验证TYK2对tau水平的调控
验证TYK2是否为tau水平的调控因子。
在人类神经母细胞瘤细胞中通过shRNA敲低或小分子抑制剂抑制TYK2,检测tau水平;过表达TYK2检测tau水平。
TYK2 regulates tau levels, phosphorylation and aggregation in a tauopathy mouse model
实验涵盖细胞模型、原代神经元、多种小鼠模型及人脑样本,包含功能验证(敲低/过表达)和机制验证(磷酸化、自噬、聚集)。
人神经母细胞瘤细胞系(BE(2)-C、SH-SY5Y)和HEK293T细胞 原代培养小鼠皮层神经元 P301S tau转基因小鼠(PS19)及腺相关病毒(AAV8)介导的tau过表达小鼠模型 人类AD患者脑组织样本
TYK2敲低或抑制是否降低tau水平(细胞和脑组织) TYK2是否在Tyr29位点磷酸化tau(体外激酶实验和免疫沉淀) Tyr29磷酸化是否通过抑制自噬稳定tau(泛素化分析、自噬抑制) TYK2是否促进tau聚集(细胞聚集实验和体内模型) Tyk2敲低是否减轻tau病理和胶质增生(PS19小鼠模型)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TYK2是否为tau水平的调控因子。
在人类神经母细胞瘤细胞中通过shRNA敲低或小分子抑制剂抑制TYK2,检测tau水平;过表达TYK2检测tau水平。
确定TYK2是否与tau结合并磷酸化tau,及磷酸化位点。
进行免疫共沉淀验证结合,体外激酶实验检测磷酸化,通过突变Y29F和intrabody验证位点。
探究TYK2介导的Tyr29磷酸化是否稳定tau,并揭示机制。
在原代神经元中诱导表达tau WT或Y29F,去除DOX后追踪tau降解;检测泛素化类型和自噬/蛋白酶体抑制的影响。
证实TYK2介导的Tyr29磷酸化促进病理性tau聚集。
在HEK293T细胞中表达tau P301S或Y29F/P301S,加入tau种子,检测不溶性tau聚集;使用YFP融合蛋白和FRET生物传感器细胞。
在体内模型中验证TYK2对tau磷酸化和聚集的影响。
通过P0-ICV注射AAV8表达tau P301S或Y29F/P301S及TYK2KD,检测脑内tau病理;在PS19小鼠中敲低Tyk2观察病理改善。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985070 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-500 |
| TransIT-293转染试剂 | Mirus Bio | -- | |
| 药物处理 | 德卡伐替尼 | -- | -- |
| 多西环素 | -- | -- | |
| 氯喹 | -- | -- | |
| MG132蛋白酶体抑制剂 | -- | -- | |
| 原钒酸钠 | -- | -- | |
| TNO155(PTPN11抑制剂) | -- | -- | |
| Zlc002(CAPON抑制剂) | -- | -- | |
| 抗体 | TYK2抗体 | Abcam | ab303500 |
| 磷酸化TYK2 (pY292)抗体 | Abcam | ab138394 | |
| PHF1抗体 | Peter Davies | -- | |
| tau抗体 | Abcam | ab80579 | |
| tau抗体 | Agilent | A0024 | |
| HA抗体 | BioLegend | 901514 | |
| Flag (M2)抗体 | Sigma-Aldrich | F3156 | |
| 磷酸化tau (pT205)抗体 | Thermo Fisher Scientific | 44-738G | |
| 寡聚tau抗体 | Merck Millipore | ABN454-I | |
| 磷酸化酪氨酸抗体 | Merck Millipore | 05-321 | |
| FYN抗体 | Cell Signaling Technology | 4023 | |
| Vinculin抗体 | Sigma-Aldrich | V9131 | |
| GAPDH抗体 | ImmunoChemical | 2-RGM2 | |
| GFAP抗体 | Norus Biologicals | 53809 | |
| IBA1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 磷酸化tau (pTyr29)抗体 | -- | -- | |
| 磷酸化tau (pTyr18)抗体 | MediaMabs | MM-0194-P | |
| 磷酸化tau (pS396)抗体 | Cell Signaling Technology | 9632S | |
| DUSP1抗体 | ABclonal | A2919 | |
| β-连环蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 8480 | |
| 驴抗兔IgG Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher Scientific | A-31572 | |
| 驴抗山羊IgG Alexa Fluor 594 | Jackson ImmunoResearch | 705-585-003 | |
| 驴抗兔IgG IRDye 800CW | LI-COR Bioscience | 926-32213 | |
| 山羊抗兔IgG IRDye 680RD | LI-COR Bioscience | 926-68071 | |
| 山羊抗小鼠IgG IRDye 800CW | LI-COR Bioscience | 926-32210 | |
| 山羊抗小鼠IgG IRDye 680RD | LI-COR Bioscience | 926-68072 | |
| 病毒生产 | pAAV-YFP-miRE载体 | -- | -- |
| pLenti-EF1a载体 | -- | -- | |
| pAAV-鸡β-肌动蛋白启动子载体 | -- | -- | |
| psPAX2包装质粒 | -- | -- | |
| pMD2.G包膜质粒 | -- | -- | |
| Lenti-X浓缩液 | Clontech | 631231 | |
| TransIT-293转染试剂 | Mirus Bio | -- | |
| 细胞培养 | NB-B27培养基 | Invitrogen | -- |
| Neurobasal plus培养基 | Invitrogen | -- | |
| B27添加剂 | Invitrogen | -- | |
| 谷氨酰胺添加剂 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 动物实验 | AAV8病毒 | -- | -- |
| 组织制备 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 生化分析 | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
| tau ELISA试剂盒 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | 4-12% Bis-Tris凝胶 | Invitrogen | -- |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | 1620145 | |
| Odyssey CLx红外成像系统 | LI-COR | -- | |
| 免疫荧光 | Hoechst染料 | -- | -- |
| 显微成像 | Cytation5细胞成像微孔板检测仪 | BioTek | -- |
| 滑动切片机 | Leica | SM2010 R | |
| 荧光显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 数据分析 | GraphPad Prism 9.0软件 | GraphPad Software | -- |
| 图像分析 | Image Studio软件5.2版 | LI-COR Biosciences | -- |
| Fiji软件 | -- | -- | |
| BD FACSDiva软件 | BD Biosciences | -- | |
| ZEN显微成像软件 | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TYK2敲低/抑制对tau水平的影响 | 细胞类型、TYK2敲低方式(shRNA序列、抑制剂浓度)、处理时间、tau检测方法 阅读提示:Methods: Cell culture, transfection, infection and drug treatment; Extended Data Fig. 1 |
| TYK2磷酸化Tyr29验证 | 细胞系、TYK2和tau表达质粒、突变位点(Y29F)、intrabody(HJ8.5)、检测抗体 阅读提示:Methods: Immunoprecipitation, IB analysis; Fig. 2 |
| Tyr29磷酸化对tau稳定性的影响 | 原代神经元培养条件、DOX浓度和处理时间、时间点、TYK2表达方式 阅读提示:Methods: Cell culture, transfection, infection and drug treatment; Fig. 2g-j |
| 自噬机制验证 | 细胞类型、自噬/蛋白酶体抑制剂浓度和处理时间、tau泛素化检测方法 阅读提示:Methods: Cell culture, transfection, infection and drug treatment; Fig. 3 |
| TYK2对tau聚集的影响 | 细胞模型(tau-YFP或FRET生物传感器)、tau种子来源和浓度、TYK2/FYN表达、TYK2抑制剂浓度、检测方法 阅读提示:Methods: In vitro tau aggregation assay in a cellular model; Fig. 5 |
| 体内验证 | 小鼠品系、AAV8注射剂量、注射时间点、观察时间点、tau病理检测方法(如PHF1) 阅读提示:Methods: ICV injection of AAV at postnatal day 0; Fig. 7 and 8 |
| 人类样本分析 | AD和对照样本来源、脑区、样本量、TYK2和PHF1检测方法 阅读提示:Methods: Human tissue sample preparation and IB analysis; Fig. 4 |