/mTORC2信号的影响。
通过流式细胞术检测cTEC中p4E-BP1(mTORC1活性)和pAktS473(mTORC2活性)的水平,并检测TSC1表达。
验证FGF21对胸腺大小和mTOR信号的影响是否通过mTOR通路介导。
对3周龄LPOWT和LPOFGF21小鼠腹腔注射雷帕霉素(4 mg/kg)或溶剂,隔日一次,持续2周,然后分析胸腺表型和mTOR信号。
评估FGF21过表达对老年小鼠T细胞功能和抗病毒免疫的影响。
对12月龄或18月龄LPOWT和LPOFGF21小鼠鼻内感染流感病毒(X31或PR8),监测体重变化,分析胸腺细胞数、肺病毒mRNA和流感特异性CD8+ T细胞。
探究FGF21过表达对年龄相关中枢耐受和外周自身免疫的影响。
通过流式细胞术检测胸腺细胞中克隆清除(cleaved caspase 3+)的比例,并检测血清中抗核抗体(ANA)和组织中的淋巴细胞浸润。
确定FGF21过表达对cTEC大小和形态的影响。
利用FoxN1Cre R26Confetti报告小鼠标记单个TEC,通过共聚焦显微镜和3D重建分析cTEC面积和形态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因敲入小鼠构建 | eSpCas9核酸酶 | Millipore-Sigma | -- |
| sgRNA | Synthego | -- | |
| GenScript质粒 | GenScript | -- | |
| 流式细胞术 | Cytek Aurora光谱流式细胞仪 | Cytek | -- |
| BD FACS Aria Fusion细胞分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 抗磷酸化AktS473抗体 | Cell Signaling Technology | 11962 | |
| 抗磷酸化4EBP1T36/45抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗磷酸化S6S235/236抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗TSC1抗体 | Invitrogen | -- | |
| Zombie Violet活力染料 | Biolegend | 423113 | |
| APC偶联Annexin V | Invitrogen | A35110 | |
| Ki67抗体 | Biolegend | -- | |
| Foxp3固定/破膜缓冲液 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| qRT-PCR | RNAqueous Micro试剂盒 | Invitrogen | AM1931 |
| E.Z.N.A. HP总RNA试剂盒 | Omega | R6812 | |
| SuperScript VILO cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| TaqMan PreAmp预扩增预混液试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4384267 | |
| BioRad CFX96实时荧光定量PCR系统 | BioRad | -- | |
| ELISA | 小鼠/大鼠FGF-21 Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | MF2100 |
| 蛋白质提取 | EZLys组织蛋白提取试剂 | Abcam | ab286872 |
| 蛋白酶抑制剂 | Thermo Scientific | 78429 | |
| 免疫荧光 | 抗LPO抗体 | Proteintech | 10376-1-AP |
| 山羊抗兔Cy5二抗 | Thermo | A10523 | |
| 抗EpCAM A488抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗细胞角蛋白5 A647抗体 | Abcam | -- | |
| 抗细胞角蛋白8 A488抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Aire A647抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗DEC 205 A647抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗Ly51 A647抗体 | Biolegend | -- | |
| UEA1 FITC | Thermo | L32476 | |
| Prolong Diamond抗淬灭封片剂 | Thermo | P36961 | |
| Zeiss LSM710共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| 雷帕霉素处理 | 雷帕霉素 | Thermo Scientific | J62473.EX3 |
| 流感感染 | 流感A X31病毒 | -- | -- |
| 流感A PR8病毒 | -- | -- | |
| NP366–374四聚体 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 达沙替尼 | Tocris Bioscience | -- |
| ANA检测 | HEp-2载玻片 | MBL International | AN-1012 |
| 抗IgG FITC抗体 | Biolegend | poly4060 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | LPOFGF21敲入小鼠的构建,包含Lpo-Fgf21-mCherry插入序列,以及C57BL/6背景。 阅读提示:Methods: Generation of LPOFGF21 KI mice |
| 流式细胞术 | 胸腺基质细胞分离和染色方案,包括胶原酶消化、抗体克隆和稀释度。 阅读提示:Methods: Stromal cell isolation |
| mTOR信号分析 | 流式检测p4E-BP1、pAktS473、pS6和TSC1的抗体和固定/破膜条件。 阅读提示:Methods: Stromal cell isolation, 图4图例 |
| 雷帕霉素处理 | 雷帕霉素剂量(4 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、频率(隔日一次)和持续时间(2周)。 阅读提示:Methods: Rapamycin-mediated mTOR inhibition |
| 流感感染 | 病毒株(X31或PR8)、感染剂量(1000 p.f.u.)、途径(鼻内)和监测时间(0-10天)。 阅读提示:Methods: Influenza infection |
| T细胞耐受性分析 | 克隆清除检测的胸腺细胞群体(CD5+ TCRβ+)和标记物(cleaved caspase 3, CCR7),ANA检测的血清稀释度(1:100)和HEp-2载玻片。 阅读提示:Methods: 图7图例, Methods: ANA evaluation |