生成并验证VEC特异性Cre小鼠
建立肺静脉内皮细胞特异性、诱导型Cre工具鼠,用于谱系追踪。
通过CRISPR-Cas9将T2A-CreERT2插入Slc6a2基因3'UTR,生成Slc6a2CreERT2小鼠,并与Rosa26RtdTomato杂交,验证其特异性和效率。
Dynamic behavior and lineage plasticity of the pulmonary venous endothelium
研究包含细胞系追踪、动物模型(流感、SARS-CoV-2、高氧损伤)、单细胞RNA测序和功能验证(EdU增殖、分化标记),证据层级多样,验证充分。
Slc6a2CreERT2;Rosa26RtdTomato小鼠(静脉内皮细胞谱系追踪) 流感病毒(H1N1 PR8)感染小鼠模型 MA30 SARS-CoV-2感染小鼠模型 高氧暴露小鼠模型
Slc6a2CreERT2小鼠的诱导方案:5次他莫昔芬注射(250 mg/kg体重),每次间隔一天,注射后休息一周 流感感染剂量:25-45 TCID50单位,鼻腔内接种 高氧暴露:90%氧气浓度,持续3天,随后恢复正常空气14天 单细胞RNA测序时间点:0、10、20、30天(感染后) 克隆谱系追踪实验使用Cdh5CreERT2小鼠和有限剂量他莫昔芬
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立肺静脉内皮细胞特异性、诱导型Cre工具鼠,用于谱系追踪。
通过CRISPR-Cas9将T2A-CreERT2插入Slc6a2基因3'UTR,生成Slc6a2CreERT2小鼠,并与Rosa26RtdTomato杂交,验证其特异性和效率。
观察静脉内皮细胞在肺损伤后的动态行为。
对VEC报告小鼠进行流感(H1N1 PR8)、SARS-CoV-2(MA30)感染或高氧暴露,在指定时间点收集肺组织,通过PCLS成像分析tdTomato+细胞的分布和形态。
定量比较损伤后与对照静脉出芽程度。
使用AngioTool软件对PCLS z-stack最大投影图像进行分支指数分析。
确认静脉内皮细胞是否分化为毛细血管内皮细胞。
对PCLS进行免疫染色,检测BST1(静脉标记)、PLVAP/GPIHBP1(一般毛细血管标记)、CAR4/CD34(含气毛细血管标记)的表达,并测量分支血管直径。
评估静脉内皮细胞在损伤后的增殖能力。
通过EdU掺入实验和流式细胞术检测tdTomato+内皮细胞的增殖比例。
解析VEC在损伤和修复过程中的转录组动态和细胞命运转变。
在不同时间点(0、10、20、30 DPI)分选TdTomato+ ECs进行scRNA-seq,分析聚类、差异表达、拟时间轨迹和细胞通讯。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因编辑 | PX459 | -- | -- |
| 他莫昔芬诱导 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 肺切片制备 | 超纯低熔点琼脂糖 | Invitrogen | -- |
| Leica VT1000 S振动切片机 | Leica | -- | |
| 免疫荧光染色 | ProLong Gold防淬灭封片剂 | Life Sciences | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 抗小鼠CA4抗体 | R&D Systems | AF2414 | |
| 抗小鼠BST1抗体 | BioLegend | 140207 | |
| 抗小鼠ERG抗体 | Abcam | ab92513 | |
| 抗小鼠PLVAP抗体 | Hybridoma Bank | MECA-32 | |
| 抗小鼠RFP抗体 | Rockland | 600-401-379 | |
| 抗小鼠RFP抗体 | Rockland | 200-101-379 | |
| 抗小鼠VEGFR3抗体 | R&D Systems | AF743 | |
| 抗小鼠SYP抗体 | Proteintech | 17785-1-AP | |
| 抗小鼠RAGE抗体 | R&D Systems | MAB1179-100 | |
| 抗小鼠DC-LAMP抗体 | Novus Biologicals | DDX0192P-100 | |
| 抗小鼠KRT5抗体 | BioLegend | 905901 | |
| 抗小鼠EBF1抗体 | R&D Systems | AF5165 | |
| 抗小鼠PDGFRα抗体 | R&D Systems | AF1062 | |
| 抗小鼠GPIHBP1抗体 | Novus Biologicals | NB110-41537 | |
| 抗小鼠CD34抗体 | BioLegend | 119309 | |
| GSL I凝集素B4,荧光素标记 | Vector Laboratories | FL-1201 | |
| 脉管灌注 | 番茄凝集素 | Vector Laboratories | B-1175-1 |
| Dylight 488标记番茄凝集素 | Vector Laboratories | DL-1174-1 | |
| Alexa Fluor 488标记链霉亲和素 | BioLegend | 405235 | |
| 支气管肺泡灌洗 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 |
| 细胞消化 | II型胶原酶 | Worthington Biochemical | LS004176 |
| 脱氧核糖核酸酶I | MilliporeSigma | D4527 | |
| 流式细胞术 | Draq7染料 | BioLegend | 424001 |
| eBioscience固定化活力染料eFluor 780 | Thermo Fisher Scientific | 65-0865-14 | |
| Brilliant Violet 785标记抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103149 | |
| PE-Cyanine7标记抗小鼠PECAM/CD31 | BioLegend | 102523 | |
| APC标记抗小鼠BST1/CD157 | BioLegend | 140207 | |
| BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| BD FACSAria Fusion分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| EdU检测 | Click-iT EdU Alexa Fluor 488成像试剂盒 | Life Technologies | C10086 |
| 单细胞转录组 | 10x Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 高氧暴露 | ProOx360单气体控制器 | BioSpherix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 谱系追踪诱导 | 他莫昔芬注射剂量(250 mg/kg)、次数(5次)、间隔(隔天一次)、注射途径(腹腔注射) 阅读提示:详见Methods 'Influenza lung injury'和'Adult hyperoxia lung injury'部分 |
| 流感损伤模型 | 病毒株(A/H1N1/PR/8)、剂量(25-45 TCID50单位)、接种体积(30 μl)、体重下降标准(≥15%)、年龄(8-12周) 阅读提示:详见Methods 'Influenza lung injury'部分 |
| SARS-CoV-2损伤模型 | 病毒株(MA30)、剂量(10^4 PFU)、接种体积(40 μl)、年龄(≥3个月)、麻醉方案(氯胺酮-赛拉嗪) 阅读提示:详见Methods 'Mouse-adapted SARS-CoV-2 injury'部分 |
| 高氧损伤模型 | 氧气浓度(90%)、暴露时间(3天)、恢复时间(14天)、他莫昔芬处理与高氧暴露的时序 阅读提示:详见Methods 'Adult hyperoxia lung injury'部分 |
| PCLS制备 | 琼脂糖浓度(2%)、固定时间(3.2% PFA 1小时)、切片厚度(300 μm) 阅读提示:详见Methods 'PCLSs'部分 |
| 免疫荧光染色 | 抗体稀释比例、孵育时间(PCLS 3天,切片过夜)、洗涤次数 阅读提示:详见Methods 'Immunofluorescence'部分和相应图例 |
| EdU增殖检测 | EdU剂量(50 mg/kg)、注射频率(每两天)、给药时间(感染后第3天至收获)、检测试剂盒 阅读提示:详见Methods 'EdU treatment and analysis'部分 |
| 单细胞RNA测序 | 细胞分选策略(TdTomato+/CD31+/CD45−)、时间点(0、10、20、30 DPI)、平台(10x Genomics)、测序深度 阅读提示:详见Methods 'Single-cell transcriptomics'部分和图例 |