协同靶向双重信号通路与免疫检查点治疗胰腺癌

Targeting dual signalling pathways in concert with immune checkpoints for the treatment of pancreatic cancer

作者信息Erik S Knudsen, Vishnu Kumarasamy, Sejin Chung, Amanda Ruiz, Paris Vail, Stephanie Tzetzo, Jin Wu, Ram Nambiar, Jared Sivinski, Shailender S Chauhan, Mukund Seshadri, Scott I Abrams, Jianmin Wang, Agnieszka K Witkiewicz
PMID32424005
期刊Gut
发布时间2021-01
DOI10.1136/gutjnl-2020-321000

实验完整度

包含细胞系、PDX模型、同系模型等多层级验证,结合药物筛选、RNA测序、单细胞测序及体内功能验证。

主要模型

患者来源的胰腺导管腺癌细胞系 患者来源异种移植(PDX)模型 KPC来源的4662同系小鼠模型

重点核对

细胞系和PDX模型中的CDK4/6抑制剂palbociclib联合MEK抑制剂trametinib的剂量 RB依赖性基因表达变化的验证 同系模型中T细胞浸润和髓系细胞群体的变化 抗PD-L1抗体的使用及其与双药联合的协同效应

摘要

目的:本研究利用分子靶向治疗与免疫检查点抑制之间的交叉点,以确定治疗胰腺癌的新方法。设计:使用患者来源的细胞系和异种移植模型来定义肿瘤区室中CDK4/6和MEK抑制的反应。使用皮下和原位同系模型进行相对于免疫治疗的影响。采用单细胞RNA测序和多光谱成像来描绘肿瘤微环境中免疫环境的影响。结果:我们发现MEK和CDK4/6抑制剂联合治疗在广泛的PDX模型中有效延缓肿瘤进展。这些效应与稳定的细胞周期停滞以及RB依赖性干扰素反应和抗原呈递相关基因的诱导有关。使用单细胞测序和补充方法,我们发现CDK4/6和MEK抑制的组合对增加T细胞浸润和改变髓系群体有显著影响,同时与免疫检查点抑制剂有效协同。结论:总之,这些数据表明CDK4/6和MEK抑制具有影响肿瘤和免疫微环境的经典和非经典特征。这种联合靶向治疗与免疫检查点抑制剂治疗相结合可促进强大的肿瘤控制。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
组合靶向CDK4/6和MEK信号通路是否能在胰腺癌中增强抗肿瘤效果并与免疫检查点抑制剂协同。
核心机制
CDK4/6和MEK抑制联合可诱导RB依赖的细胞周期停滞和干扰素/抗原呈递基因表达,重塑肿瘤微环境中的髓系细胞和T细胞群体,从而增强抗PD-L1疗法的敏感性。
主要证据
在患者来源细胞系和PDX模型中观察到稳定的细胞周期停滞和肿瘤生长延迟;单细胞RNA测序显示T细胞浸润增加、髓系细胞亚群变化;同系模型联合抗PD-L1显著抑制肿瘤生长。
研究意义
支持将MEK和CDK4/6抑制剂用作改变肿瘤微环境以驱动抗PD-L1敏感性的策略,为临床测试提供基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外药物筛选与协同验证

鉴定与CDK4/6抑制协同抑制胰腺癌细胞增殖的药物。

使用活细胞成像系统筛选>300种癌症药物,验证MEK抑制剂与palbociclib的协同作用,通过BrdU掺入和Bliss分析确认协同。

2

细胞周期机制分析

阐明CDK4/6和MEK抑制联合对细胞周期调控的影响。

通过免疫印迹检测细胞周期蛋白表达,使用FUCCI报告系统和CDK2激酶实验评估细胞周期活性。

3

PDX模型抗肿瘤效果评估

在患者来源异种移植模型中验证治疗组合的抗肿瘤效果。

将PDX肿瘤片段皮下植入NSG小鼠,治疗3周,测量肿瘤体积并分析无进展生存期。

4

基因表达谱分析

识别组合治疗诱导的转录组变化,特别是免疫相关基因。

对细胞系和PDX肿瘤进行RNA测序,分析差异表达基因和通路富集。

5

同系模型肿瘤微环境分析

评估组合治疗对免疫细胞浸润和表型的影响。

使用KPC来源的4662同系模型,进行单细胞RNA测序和多光谱成像分析免疫细胞亚群。

6

联合免疫检查点抑制的疗效评估

测试组合治疗与抗PD-L1的协同抗肿瘤作用。

在皮下和原位同系模型中,比较单药、双药和三药联合的抗肿瘤效果,并对治愈小鼠进行再挑战实验。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
角质细胞无血清培养基Life Technologies10744019
牛垂体提取物Life Technologies10744019
胶原蛋白Millipore08-115
RIPA裂解缓冲液Santa Cruz BiotechnologySC-24948A
Halt蛋白酶抑制剂Thermo Fisher--
增强化学发光试剂盒Thermo Fisher34076
抗p-RB (S807/S811)抗体Cell Signaling Technology8516S
抗RB抗体Cell Signaling Technology9313S
抗pAkt (S473)抗体Cell Signaling Technology4070S
抗Akt抗体Cell Signaling Technology4691
抗pS6 (S235/236)抗体Cell Signaling Technology2211
抗S6抗体Cell Signaling Technology2217
抗cyclin E1抗体Cell Signaling Technology4129S
抗p27抗体Cell Signaling Technology2552S
抗肌动蛋白抗体Santa Cruz BiotechnologySC-47778
抗pERK (Y204)抗体Santa Cruz BiotechnologySC-7383
抗ERK抗体Santa Cruz BiotechnologySC-514302
抗cyclin D1抗体Santa Cruz BiotechnologySC-20044
抗cyclin A抗体Santa Cruz BiotechnologySC-271682
抗CDK2抗体Santa Cruz BiotechnologySC-6248
正常小鼠IgG1Cell Signaling Technology5415
BrdU ELISA试剂盒Roche11669915001
Biotek Synergy 2酶标仪Biotek--
ES-FUCCIAddgene62451
Lipofectamine 3000转染试剂InvitrogenLSL3000001
FACSAria流式分选仪BD Biosciences--
IncuCyte S3活细胞分析系统Essen Biosciences--
帕博西尼----
曲美替尼----
RNeasy Plus试剂盒Qiagen--
抗CD8抗体Abcamab209775
抗CD163抗体Abcamab182422
抗Ki67抗体Thermo FisherRM-9106S1
徕卡自动染色机Leica--
Vectra Polaris多光谱成像系统Perkin Elmer--
InFORM软件Perkin Elmer--
NSG小鼠Jackson Laboratories--
帕博西尼----
曲美替尼----
C57BL/6J小鼠----
4662细胞----
抗PD-L1抗体(克隆10F.9G2)BioXCellBE0101
InVivo MAB大鼠IgG2b同型对照BioXCellBE0090
Liberase消化酶Sigma541020001
抗CD45 BUV395偶联抗体BD Biosciences564616
活细胞染料eFluor780Thermo Fisher65-0865-14
10X Genomics平台10X Genomics--
Chromium Controller10X Genomics--
Countess FL自动细胞计数器Thermo Fisher--
TapeStation 4200Agilent Technologies--
Kapa Biosystems qPCR定量试剂盒Kapa Biosystems--
NovaSeq6000测序仪Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系来源、培养条件(培养基、添加剂、胶原包被)
阅读提示:Methods - Cell culture
体外药物处理
palbociclib和trametinib的浓度、处理时间
阅读提示:Results - 图1、图S1
PDX模型
PDX模型编号、植入小鼠品系(NSG)、治疗剂量和方案
阅读提示:Methods - Mice and patient-derived xenografts
同系模型
4662细胞注射数量、治疗分组、palbociclib剂量调整、抗PD-L1和抗CD8剂量方案
阅读提示:Methods - Syngeneic tumour model
单细胞测序
样品处理(liberase消化)、细胞分选策略(CD45+)、测序平台(10X Genomics)和数据处理参数
阅读提示:Methods - Single-cell sequencing and analysis