患者入组与基线评估
纳入难以切除的皮肤基底细胞癌患者,记录基线特征。
筛选符合条件的患者,收集临床和病理数据,专家小组确定手术必要性。
Efficacy and tolerability of neoadjuvant therapy with Talimogene laherparepvec in cutaneous basal cell carcinoma: a phase II trial (NeoBCC trial)
包含II期临床试验(疗效与安全性终点)、mIF空间分析、scRNA-seq、scTCR-seq和scBCR-seq等多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。
皮肤基底细胞癌患者(18例,难以切除) 肿瘤组织样本(FFPE切片用于mIF,单细胞悬液用于scRNA-seq)
患者入组标准:≥18岁,组织学确诊的BCC,需皮肤瓣或移植才能闭合伤口 T-VEC给药方案:瘤内注射,初始剂量106 p.f.u./ml,后续剂量108 p.f.u./ml,每14天一次 主要终点:六周期T-VEC后无需整形重建手术即可切除的比例 病理反应评估:pCR vs non-pCR,由三位病理学家盲法评估 免疫分析:mIF(CD4, CD8, CD20, Foxp3, CD68, PanCK)和scRNA-seq
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
纳入难以切除的皮肤基底细胞癌患者,记录基线特征。
筛选符合条件的患者,收集临床和病理数据,专家小组确定手术必要性。
评估T-VEC瘤内注射的疗效与安全性。
患者接受六周期T-VEC治疗,周期为13周,评估肿瘤面积变化和不良事件。
评估治疗后肿瘤是否可切除及病理缓解程度。
治疗结束后进行手术切除,评估是否需要皮瓣/移植,进行病理学检查。
记录不良事件和复发情况。
在随访期间监测不良事件、复发、新发BCC和生存情况。
探究T-VEC对肿瘤免疫微环境的影响。
使用mIF和scRNA-seq分析治疗前后免疫细胞组成和空间分布。
分析T细胞和B细胞受体克隆扩增。
进行scTCR-seq和scBCR-seq,分析克隆类型和扩增程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 多重免疫荧光 | Opal 7实体肿瘤免疫学试剂盒 | Akoya Biosciences | OP7TL4001KT |
| Vectra Polaris | Akoya Biosciences | -- | |
| inForm | Akoya Biosciences | -- | |
| HALO图像分析软件 | Indica Labs | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| CD138抗体 | Proteintech | 10593-1-AP | |
| IgG1抗体 | Novus Biologicals | NBP2-62028 | |
| PanCK抗体 | Novus Biologicals | NBP2-29429 | |
| 细胞解离与分选 | Miltenyi皮肤解离试剂盒 | Miltenyi | 130-101-540 |
| ACK缓冲液 | Gibco | A10492-01 | |
| CD45 PerCP-Cy5.5抗体 | BioLegend | 304027 | |
| EpCAM APC抗体 | BioLegend | 324207 | |
| FACSAria流式细胞分选仪 | BD | -- | |
| 单细胞RNA测序 | 10x Genomics 5' 试剂盒 v1.1 | 10x Genomics | -- |
| Qubit dsDNA高灵敏度试剂盒 | Invitrogen | Q33231 | |
| NovaSeq SP流动槽 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者入组 | 年龄≥18岁,组织学确诊的BCC,需要皮肤瓣或移植才能闭合伤口,排除特定亚型 阅读提示:Methods: Patient eligibility |
| T-VEC给药 | 剂量:初始106 p.f.u./ml,后续108 p.f.u./ml;频率:每14天一次;途径:瘤内注射;周期:6次 阅读提示:Methods: Study design, treatment schedule and sample collection |
| 主要终点评估 | 六周期T-VEC后是否可切除且无需皮肤瓣/移植 阅读提示:Results: Primary end point |
| 病理反应评估 | pCR vs non-pCR,由三位病理学家盲法评估 阅读提示:Methods: Histopathologic classification and response evaluation |
| 免疫分析 | mIF panel:CD4, CD8, CD20, Foxp3, CD68, PanCK;scRNA-seq样本处理和数据分析参数 阅读提示:Methods: Multiplex immunofluorescence; Preparation of single-cell RNA sequencing libraries; Single-cell RNA sequencing analysis |