体外药物筛选与协同验证
鉴定与CDK4/6抑制协同抑制胰腺癌细胞增殖的药物。
使用活细胞成像系统筛选>300种癌症药物,验证MEK抑制剂与palbociclib的协同作用,通过BrdU掺入和Bliss分析确认协同。
Targeting dual signalling pathways in concert with immune checkpoints for the treatment of pancreatic cancer
包含细胞系、PDX模型、同系模型等多层级验证,结合药物筛选、RNA测序、单细胞测序及体内功能验证。
患者来源的胰腺导管腺癌细胞系 患者来源异种移植(PDX)模型 KPC来源的4662同系小鼠模型
细胞系和PDX模型中的CDK4/6抑制剂palbociclib联合MEK抑制剂trametinib的剂量 RB依赖性基因表达变化的验证 同系模型中T细胞浸润和髓系细胞群体的变化 抗PD-L1抗体的使用及其与双药联合的协同效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与CDK4/6抑制协同抑制胰腺癌细胞增殖的药物。
使用活细胞成像系统筛选>300种癌症药物,验证MEK抑制剂与palbociclib的协同作用,通过BrdU掺入和Bliss分析确认协同。
阐明CDK4/6和MEK抑制联合对细胞周期调控的影响。
通过免疫印迹检测细胞周期蛋白表达,使用FUCCI报告系统和CDK2激酶实验评估细胞周期活性。
在患者来源异种移植模型中验证治疗组合的抗肿瘤效果。
将PDX肿瘤片段皮下植入NSG小鼠,治疗3周,测量肿瘤体积并分析无进展生存期。
识别组合治疗诱导的转录组变化,特别是免疫相关基因。
对细胞系和PDX肿瘤进行RNA测序,分析差异表达基因和通路富集。
评估组合治疗对免疫细胞浸润和表型的影响。
使用KPC来源的4662同系模型,进行单细胞RNA测序和多光谱成像分析免疫细胞亚群。
测试组合治疗与抗PD-L1的协同抗肿瘤作用。
在皮下和原位同系模型中,比较单药、双药和三药联合的抗肿瘤效果,并对治愈小鼠进行再挑战实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 角质细胞无血清培养基 | Life Technologies | 10744019 |
| 牛垂体提取物 | Life Technologies | 10744019 | |
| 胶原蛋白 | Millipore | 08-115 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解缓冲液 | Santa Cruz Biotechnology | SC-24948A |
| Halt蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 增强化学发光试剂盒 | Thermo Fisher | 34076 | |
| 抗p-RB (S807/S811)抗体 | Cell Signaling Technology | 8516S | |
| 抗RB抗体 | Cell Signaling Technology | 9313S | |
| 抗pAkt (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4070S | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 抗pS6 (S235/236)抗体 | Cell Signaling Technology | 2211 | |
| 抗S6抗体 | Cell Signaling Technology | 2217 | |
| 抗cyclin E1抗体 | Cell Signaling Technology | 4129S | |
| 抗p27抗体 | Cell Signaling Technology | 2552S | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-47778 | |
| 抗pERK (Y204)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-7383 | |
| 抗ERK抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-514302 | |
| 抗cyclin D1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-20044 | |
| 抗cyclin A抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-271682 | |
| CDK2激酶实验 | 抗CDK2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-6248 |
| 正常小鼠IgG1 | Cell Signaling Technology | 5415 | |
| 细胞增殖实验 | BrdU ELISA试剂盒 | Roche | 11669915001 |
| Biotek Synergy 2酶标仪 | Biotek | -- | |
| FUCCI分析 | ES-FUCCI | Addgene | 62451 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | LSL3000001 | |
| FACSAria流式分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 药物筛选 | IncuCyte S3活细胞分析系统 | Essen Biosciences | -- |
| 帕博西尼 | -- | -- | |
| 曲美替尼 | -- | -- | |
| 基因表达分析 | RNeasy Plus试剂盒 | Qiagen | -- |
| 免疫组织化学 | 抗CD8抗体 | Abcam | ab209775 |
| 抗CD163抗体 | Abcam | ab182422 | |
| 抗Ki67抗体 | Thermo Fisher | RM-9106S1 | |
| 徕卡自动染色机 | Leica | -- | |
| Vectra Polaris多光谱成像系统 | Perkin Elmer | -- | |
| InFORM软件 | Perkin Elmer | -- | |
| 动物实验 | NSG小鼠 | Jackson Laboratories | -- |
| 帕博西尼 | -- | -- | |
| 曲美替尼 | -- | -- | |
| 同系肿瘤模型 | C57BL/6J小鼠 | -- | -- |
| 4662细胞 | -- | -- | |
| 抗PD-L1抗体(克隆10F.9G2) | BioXCell | BE0101 | |
| InVivo MAB大鼠IgG2b同型对照 | BioXCell | BE0090 | |
| 单细胞测序 | Liberase消化酶 | Sigma | 541020001 |
| 抗CD45 BUV395偶联抗体 | BD Biosciences | 564616 | |
| 活细胞染料eFluor780 | Thermo Fisher | 65-0865-14 | |
| 10X Genomics平台 | 10X Genomics | -- | |
| Chromium Controller | 10X Genomics | -- | |
| Countess FL自动细胞计数器 | Thermo Fisher | -- | |
| TapeStation 4200 | Agilent Technologies | -- | |
| Kapa Biosystems qPCR定量试剂盒 | Kapa Biosystems | -- | |
| NovaSeq6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养条件(培养基、添加剂、胶原包被) 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 体外药物处理 | palbociclib和trametinib的浓度、处理时间 阅读提示:Results - 图1、图S1 |
| PDX模型 | PDX模型编号、植入小鼠品系(NSG)、治疗剂量和方案 阅读提示:Methods - Mice and patient-derived xenografts |
| 同系模型 | 4662细胞注射数量、治疗分组、palbociclib剂量调整、抗PD-L1和抗CD8剂量方案 阅读提示:Methods - Syngeneic tumour model |
| 单细胞测序 | 样品处理(liberase消化)、细胞分选策略(CD45+)、测序平台(10X Genomics)和数据处理参数 阅读提示:Methods - Single-cell sequencing and analysis |