评估VLCFA水平对BTZ敏感性的影响
验证VLCFAs是否调节MM细胞对硼替佐米的反应
通过shRNA敲低ELOVL1或用ELOVL1抑制剂处理MM细胞,检测BTZ诱导的细胞毒性和ER应激;另外,外源添加VLCFAs或长链脂肪酸(LCFAs)观察对BTZ毒性的影响。
Targeting ABCD1-ACOX1-MET/IGF1R axis suppresses multiple myeloma
包含体外细胞实验(shRNA敲低、过表达、药物处理、脂质组学、磷酸化蛋白芯片)、体内异种移植瘤模型及机制验证(DRM分离、交联实验),证据层级完整。
人骨髓瘤细胞系ARH77、KMS11、MM.1R 硼替佐米耐药细胞系ARH77-R、KMS11-R NOG小鼠皮下异种移植瘤模型 原代CD138+骨髓瘤细胞
TDYA给药剂量:体外50μM,体内100 mg/kg口服 BTZ给药方案:体内0.5 mg/kg腹腔注射,隔天一次 BTZ耐药细胞株的建立:递增浓度至6 nM,持续5个月 pacFA-GalCer交联实验条件:5 μM孵育30分钟,365 nm UV照射15分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证VLCFAs是否调节MM细胞对硼替佐米的反应
通过shRNA敲低ELOVL1或用ELOVL1抑制剂处理MM细胞,检测BTZ诱导的细胞毒性和ER应激;另外,外源添加VLCFAs或长链脂肪酸(LCFAs)观察对BTZ毒性的影响。
探究抑制VLCFA降解是否能增强BTZ的细胞毒性
通过shRNA或CRISPR敲低ABCD1或ACOX1,或过表达这些基因,或用ACOX1抑制剂TDYA处理,检测MM细胞活力、凋亡和ER应激标志物。
评估ACOX1抑制是否能逆转BTZ耐药并在体内增强BTZ疗效
用BTZ诱导耐药细胞系(ARH77-R、KMS11-R),用TDYA和/或BTZ处理,检测细胞活力;在NOG小鼠中接种亲本或耐药细胞,给予TDYA、BTZ或联合治疗,测量肿瘤体积。
探究抑制ACOX1或ABCD1对脂质组成和受体酪氨酸激酶活性的影响
对敲低ACOX1/ABCD1或TDYA处理的ARH77细胞进行非靶向脂质组学分析,检测神经酰胺和脑苷脂中VLCFA富集情况;通过磷酸化蛋白阵列和免疫印迹检测MET、IGF1R及其下游信号分子的磷酸化水平。
阐明TDYA如何抑制MET和IGF1R活性
通过密度梯度离心分离DRM,检测MET、IGF1R和DRM标志物FLOT1的分布;使用光活化脑苷脂类似物pacFA-GalCer进行交联和链霉亲和素下拉,检测与MET、IGF1R的相互作用;使用LipiORDER和CTB染色评估DRM完整性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞分离 | 骨髓CD138阳性选择试剂盒 | StemCell Technologies | -- |
| 细胞培养检测 | MycoAlert支原体检测试剂盒 | Lonza | LT07-318 |
| 细胞活力检测 | 台盼蓝 | MilliporeSigma | T8154-100ml |
| 细胞增殖检测 | CellTiter 96 AQueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | G3581 |
| 药物处理 | 硼替佐米 | Selleckchem | S1013 |
| 卡非佐米 | MedChemExpress | HY-10455 | |
| 来那度胺 | MedChemExpress | HY-A0003 | |
| 10,12-二十三碳二炔酸 | MedChemExpress | HY-135425 | |
| 木蜡酸 | MedChemExpress | HY-121883 | |
| 神经酸 | MedChemExpress | HY-N2526 | |
| 己酸 | MedChemExpress | HY-113301 | |
| 花生酸 | MedChemExpress | HY-W004260 | |
| 二十碳烯酸 | MedChemExpress | HY-109589A | |
| 细胞处理 | 甲基-beta-环糊精 | MilliporeSigma | C4555-5G |
| 细胞标记 | 霍乱毒素B亚基 | MilliporeSigma | SAE0069-500UG |
| 免疫印迹 | ELOVL1抗体 | Novus Biologicals | NBP2-82997 |
| ATF6抗体 | Proteintech Group | 24169-1-AP | |
| ABCD1抗体 | Proteintech Group | 18138-1-AP | |
| ACOX1抗体 | Proteintech Group | 68017-1-Ig | |
| p-MET抗体 | Rockland Immunochemicals | 600-401-989S | |
| IGF1R抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-81464 | |
| p-IGF1R抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-135767 | |
| MET抗体 | Cell Signaling Technology | 8198T | |
| ERBB2抗体 | Cell Signaling Technology | 2165T | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060T | |
| ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9102S | |
| p-ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101S | |
| RNA表达分析 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| TaqMan Master Mix | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 病毒感染 | psPAX2载体 | Addgene | -- |
| pCMV-VSV-G载体 | Addgene | -- | |
| lentiCRISPR.v2载体 | Addgene | 52961 | |
| 凋亡检测 | Annexin V抗体(H-3)Alexa Fluor 594 | Santa Cruz Biotechnology | sc-74438 |
| 磷酸化蛋白阵列 | Phospho Explorer抗体阵列PEX100 | Full Moon BioSystems | -- |
| 动物实验 | 橄榄油 | MilliporeSigma | O1514-500ML |
| DRM分离 | Caveolae/Rafts分离试剂盒 | MilliporeSigma | CS0750 |
| 交联实验 | pacFA-GalCer | Avanti Polar Lipids | 900404P-1mg |
| Click-&-Go蛋白反应缓冲液试剂盒 | Vector Laboratories | CCT-1001 | |
| TAMRA-生物素-叠氮化物 | Vector Laboratories | CCT-1048-1 | |
| 链霉亲和素包被磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88816 | |
| DRM检测 | LipiORDER染料 | Diagnocine | FNK-FDV-0041 |
| FluoroBrite DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | A18967-01 | |
| Vybrant Alexa-Fluor-488脂筏标记试剂盒 | Molecular Probes | V-34403 | |
| 统计分析 | QS6 Fast实时PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和药物处理 | 细胞系来源,培养基成分(RPMI或DMEM加10% FBS等),药物浓度(BTZ、TDYA等),处理时间 阅读提示:Methods中的'Primary MM cells and cell lines'和'Reagents'部分 |
| ELOVL1/ABCD1/ACOX1敲低或过表达 | shRNA或sgRNA序列,慢病毒感染条件,敲低效率验证 阅读提示:Methods中的'Plasmids and infection'部分及图1-3图注 |
| BTZ耐药细胞系建立 | BTZ浓度递增方案(最高6 nM),处理时长(5个月),耐药验证(EC50测定) 阅读提示:Methods中的'Primary MM cells and cell lines'部分 |
| 异种移植瘤模型 | 小鼠品系(NOG),注射细胞数(未明确),给药剂量和途径(TDYA 100 mg/kg口服,BTZ 0.5 mg/kg腹腔),治疗周期(最多18天) 阅读提示:Methods中的'Experiments with mice'部分及图4图注 |
| DRM分离和交联实验 | 细胞数,pacFA-GalCer浓度(5 μM),孵育时间(30 min),UV照射条件(365 nm,15 min),密度梯度离心条件(200,000 g,4 h) 阅读提示:Methods中的'Isolation of detergent-resistant membranes'和'Photoactivated galactosyl ceramide cross-linking assay'部分 |